ChIP-Seq是什么?
通过将染色质免疫沉淀（芯片）测定与测序结合，芯片测序（芯片-SEQ）是用于鉴定用于转录因子和其他蛋白质的基因组DNA结合位点的强大方法。在切屑方案之后，使用特异性抗体免疫沉淀DNA结合的蛋白质。然后将结合的DNA共沉淀，纯化和测序。
下一代测序（NGS）对芯片的应用揭示了对在各种疾病和生物途径中发挥作用的基因调节事件的见解，例如显影和癌症进展。CHIP-SEQ能够彻底检查蛋白质和核酸之间的相互作用对基因组的规模。
芯片SEQ的优点
与阵列和用于研究表观蛋白酶的其他方法不同，这本质上是偏置的，因为它们需要衍生自已知序列的探针，芯片SEQ不需要先验知识。CHIP-SEQ通过大规模平行测序提供全基因组分析，在多个样品上产生数百万计数，以实现高效，精确，对表观遗传模式的调查。额外的优点包括：
- 在任何生物体的整个基因组上捕获DNA靶或组蛋白修饰的转录因子或组蛋白修饰
- 定义转录因子绑定站点
- 揭示基因调节网络与RNA测序和甲基化分析组合
- 提供与各种输入DNA样品的兼容性
芯片SEQ如何工作？
ChIP-Seq可识别dna相关蛋白的结合位点，并可用于绘制特定蛋白的整体结合位点。ChIP-Seq通常从dna -蛋白质复合物的交联开始。然后，样品被分割和处理外切酶来修剪未结合的寡核苷酸。蛋白质特异性抗体用于免疫沉淀dna -蛋白质复合物。提取DNA并进行测序，得到高分辨率的蛋白质结合位点序列。
推荐芯片SEQ工作流程
互动的分析报告
综合ChIP-Seq工作流
Illumina通过合成（SBS）化学是最广泛采用的NGS技术，产生了大约90％的全局测序数据。*
除了行业领先的数据质量，Illumina还提供集成的工作流程，简化测序，从库准备到数据分析。
点击下面查看每个工作流程步骤的产品。
Truseq芯片库准备套件
用于从芯片衍生的DNA制备芯片-SEQ库的简单，经济有效的方法。
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miseq系统
每次运行集中功率对1-6个ChIP-Seq样本进行测序。
NextSeq 2000系统开创性的台式定序器允许您探索各种当前和新兴应用的新发现，具有更高的效率和更少的限制。
Novaseq 6000系统可扩展的吞吐量和灵活性，几乎任何基因组，测序方法，和规模的项目。
BaseSpace序列中心
NGS数据分析和管理的Illumina Genomics计算环境。
BaseSpace关联引擎愈合基因组数据的越来越多的文库，以支持研究人员鉴定疾病机制，药物靶标和生物标志物。
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*文件上的数据计算。yobet亚洲Illumina，Inc。，2015年