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NovaSeq系统规范

巨大的发现能力带来更深刻的见解

参见NovaSeq 6000系统的规格，这是我们最强大的高通量测序仪器

每个流动单元的排序输出*

NovaSeq 6000系统
流细胞类型 SP S1 S2 S4
1×35bp N/A N/A N/A 280 - 350 Gb
2×50bp 65 - 80 Gb 134–167 Gb 333–417 Gb N/A
2×100bp 134–167 Gb 266–333 Gb 667–833 Gb 1600 - 2000 Gb
2×150bp 200 - 250 Gb 400–500 Gb 1000–1250 Gb 2400 - 3000 Gb
2 x 250 bp 325 - 400 Gb N/A N/A N/A

*基于支持群集密度的Illumina PhiX控制库的规范。

读取每个流单元格的通过过滤器

NovaSeq 6000系统
流细胞类型 SP S1 S2 S4
单端读 650-800米 1.3-1.6 B 3.3 B–4.1 B 8-10 B
双端读 1.3-1.6 B 2.6–3.2 B 6.6 - -8.2 B 16 - 20 B

质量分数*和运行时间†

NovaSeq 6000系统
流细胞类型
v1.5试剂盒		 SP S1 S2 S4
质量分数
1×35bp 在1 × 35 bp处，碱基高于Q30的比例≥90%
2×50bp 2 × 50 bp时，Q30碱基含量高于Q30的碱基≥90%
2×100bp 在2 × 100 bp处，碱基含量高于Q30≥85%
2×150bp 在2 × 150 bp处，碱基含量高于Q30≥85%
2×250 bp ≥ 在2×250 bp时，75%的碱基高于Q30
运行时
1×35bp N/A N/A N/A 约14小时
2×50bp 约13小时 约13小时 ~ 16小时 N/A
2×100bp 约19小时 约19小时 约25小时 约36小时
2×150bp 约25小时 约25小时 约36小时 约44小时
2×250 bp ~ 38小时 N/A N/A N/A
流细胞类型
v1.0试剂盒		 SP S1 S2 S4
质量分数
2×50bp ≥ 85%的碱基在2×50 bp时高于Q30
2×100bp 2 × 100 bp时碱基高于Q30≥80%
2×150bp ≥ 在2×150 bp时，75%的碱基高于Q30
2×250 bp ≥ 在2×250 bp时，75%的碱基高于Q30
运行时
2×50bp 约13小时 约13小时 ~ 16小时 ~ N /
2×100bp 约19小时 约19小时 约25小时 约36小时
2×150bp 约25小时 约25小时 约36小时 约44小时
2×250 bp ~ 38小时 N/A N/A N/A

*质量分数(Q-score)是对基础呼叫出错概率的预测。> Q30的上垒率在整个比赛中都是平均的。质量评分是基于NovaSeq Reagent Kits，在NovaSeq 6000系统上运行，使用Illumina PhiX控制库。性能可能因库类型和质量、插入大小、加载浓度和其他实验因素而异。
†运行时包括群集生成、排序和基本调用。运行时间基于运行2个相同类型的流动单元；启动两个不同的流动单元将影响运行时间。

关键应用程序的估计样本吞吐量*

NovaSeq 6000系统
流细胞类型 SP S1 S2 S4
每次运行的人类基因组 ~4 ~8 ~20 ~48
每次运行的外显子组 ~40 ~80 ~200 ~500
每次运行的成绩单 ~32 ~64 ~164 ~400

*所有样本吞吐量均为估计值，并基于双流单元运行。人类基因组假设每个样本的数据大于120 Gb，以实现30×基因组覆盖率。外显子组假设为~8Gb/100×。转录组假设≥ 2500万美元。吞吐量可能因使用的库准备工具包而异。

NovaSeq规范

仪器配置
  • 计算机和触摸屏显示器
  • 安装设置和附件
  • 数据收集和分析软件
仪表控制计算机
  • 基本单元：Portwell WADE-8022，配备英特尔i7 4700EQ CPU
  • 内存：2×8 GB DDR3L SODIMM
  • 硬盘：无
  • 固态硬盘:256gb mSATA
  • 操作系统:Windows 10
  • 注：计算机配置将定期升级；有关当前配置，请与本地帐户经理联系
操作环境
  • 温度:19°C-25°C(22°C±3°C)， <2°C变化每小时
  • 湿度:相对湿度20%-80%，不凝结
  • 海拔：低于2000米（6500英尺）
  • 通风:最大8530 BTU/h，平均6000 BTU/h
  • 仅供室内使用
激光
  • 波长:532 nm, 660 nm, 780 nm, 790 nm
尺寸
  • 宽×深×高：80.0厘米（31.5英寸）×94.5厘米（37.2英寸）×165.6厘米（65.2英寸），带监视器
  • 重量：481千克（1059磅），包括泄漏托盘3.5千克（7.8磅），键盘和鼠标0.9千克（2磅），板条箱重量：628千克（1385磅）
板条箱尺寸
  • 板条箱宽×深×高：92厘米×120厘米×118厘米
  • 板条箱重量：232公斤
功率要求
  • 200–240 VAC 50/60Hz，16A，单相，2500 W
  • Illumina提供特定地区的不间断电源供应
网络连接
  • 专用1gb连接仪器和数据管理系统。直接连接或通过网络连接
网络连接的带宽
  • 200 Mb/s/仪器用于内部网络上传
  • 200 Mb/s/仪器用于BaseSpace序列集线器上载
  • 5 Mb/s/仪表用于仪表运行数据上传
下载PDF格式规范
novaseq 6000系统图纸

关键技术

合成技术测序

NovaSeq 6000系统利用经验证的Illumina合成测序（SBS）技术提供准确的数据和稳健的性能。SBS化学使用荧光标记的可逆终止子核苷酸。这种方法检测单个碱基，因为它们被整合到不断增长的DNA链中，并行读取数十亿个序列。

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看看SBS是如何工作的

图案化流动池技术

NovaSeq 6000系统集成了图形流池技术，为广泛的测序应用产生了前所未有的吞吐量水平。有图案的流动细胞在固定的位置包含数十亿个纳米孔，这种设计提供了排列簇的均匀间隔。这大大增加了测序读取和系统的总输出。

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参见模式流细胞的作用

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