蛋白质分析模块
- 免疫タンパク質アッセ邮箱を解析
蛋白质分析模块では，BeadXpress读者でスキャンしたカルボキシル基ビズの解析が行えます。標準曲線を用いた検体の濃度検出，あるいはサンプル間で異なる発現を示すタンパク質の解析が行えます。また，タンパク質レベルをmRNA発現量と比較することも場合によっていは可能です。結果はラインプロット,ヒストグラム,樹形図,ボックスプロット,サンプルの表,遺伝子クラスターなどで表示でいます。
蛋白质分析模块の特長
- タンパク質レベルをmRNA発現と比較
- ラインプロット,ヒストグラム,樹形図,ボックスプロット,サンプルの表,遺伝子クラスターなどで結果を表示
genome estudioソフトウェアの紹介
GenomeStudioソフトウェアは,イルミナのマイクロアレイから得られたデータを視覚化して解析できます。このパワフルなソフトウェアは，アレ。GenomeStudioは,使いやすいインターフェースと最適化されたパフォーマンスにより,データから意味のある結果を導き出すツールとしてご利用いただけます。
柔軟性のあるソリュション
genome estudioは，7 .のアプリケションモジュルにより構成されています。ゲノムや遺伝子発現,遺伝子制御の包括的な知識を得るために,異なるアプリケーションからのデータを比較することができます。また,新たなアプリケーションを使用の際には,追加でアプリケーションモジュールを搭載すれば対応できる柔軟性と簡便性を持ち合わせています。
イルミナのプラットフォームから得られたデータは,数多くのサードパーティツールでも下流解析ができます。IlluminaConnectのパートナーから提供されているこうしたツールは,イルミナGenomeStudioのモジュール内でプラグインを行うことにより,一連の解析に使用できます。genome estudioソフトウェアをどのように使用してジェノタイピング、遺伝子発現、およびメチル化アレイのデータを解析するのか、またその他のアプリケーションについて、詳細をご確認ください。
genome estudioソフトウェアモジュル
基因分型模块
- esnルミナのBeadChipからSNPおよびCNVを解析
- サンプルのアウトラ邮箱ヤ邮箱の検出
genomic estudioでは，ジェノタプの視覚化は基因图で行います。データポイントはコールごとに色で確認できます(AA =赤,AB =紫,BB =青)。各サンプル(ドット)ごとにジェノタイプがコールされますが,これはシグナル強度(标准R)およびアリル頻度(标准θ)を使い,クラスターの位置と相対的に計算されます。
模块型GenomeStudioでは,英飞纳姆およびGoldenGateで得られたジェノタイピングアッセイの解析が可能です。このモジュールでは,ジェノタイピングデータの補正,クラスター作成,強度データの解析,LOHの計算,コピー数多型(CNV)解析が実施できます。英飞纳姆LIMSサーバーと統合されている場合,データのアクセスおよびプロジェクトの管理がGenomeStudioから行えます。
他のモジュールと同様,GenomeStudioでは表からIllumina公司基因组观众およびIllumina公司染色体浏览器にて,視覚的に結果を表示することができます。
基因分型模块の特長
- 数百万のマカを対象に，snpおよびcnvを解析
- 日志R比およびBアリル頻度からコピ数解析
- ジェノタプのコル，補正，およびクラスタ作成を行い，snp統計を計算
- ジェノタプのデタを様々なサ
- 染色体ヒトマップを作成しコピ数変化を複数サンプルで確認
- 同一プロジェクトにおいて，二
基因表达模块
- 遺伝子発現差の解析
- microRNA発現のプロファリング
- mRNAおよびmicroRNAの結果を統合
このヒトマップでは，タゲットidと発現差を示しています。こうしたヒートマップツールを使うことで,たくさんのデータの視覚化と解析を容易に実施することができます。
基因表达模块では,直接HybアッセイおよびDASLアッセイのデータを解析することができます。このモジュールではmRNAとmicroRNAを視覚化することができ,ヒストグラム,樹形図,ボックスプロット,散布図などを表示させることができます。GenomeStudioでのサンプル,グループ,グループセットで区分けをすることにより,シンプルなデータ管理が可能です。
他のモジュールと同様,GenomeStudioでは表からIllumina公司基因组观众およびIllumina公司染色体浏览器にて,視覚的に結果を表示することができます。
基因表达模块の特長
- 遺伝子レベルで発現差の解析
- ラインプロット,ヒストグラム,樹形図,ボックスプロット,サンプルの表,遺伝子クラスターなどで結果を表示
- サンプル，グルプ，グルタ管理
- 発現差の同定，t検定およびanova検定を実施
- dnaメチル化デタと遺伝子発現デタを統合表示
- eQTL解析のためのサドパティル用にエクスポト
甲基化模块
- シトシンメチル化を1塩基の解像度で検出
- 全ゲノムを対象に，メチル化パタンを検出
甲基化模块では,英飞纳姆およびGoldenGateからのメチル化データを解析できます。このモジュールでは,メチル化のレベルをベータ値として計算し,CpGサイトにおける異なる実験群のメチル化状態を比較することがでいます。結果はIllumina基因组浏览器およびIllumina染色体浏览器で表示できます。
1サイトごとの解像度は,ラインプロット,バーグラフ,散布図,ヒストグラム,樹形図,ボックスプロット,そしてヒートマップで表示させることができます。このモジュールはDNAメチル化の状態(ベータ値)と,遺伝子発現解析の状態(P値)を一緒に視覚化し,関連性を調べることができます。
甲基化模块の特長
- CpGレベルでのメチル化を計算し視覚化
- 二の実験群のメチル化状態を解析
- ラインプロット,バーグラフ,散布図,ヒストグラム,樹形図,ボックスプロット,そしてヒートマップで結果を表示
- dnaメチル化デタと遺伝子発現デタを統合表示
- Illumina Genome Viewerで全ゲノムデタとベタ値の視覚化
- Illumina染色体浏览器で複数サンプルのベタ値の視覚化
多倍体聚类模块
- 倍数体生物のジェノタ邮箱ピングデ邮箱タを解析
多倍体集群模块は小麦やジャガイモなどの倍数体生物のジェノタイピングデータを解析することができます。本モジュールでは,二つの有名な標準的濃度クラスタリングアルゴリズム:订购点识别聚类结构(光学)および基于密度的空间聚类的应用程序与噪声(DBSCAN)を使用し,サンプルを意味のあるクラスターに割り当てます。
倍数体種の遺伝子型の割り当ては，生物の集団および生物学に大きく依存します。このため，モジュ，ジェノタ。
多倍体聚类模块の特長
- 必要なだけクラスタをコルするため，6倍体または8倍体の研究が可能
- 倍数体生物のクラスタリングを自動化
- ジェノタイプコールを行うため,クラスターデータをサードパーティアプリケーションにエクスポート
genome estudioソフトウェアへのアクセス
適切なgenome estudioモジュルへのアクセスが装置購入時に。追加のユザおよびアプリケションのラ。
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