更容易分析甲基化阵列数据

甲基化阵列数据分析技巧

在第二届Infinium HumanMethylation450阵列研讨会上,聆听专家们介绍他们的甲基化阵列数据分析方法。

来自甲基化阵列专家的提示
Illumina 450K珠芯片阵列:一种新的芯片分析甲基化管道(ChAMP)

UCL癌症研究所的Tiffany Morris博士讨论了新ChAMP 450K阵列分析管道的功能,该管道将分析工具组合在一个易于使用的R软件包中。

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Illumina 450K珠芯片阵列:一种新的芯片分析甲基化管道(ChAMP)
利用隐藏信息校正背景荧光

南加州大学凯克医学院的Kim Siegmund博士讨论了Infinium人类甲基化450K生物芯片数据的背景校正方法。

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利用隐藏信息校正背景荧光
Marmal Aid:用于Illumina 450K数据元分析的新生物信息学工具

Barts和伦敦医学和牙科学院的Robert Lowe博士讨论了Marmal Aid的开发,这是一种生物信息学工具,能够分析使用Infinium Humanmethylization450K BeadChip识别的差异甲基化探针。

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Marmal Aid:用于Illumina 450K数据元分析的新生物信息学工具
数据驱动的Illumina 450K预处理方法

来自伦敦国王学院的Chloe Wong博士讨论了她团队的西瓜R软件包的开发,该软件包用于分析Infinium人类甲基化450K晶片数据。

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数据驱动的Illumina 450K预处理方法
Illumina HM450 BeadChips分析管线的评估

卡罗琳斯卡研究所的弗朗西斯科·马拉比塔博士讨论了他最近的工作,他对Infinium Humanmethylization450K晶片数据的不同分析管道进行了系统比较。

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Illumina HM450 BeadChips分析管线的评估
使用Minfi鉴定差异甲基化区域与450K阵列

约翰·霍普金斯大学的Kasper Daniel Hansen博士讨论了Minfi——一种用于分析英飞凌人体甲基化450K生物芯片数据的生物导体包。

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使用Minfi鉴定差异甲基化区域与450K阵列
分析和解释DNA甲基化数据

来自Ce-M-M分子医学研究中心的Christoph Bock博士,讨论了表观遗传学研究设计,研究DNA甲基化的各种方法,甲基化数据的生物信息学分析和解释,以及一些相关应用。

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分析和解释DNA甲基化数据
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