小全基因组测序简介
小基因组测序(≤ 5 Mb）包括对细菌、病毒或其他微生物的整个基因组进行测序，然后将该序列与已知参考序列进行比较。小型微生物基因组测序可用于公共卫生食品检测、传染病监测、分子流行病学研究和环境宏基因组学。
小基因组测序的优点
- 允许调查单一生物体培养的所有基因
- 将数千个生物体并行排列
- 提供微生物或病毒基因组的综合分析
- 通过提供同源染色体的不同基因信息，支持单体型分析，有助于在微生物或病毒样本中发现新的生物标记物
快速，无培养的微生物分析
与传统方法不同，使用下一代测序(NGS)的小型全基因组测序(WGS)研究不依赖于劳动密集型的克隆步骤。NGS还使生物学家能够通过多路复用同时对数百个生物体进行测序。NGS可以识别低频变异、基因组重排和其他可能被忽略或使用其他方法成本太高而无法识别的基因变化。对于小基因组，DNA库可以在2天内制备、测序和分析。
小型全基因组测序的推荐工作流程
图书馆准备
排序
数据分析
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Illumina NGS在传染病监测和暴发模型中处于独特的地位。比较NGS方法并找到检测和表征SARS-CoV2、追踪传播途径、研究合并感染和调查病毒进化的解决方案。
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全面的小全基因组测序工作流程
Illumina合成测序（SBS）化学是最广泛采用的NGS技术，产生了全球约90%的测序数据*
除了我们业界领先的数据质量，Illumina还提供了简化小基因组测序的集成工作流程，从文库准备到数据分析。
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*数据计算存档。Illumina公司，2015年yobet亚洲