クラスター形成とシーケンス
| MiSeq试剂盒v2 | MiSeq试剂盒v3 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| リード長 | 36bp×1 | 25个基点×2 | 150bp x 2 | 250bp x 2 | 75个基点×2 | 300个基点x 2 |
| ラン時間* | ～4時間 | ～5.5時間 | ～24時間 | ～39時間 | ～21時間 | ～56時間 |
| 出力 | 540 ~ 610 mb | 750 ~ 850 mb | 4.5～5.1Gb | 7.5 ~ 8.5 gb | 3.3～3.8Gb | 13.2 ~ 15 gb |
| MiSeq试剂盒v2 Micro | MiSeq试剂盒v2 Nano | ||
|---|---|---|---|
| リード長 | 150bp x 2 | 250bp x 2 | 150bp x 2 |
| ラン時間* | ～19時間 | ～28時間 | ～17時間 |
| 出力 | 1.2Gb | 500 mb | 300Mb |
*ラン時間には,デュアルサーフェススキャン対応のMiSeqシステムにおけるクラスター形成,シーケンス,ベースコールまでが含まれます。
パスフィルターリード数**
| MiSeq试剂盒v2 | MiSeq试剂盒v3 | MiSeq试剂盒v2 Micro | MiSeq试剂盒v2 Nano | |
|---|---|---|---|---|
| シングルリード | 1,200万～1,500万 | 2,200万～2,500万 | 400万 | 100万 |
| ペアエンドリード数 | 2,400万～3,000万 | 4,400万～5,000万 | 800万 | 200万 |
** 据付けはイルミナ菲克斯ライブラリーを使用し、サポート内のパスフィルターのクラスター密度（MiSeq v2）試薬キットの場合は865-965k/mm2., MiSeq v3試薬キットの場合は1200 - 1400 k /毫米2.）で実施します。 実際のパフォーマンス項目は、サンプルの種類、クオリティ、そしてパスフィルタークラスターに依存します。
クオリティスコア†
| MiSeq试剂盒v2 | MiSeq试剂盒v3 |
|---|---|
| 36bp x 1の場合、问题30以上の塩基が90%以上 | 75bp x 2の場合、问题30以上の塩基が85%以上 |
| 25bp x 2の場合、问题30以上の塩基が90%以上 | 300bp x 2の場合、问题30以上の塩基が70%以上 |
| 150个基点x 2の場合,Q30以上の塩基が80%以上 | |
| 250bp x 2の場合、问题30以上の塩基が75%以上 |
†クオリティスコア(Qスコア)は,ベースコールにおけるエラー確率の予測指標です。Q30以上の割合はラン全体の平均値を示します。
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主要なテクノロジー
1.塩基合成反応（SBS）テクノロジー
米塞克システムでは、イルミナの実績あるSBSテクノロジーを採用しているため、さまざまなアプリケーションで傑出した高品質かつ高精度なデータが得られます。 SBSでは、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により、伸長している脱氧核糖核酸鎖に取り込まれる塩基を1.塩基単位で検出します。
ペアエンドシーケンステクノロジー
ペアエンドシーケンスでは、脱氧核糖核酸断片の両端をシーケンスできます。 各ペアリード間の距離は既知であるため、この情報をアライメントアルゴリズムで使用してリードをマッピングできます。 このテクノロジーは、シーケンスが困難なゲノムの反復領域間で特に有効です。