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RNA外显子捕获测序

RNA外显子捕获测序简介

在不牺牲基因融合发现能力的情况下,实现低成本、准确、敏感的RNA外显子分析,即使是困难的样品。许多RNA外显子组测序方法侧重于确定数量的已知转录本,或者需要昂贵的深度测序。RNA外显子捕获测序通过结合RNA- seq和外显子富集来克服这些挑战。

这种方法只捕获转录组的编码区域,与非外显子组捕获方法相比,允许更高的吞吐量和更低的测序深度。RNA外显子组的序列特异性捕获并不依赖于poly-A尾的存在。这使得RNA外显子捕获测序对于低质量样本或有限起始材料的RNA- seq非常理想。

RNA外显子捕获测序的优势

分离转录组编码区域可在总RNA测序的阅读深度的一小部分实现发现能力的最大化。

  • 高样品吞吐量和成本效率
  • 专注于高价值的内容
  • 从降解样品(包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织)中获得高质量数据
  • 在保持高灵敏度的同时,需要低样本输入(总RNA量仅为10纳克)
NGS转录组分析

Illumina杰出科学家Gary Schroth博士展示了RNA-Seq技术的最新进展。yobet亚洲了解最新的RNA库准备方法如何允许从挑战样本转录组分析,如单细胞或FFPE组织。

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RNA外显子捕获测序工作流程

Illumina sequencing by synthesis (SBS) chemistry是应用最广泛的NGS技术,生成了全球90%以上的测序数据

除了业界领先的数据质量,Illumina还提供了集成的RNA外显子组捕获工作流,简化了从库准备到数据分析和生物学解释的整个过程。

主打产品

NextSeq 1000和2000系统
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基因面板和阵列探测器
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*数据计算存档。Illumina公司,2015年yobet亚洲