每个流动单元的排序输出*
NextSeq 1000和NextSeq 2000
| 流细胞类型 | P1 | P2 | P3† |
|---|---|---|---|
| 1 × 50 bp | 60 Gb | ||
| 2×50bp | 40 Gb | 120 Gb | |
| 2×100bp | 80 Gb | 240 Gb | |
| 2×150bp | 30 Gb | 120 Gb | 360 Gb |
*基于单个流单元的输出规格，使用Illumina PhiX控制库支持集群密度。
†P3试剂可用于NextSeq 2000仅。
读取每个流单元格的通过过滤器
NextSeq 1000和NextSeq 2000
| 流细胞类型 | P1 | P2 | P3* |
|---|---|---|---|
| 单端读 | 100米 | 400米 | 1.2 B |
| 双端读 | 200米 | 800米 | 2.4 B |
* P3试剂仅适用于NextSeq 2000。
质量分数*和运行时间†
NextSeq 1000和NextSeq 2000
| 流细胞类型 | P1 | P2 | P3‡ |
|---|---|---|---|
| 质量分数 | |||
| 1 × 50 bp | ≥ 90%的碱基在1×50 bp时高于Q30 | ||
| 2×50bp | 2 × 50 bp时，Q30碱基含量高于Q30的碱基≥90% | ||
| 2×100bp | 在2 × 100 bp处，碱基含量高于Q30≥85% | ||
| 2×150bp | 在2 × 150 bp处，碱基含量高于Q30≥85% | ||
| 运行时 | |||
| 1 × 50 bp | 约11小时 | ||
| 2×50bp | ~ 13小时 | 约19小时 | |
| 2×100bp | 约21小时 | 约33小时 | |
| 2×150bp | 约19小时 | ~ 29日人力资源 | ~ 48小时 |
*质量分数（Q分数）是对基本呼叫中错误概率的预测。在整个运行过程中，对大于Q30的基准百分比进行平均。质量分数基于使用Illumina PhiX控制库在NextSeq 1000和2000系统上运行的NextSeq试剂盒。性能可能因库类型和质量、插入大小、加载浓度和其他实验因素而异。
†运行时包括NextSeq 1000或NextSeq 2000系统上的群集生成、排序和基本调用。
-P3试剂仅适用于NextSeq 2000。
关键应用程序的估计样本吞吐量
NextSeq 1000和NextSeq 2000
| 流细胞类型 | P1 | P2 | P3* |
|---|---|---|---|
| 小型全基因组测序(300周期) 130 Mb基因组；>30×覆盖率 |
～7 | ~ 30 | ~90 |
| 全外显子组测序（200个周期） 50×平均目标覆盖率;90%的目标覆盖率为20倍 |
~ 4 | ~ 16 | ~ 48 |
| 单细胞RNA序列（100个周期）† 4k cell, 10k-50k read /cell |
~2-10 | ~ 6-30 | |
| miRNA-Seq或小RNA分析(50个周期) 11M读数/样本 |
~108 |
* P3试剂仅适用于NextSeq 2000。
†推荐的单细胞RNA-Seq测序深度将在很大程度上取决于样品类型和实验目的，将需要为每个研究进行优化。
2000年1000年NextSeqおよびNextSeqシステム
仕様
装置の構成
- DRAGEN看到你FPGAによる二次解析機能を搭載した自己完結型のドライ装置
装置コントロールコンピューター
- 本体:2 uマイクロサーバー搭載
- メモリー:288 GB
- ハードドライブ： 3.8 TB SSD
- オペレーティングシステム:Linux CentOS 7.6
動作環境
- 温度：15℃～30℃
- 湿度：20%～80%、結露なきこと
- 高度:0メートル~ 2000メートル
- 屋内で使用のこと
レーザー
- 波長：449nm、523nm、820nm
- 安全性:クラス1レーザー製品
寸法
- 幅×奥行×高さ：60厘米×65厘米×60厘米
- 重量:141公斤
梱包寸法
- 幅×奥行×高さ:92 cm×120厘米×118厘米
- 梱包重量：232公斤
電源要件
- 装置入力電圧：100VAC～240VAC
- 装置入力周波数：50/60赫兹
ネットワーク接続の帯域幅
- 内部ネットワークでのアップロードの場合:200 Mb / s /装置
- BaseSpace序列中心へのアップロードの場合:200 Mb / s /装置
- 装置稼働データのアップロードの場合:5 Mb / s /装置
製品安全性および準拠
- NRTL認証IEC
- 61010 - 1 CEマーク取得
- FCC/IC認証
スペックシートを見る
2000年1000年NextSeqおよびNextSeqシステム
カートリッジ
使いやすいカートリッジベースのプラットフォーム
NextSeq 1000および下一季度2000シーケンスシステムのカートリッジは、試薬、流路系、廃液ホルダーが一体化されています。そのため、ライブラリーのローディングと装置の操作は簡単で、まず試薬カートリッジを融解してから、フローセルをカートリッジに挿入し、ライブラリーをカートリッジにローディングします。あとはそのカートリッジを装置にセットするだけです。
2000年1000年NextSeqおよびNextSeqシステム
フローセル
増強された出力性能
この高密度のフローセルを最大限に活用するため、NextSeq 1000および下一季度2000シーケンスシステムにはまったく新しい超高解像度の光学システムが搭載されています。そのため、従来のベンチトップ型システムより解像度と感度の高い非常に精確なイメージングデータが得られます。この小型化により、NextSeq 550システムと同レベルの高いデータ品質基準を維持したまま、さまざまな出力量に対応できる適応性が生まれました。
2000年1000年NextSeqおよびNextSeqシステム
フローセル
増強された出力性能
この高密度のフローセルを最大限に活用するため,NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステムにはまったく新しい超高解像度の光学システムが搭載されています。そのため,従来のベンチトップ型システムより解像度と感度が高い非常に精確なイメージングデータが得られます。この小型化により,NextSeq 550システムと同レベルの高いデータ品質基準を維持したまま,さまざまな出力量に対応できる適応性が生まれました。