海赛克2500システムの鍵となる手法

エクソーム、ターゲットリシーケンス、全トランスクリプトームおよび从头シーケンス、エピジェネティックな制御など

海赛克2500のアプリケーションと手法

エクソームシーケンスでは、全ゲノムシーケンスに代わるコスト効率に優れた方法として、ゲノムのタンパク質コーディング領域を解析します。 迅速的ランモードおよび高出力モードの両方が可能な海赛克2500システムは、ランあたりのシーケンス数が5~75エクソーム*という高い柔軟性を備えています。

*75bp x 2のリード長を使用し、ターゲットの80%で100倍カバレッジを想定

遺伝子発現プロファイリング

信使核糖核酸シーケンス(如下)は正確で包括的な発現プロファイルを可能にする、既知・新規の両方の転写物とその存在量を検出します。

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大規模全ゲノムシーケンス

サイズの大きい複雑なゲノム(ヒトや動植物)のシーケンスでは、ゲノム変異を塩基単位で把握して、疾患研究や集団ゲノミクスに情報を提供します。

研究者の声

ヒマワリの育種もゲノミクス時代に突入

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脱氧核糖核酸-タンパク質相互作用解析

クロマチン免疫沈降アッセイとシーケンスを融合し、芯片序列はゲノムワイド遺伝子調節解析のパワフルな手法となります。

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微RNA解析および小RNA解析

微小RNAなどの低分子核糖核酸種を単離およびシーケンスし、遺伝子サイレンシングおよび転写後制御におけるノンコーディング核糖核酸の役割を調べます。

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コーディングトランスクリプトミクス

核糖核酸コーディング領域に特異的なシーケンスキャプチャーを使用し、核糖核酸エクソームの既知・未知の配列を検出します。

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从头シーケンス

高出力、長いリード、およびペアエンドシーケンスを独自に組み合わせた海塞克は、リファレンスゲノムを使わずに種の从头シーケンスを行える強力なツールです。

研究者の声

キーウィゲノムのアセンブリ

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メタゲノム解析

重要な分類学的および機能的情報を得るために、微生物群集全体をシーケンスするメタゲノム解析も実施できます。

研究者の声

ミシシッピ川流域の微生物研究

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シーケンスによるジェノタイピング

シーケンスによるジェノタイピングとは、新たな動植物SNPを発見してジェノタイピング研究を行なうための、低コストな遺伝学的スクリーニング手法です。

研究者の声

ゲノム解析で魚集団の回復と管理を行う

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小規模全ゲノムシーケンス

小規模ゲノムシーケンスでは、公衆衛生、疫学、および疾患研究の目的で微生物やウイルスのゲノムを網羅的に解析します。

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メチル化シーケンス

シーケンスベースの脱氧核糖核酸メチル化解析により、エピジェネティックな研究を高いカバレッジ密度とフレキシビリティーで行います。

研究者の声

転移の謎に挑む

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ターゲット遺伝子パネル

ターゲット遺伝子シーケンスパネルには、特定の関心遺伝子に絞り込んだ既定のプローブセットが含まれています。 固定パネルとカスタムパネルの両方を利用できます。

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16S rRNAシーケンス

培養を必要としない手法により、研究が難しい複雑な微生物または環境から得た細菌を同定および比較します。

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翻訳解析

リボソームプロファイリングは、細胞翻訳プロセスの系統的モニタリングやタンパク質量の予測が可能です。

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ターゲット核糖核酸遺伝子発現解析

ターゲット核糖核酸シーケンス(RNA序列)では、関心のある特定の転写産物を選択して、遺伝子発現の解析および融合遺伝子の同定に使用します。

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アンプリコンシーケンス

聚合酶链反应アンプリコンの超ディープシーケンスはコスト効率が高く、1.つのアッセイで最大数百ものターゲットゲノム領域を解析できます。

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細胞遺伝学

次世代シーケンスは、染色体変異を塩基単位でゲノムワイドに検出し、アレイを使用した細胞遺伝学的解析を補完します。

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集団研究

頑強かつ安全で拡張性の高い下比奥临床と下一代研究製品のプラットフォームでは、集団シーケンスアプリケーションのための大規模なゲノムデータの集約と解釈を行えます。

研究者の声

シーケンス能力のめざましい発展を目の当たりにして

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サンプル品質管理

シーケンスライブラリーを大規模なランで本格的に使用する前にその品質を評価します。または、生物生産研究用の品質管理アプリケーションを実行します。

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イルミナのNGS活用ガイド

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