MiSeqシーケンサーにプリインストールされているMiSeq记者ソフトウェアで,データの二次解析を行えます。このソフトウェアは,リアルタイム解析ソフトウェアによって実行されるシーケンス中に装置で生成されるベースコールを処理します。
リアルタイム解析が完了すると,MiSeq记者が自動的に起動し,各種ゲノムおよびサンプルのアライメント,構造多型,およびコンティグアセンブリーの情報が作成されます。サンプルシートで指定されているワークフローに基づいて解析が実行されます。
MiSeq记者は,一次および二次解析データと各サンプルのクオリティおよびカバレッジに関する情報を,シンプルかつ直感的なグラフ形式で表示します。
ほとんどのワークフローでは,アライメントを実行するためにリファレンスゲノムが必要です。MiSeq记者では,複数のプリインストール済みデータベースおよびゲノムを利用できます。
データベース:ヒトmiRbase,ヒトdbSNP,およびヒトrefGene
ゲノム:シロイヌナズナ,ウシ(牛)、大腸菌DH10b株,ヒト(智人)建立hg19マウス(亩骶),ラット(鼠形)、黄色ブドウ球菌、酵母(酿酒酵母)。
fasta形式(* .fastaまたは* .fa)で独自のリファレンスゲノムをアップロードすることもできます。
MiSeq记者はWindowsのサービスとして実行され,ウェブブラウザー上に表示されます。このソフトウェアを別のコンピューターにインストールすれば,MiSeqシステムで次のランを実行中にデータを別のコンピューターで解析することができます。
詳しい要件については,MiSeq记者のコンピューター要件のサポートページを参照してください。
MiSeq记者の最近のバージョンに導入された変更点を確認し,最新版をダウンロードしてください。または,MiSeq记者テクニカルサポート情報にアクセスしてください。
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