什么是目标富集?
通过定向重测序，将基因组的一个子集或区域分离出来并进行测序。目标富集的工作原理是通过与目标特异性生物素化探针杂交，捕获感兴趣的基因组区域，然后通过磁拉下分离。
Illumina DNA预处理富集是下一代测序(NGS)目标富集解决方案的最新创新。通过结合珠链转座子介导的标记化学和混合捕获目标富集，研究人员可以减少工作流程时间，并产生一个准确、可靠的目标富集重测序方法。
NGS目标富集的好处
杂交为基础的富集是一个有用的策略，以分析特定的遗传变异在一个给定的样本。
目标富集使研究人员能够使用稳健和直接的工作流程可靠地对外显子或大量基因(如> 50个基因)进行测序。它在各种输入类型和数量上提供可靠的结果。用途包括:
- 人类whole-exome测序
- 为癌症和遗传疾病研究预先设计的(固定的)测序面板
- 定制的基因组测序
目标富集与其他重测序策略
基于混合捕获的目标富集让研究人员瞄准与他们特定研究兴趣相关的基因组区域。与PCR或Sanger测序相比，靶向重测序具有更高的发现能力(识别新变异的能力)和更高的突变分辨率。
与基于pcr的扩增子测序相比，基于杂交的富集测序可以针对更高数量的总基因含量，并支持对所有类型的变异进行更全面的分析。更大数量的总基因内容允许对已知和新变种的特征描述发现相关的应用。
目标富集与扩增子测序的优势*
目标浓缩 |
扩增子测序 |
| 较大的基因含量，通常为> 50个基因 | 较小的基因含量，通常小于50个基因 |
| 对所有变体类型进行更全面的分析 | 理想的分析单核苷酸变异和插入/删除(indel) |
| 更全面的方法，但有更长的动手时间和周转时间** | 更实惠，更简单的工作流程 |
*文件数据，Illumina 2018。
**周转时间是文库准备分析时间(DNA到完成文库)。
COVID-19测序解决方案
NGS在传染病监测和爆发模型中具有独特的地位。比较靶富集与其他病原体NGS方法，如猎枪宏基因组学。寻找SARS-CoV2的检测方法，追踪传播途径，研究合并感染，研究病毒进化。
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推荐的目标充实工作流程
用户友好的自动化兼容工作流为研究人员提供快速和灵活的解决方案。珠上标记化学能够支持广泛的DNA输入量，各种样本大小和广泛的应用。
特色传染病目标富集解决方案
呼吸道病毒Oligo小组
高灵敏度检测和表征常见呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2和近期流感毒株，全面、快速的目标富集测序。
呼吸道病原体ID/AMR小组
这种基于ngs的目标富集工作流程针对呼吸道病原体和抗菌素耐药性等位基因，并提供IDbyDNA支持的简化数据分析。
