550年NextSeqシステムシーケンスパフォーマンス
| 550年NextSeqシステム高出力キット* | 550年NextSeqシステム中出力キット* | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| リード長 | ラン時間__ | 出力 | リード長 | ラン時間__ | 出力 |
| 150个基点x 2 | 29時間 | 100 ~ 120 gb | 150个基点x 2 | 26時間 | 32.5 ~ 39 gb |
| 75个基点×2 | 18時間 | 50 ~ 60 gb | 75个基点×2 | 15時間 | 16.25 ~ 19.5 gb |
| 75个基点×1 | 11時間 | 25 ~ 30 gb | |||
*据付時の仕様は,イルミナPhiXコントロールライブラリーを使い,サポート範囲内でのクラスター密度(129 ~ 165 k / mm²パスフィルタークラスター)を基にしています。実際のパフォーマンスは,サンプルの種類,クオリティ,そしてパスフィルタークラスターに依存します。500年すべてのNextSeqキットはペアエンドに対応しています。
†ラン時間には,デュアルサーフェススキャン対応のNextSeq 500システムにおけるクラスター形成,シーケンス,ベースコールまでが含まれます。
パスフィルターリード数
| 550年NextSeqシステム高出力キット | 550年NextSeqシステム中出力キット | |
|---|---|---|
| シングルリード | 最大4億 | 最大1億3000万 |
| ペアエンドリード数 | 最大8億 | 最大2億6000万 |
クオリティスコア组合
| 550年NextSeqシステム高出力キット | 550年NextSeqシステム中出力キット |
|---|---|
| 150个基点x 2の場合,Q30以上の塩基が75%以上 | 150个基点x 2の場合,Q30以上の塩基が75%以上 |
| 75个基点x 2の場合,Q30以上の塩基が80%以上 | 75个基点x 2の場合,Q30以上の塩基が80%以上 |
| 75个基点x 1の場合,Q30以上の塩基が80%以上 |
组合クオリティスコア(Qスコア)は,ベースコールにおけるエラー確率の予測指標です。Q30以上の割合はラン全体の平均値を示します。
主要アプリケーションの予想サンプルスループット
| 550年NextSeqシステム高出力キット | 550年NextSeqシステム中出力キット |
|---|---|
| 1ヒト全ゲノム | 3エクソーム |
| 12エクソーム | 12濃縮パネル |
| 16トランスクリプトーム | 96年アンプリコンパネル |
NextSeq 550系统阵列扫描参数
| 数组 | 每个阵列扫描时间 | 每个样品扫描时间 |
|---|---|---|
| 英飞纳姆MethylationEPIC BeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
| 英飞纳姆cytosnp - 850 k BeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
| HumanCytoSNP-12 BeadChip | 40分钟 | 3.3分钟 |
| 英飞纳姆HumanKaryomap-12 BeadChip | 40分钟 | 3.3分钟 |
550年NextSeqシステムデータシート
柔軟性が高く,高速かつハイスループットのベンチトップ型シーケンサーにより,イルミナSBSテクノロジーの精度を活かした全ゲノム,トランスクリプトーム,およびターゲットリシーケンスアプリケーションを実行できます。
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主要なテクノロジー
1塩基合成反応テクノロジー
NextSeqシリーズでは,イルミナの実績ある1塩基合成反応(SBS)テクノロジーを採用しているため,さまざまなアプリケーションで傑出した高品質かつ高精度なデータが得られます。SBSでは,蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により,伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出します。
イルミナのSBSの原理についてはこちら