关键应用和方法
全基因组测序(WGS)是分析基因组最全面的方法。测序成本的迅速下降和产生大量数据的能力使WGS成为任何物种(包括人类、牲畜、植物和与疾病相关的微生物)基因组学研究的强大工具。使用NovaSeq系统，您可以使用单个S1流细胞对肿瘤-正常配对或种系组合进行测序，或使用双S4流细胞每次测序多达48个基因组。
准备
3 - 5小时
Illumina无DNA pcr Prep
一个高性能、快速和集成的工作流，适用于人类全基因组测序或肿瘤正常测序等敏感应用。
Illumina公司DNA预科
从人类全基因组测序到扩增子、质粒和微生物物种，一个快速、集成的工作流程。
BaseSpace清晰LIMS
一个实验室信息管理系统，帮助实验室跟踪样品和优化工作流程。
分析
< 3小时
DRAGEN胚线管道(BSSH或DRAGEN服务器)
DRAGEN生殖系管道v3对齐并可选地调用FASTQ文件，输出BAM、VCF或两者。
DRAGEN体细胞管道(在BSSH或在DRAGEN服务器上)
DRAGEN体细胞管道对齐和变体调用肿瘤专用或肿瘤/正常FASTQ文件，输出BAM(s)和VCF。
全外显子组测序(WES)可以在广泛的应用中有效地识别编码变异，包括群体遗传学、遗传疾病和癌症研究。
WES占基因组的比例不到2%，是WGS的一种成本效益高的替代方案。使用NovaSeq系统，可以在单个通道中使用S1对20个外显子进行测序，或使用双S2流单元对200个外显子进行测序。
准备
2.5天/6小时动手操作
TruSeq DNA文库浓缩准备
低成本的外显子组测序解决方案，提供卓越的目标覆盖率。该工作流程也与独特的双索引试剂盒兼容，外显子组面板可从集成DNA技术(IDT)。
BaseSpace清晰LIMS
一个实验室信息管理系统，帮助实验室跟踪样品和优化工作流程。
Illumina DNA富集准备
此工具包使用快速、用户友好的工作流。珠上标记化学与简化的单一杂交协议相结合，以减少总工作时间。
总RNA测序(RNA- seq)允许研究人员在单一分析中检测已知和新的特征。这种方法可以在不受先验知识限制的情况下检测转录本异构体、基因融合、单核苷酸变异、等位基因特异性表达等特征。
检测正常或低质量样本中的编码和多种形式的非编码RNA。使用NovaSeq系统，您可以在SP流动细胞的单个通道上对多达8个转录组进行测序，或在双S2流动细胞中对多达164个转录组进行测序。
NovaSeq 6000系统工作流程简介
加入高级实验室经理Brian Steffy和测序系统经理David Miller，了解NovaSeq系统的流线工作流程。yobet亚洲亲眼看到为什么这个系统是我们最先进的高通量测序仪。
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更多应用和方法
目标富集
使用序列特异性杂交分析感兴趣的基因组区域。
编码转录组分析
利用RNA编码区域的序列特异性捕获，检测编码转录组的已知和新特征。
有针对性的DNA测序
定向重测序关注的是时间、费用和仅对研究兴趣的基因子集或基因组区域进行测序的分析。
甲基化测序
通过基于测序的DNA甲基化分析，以高覆盖密度和灵活性增强表观遗传研究。
mRNA-Seq基因表达谱分析
mRNA测序(mRNA- seq)检测已知和新的转录本，并测量转录本的丰度，以准确、全面的表达谱。
从头测序
从头测序是指在没有参考序列的情况下对一个新的基因组进行测序。NGS能够快速、准确地描述任何物种。
用ChIP-Seq分析DNA与蛋白质的相互作用
ChIP- seq是染色质免疫沉淀(ChIP)和测序相结合的一种强大的基因调控全基因组调查方法。
人口研究
强大、安全和可扩展的平台，用于聚合和解释大规模基因组数据，用于人口测序应用。
宏基因组
在一个复杂的样品中全面取样生物的基因，以评估细菌多样性和检测不可培养的微生物。
单细胞RNA序列
通过分析转录组来评估复杂组织中单个细胞的个体贡献。
ctDNA测序
NGS提供了癌症研究人员检测血液中低水平ctDNA所需的灵敏度和特异性。
RNA药物反应生物标志物发现
了解如何利用RNA序列发现和分析基于RNA的药物反应生物标记物。访问旨在帮助新用户采用此应用程序的资源。
Illumina公司方法指南
获取所需的信息——从BeadChips到基因组、转录组或表观基因组研究的文库准备，再到测序器选择、分析和支持——所有这些都在一个地方。为您的实验室选择最好的工具与我们全面的指南专门为研究应用设计。
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