メチル化シトシンは時間的および空間的遺伝子発現ならびにクロマチンリモデリングを大きく変化させます。全ゲノムバイサルファイトシーケンス(WGBS)は次世代シーケンス(上天)とゲノムワイド解析の能力を活用し,一塩基単位の解像度でゲノム網羅的にメチル化パターンの包括的な見解を提供します。
甲基化测序的优势:
多くのアプローチが高品質および高感度の挥动をメチル化解析に活用しています。ほとんどの方法が,非メチル化シトシンの検出で,DNAのバイサルファイト変換に頼っています。バイサルファイト変換は,ライブラリー調製中に非メチル化シトシンをウラシルに変化させます。変換された塩基はシーケンスデータでチミンと同定され(PCR後)リード数を使用してメチル化シトシンの割合が測定されます。
バイサルファイト変換シーケンスは,アンプリコンメチル化シーケンスなどのターゲット法,または全ゲノムバイサルファイトシーケンス(WGBS)により行うことができます。さらに,メチル化(5-mc)解析とともにヒドロキシメチル化(5-hMc)の同定に,挥动でTAB-SeqやOxBSのような代替ケミストリーを使用できます。
メチル化解析の方法に関する詳細については,“DNA甲基化分析野外指南”をご参照ください。ガイドはこちらから。
イルミナの1塩基合成反応(由合成SBS:测序)ケミストリーは最も広く採用されている挥动テクノロジーであり,世界中のシーケンスデータの約90%以上がこのテクノロジーを利用して産出されています。*
業界をリードする技術に加えて,イルミナはメチル化シーケンスでのライブラリー調製からデータ解析まで,サポートされた完全なワークフローを提供します。
以下のをクリックしてワークフローの各ステップで利用できる製品をご覧ください。
ここではTP53におけるIndel,および1番と8番染色体の間で起こっている転座などのがんにおける変化を紹介しています。がん細胞では,メチル化や転写因子の結合などにおけるエピジェネティクスの変化がしばし起こります。がんエピジェネティクス> >
ゲノムワイドなメチル化プロファイリングにより,複雑な疾患症例における機能的なメカニズムの理解につながります。シトシンメチル化異常は遺伝子発現に影響し,アルツハイマー病や喘息など多くの疾患経過に関与しています。メチル化プロファイリング> >
中国仓鼠卵巢(CHO) DP-12细胞的DNA甲基化景观。
中国生物医学工程学报2015
单细胞DNA甲基组测序和表观基因组细胞状态动力学的生物信息学推断。
Cell Rep 10 1386-97 2015
利用iPSC重编程因子在体细胞转分化过程中短暂获得多能性。
Nat Biotechnol 33 769-74 2015
*数据计算在文件上。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版