门店へようこそ
次世代シーケンサー(上天)は過去に例を見ないほどのスループット,拡張性,およびスピードを兼ね備えており,研究者はこれまで不可能であったレベルの生物学的システムの研究を行うことができます。
今日のゲノム研究の課題は複雑であり,従来のDNAシーケンステクノロジーで提供できる情報量では対応できなくなっています。次世代シーケンサーはそのギャップを埋め,これらの課題に対処するための日常的な研究ツールとなりました。
次世代シーケンステクノロジーのご紹介
次世代シーケンステクノロジーのご紹介では,ゲノム科学の進化,シーケンステクノロジーにおける主な進展,主要な方法,イルミナシーケンスケミストリーの基本などをご説明します。
门店がどのようにお客様の役に立つかをご覧ください
革新的な挥动サンプル調製キットとデータ解析ソリューションにより,幅広いアプリケーションが実施できます。例えば,次世代シーケンサーでは以下が可能になります:
- 迅速な全ゲノムシーケンス
- ターゲット領域にフォーカスしたディープシーケンス
- RNAの新規バリアントや選択的スプライシングの発見や遺伝子発現解析におけるmRNAの正確な定量のためのRNAシーケンス(RNA-Seq)の利用
- ゲノムワイドなDNAメチル化やDNA——タンパク質相互作用などのエピジェネティック因子の解析
- 希少な体細胞バリアントや腫瘍サブクローンなどの研究のためのがんサンプルのシーケンス
- ヒトにおける微生物多様性の研究
利用しやすい全ゲノムシーケンス
ヒトゲノムプロジェクトは,キャピラリー電気泳動を用いたサンガー法を利用して10年の歳月と,30億ドル近くの費用が投入されました。
その一方,次世代シーケンサーは大規模全ゲノムシーケンスをより利用しやすく,より実践的なものにします。
シーケンスサービス
イルミナは,全ゲノムシーケンス解析サービスおよび提携会社が提供する追加サービスをご提供しています。
発現プロファイリングでは,無制限にダイナミックレンジを広げることが可能
门店により,遺伝子発現解析はアナログ技術から配列情報に基づいたデジタル技術になりました。门店は,マイクロアレイの網羅性とqPCRの解像度を用いてRNAの発現量の定量化を可能にします。
マイクロアレイによる遺伝子発現解析では,低シグナル領域でのバックグラウンドノイズの影響と高シグナル領域でのシグナル飽和によるノイズによる影響があります。一方,次世代シーケンサーは個別のデジタルシーケンスのリードカウントを定量するため,実質的に無限のダイナミックレンジが得られます。
ターゲット次世代シーケンスでは解像度が調節可能
门店は高い拡張性があり,特定の実験ニーズに合わせて解像度レベルを調節することができます。
ターゲットシーケンスにより,ゲノムの特定の領域に焦点を合わせた研究が可能になります。複数のサンプルで浅くスキャンをするか,特定の領域に存在する希少なバリアントを見つけるために少数のサンプルで深いシーケンスを実施するかを選択できます。
詳細
イルミナ挥动の機能
イルミナの次世代シーケンサーでは,古典的なダイターミネーターを用いたサンガー法とは根本的に異なるアプローチが用いられています。综合排序(SBS)テクノロジーが利用されており,このテクノロジーではDNA鎖の複製のたびに標識ヌクレオチドの付加を多数同時に追跡します。
次世代シーケンサーでは,サンガー法では想像できないほど情報に富み完全なDNAシーケンスデータを大量に得ることができます。イルミナのシーケンスシステムは,装置の種類および試薬の構成に応じて,1回のランで300キロベースから数テラベースまでの範囲のデータ出力を実現します。
次世代シーケンステクノロジーのご紹介
次世代シーケンステクノロジーのご紹介では,ゲノム科学の進化,シーケンステクノロジーにおける主な進展,主要な方法,イルミナシーケンスケミストリーの基本などをご説明します。
PDFをダウンロードイルミナ挥动の最新技術
最近のイルミナ次世代シーケンサーテクノロジーの飛躍的進歩には以下のようなものがあります:
- 2チャネルSBS:このテクノロジーは,これまでのSBSテクノロジーと同様に高いデータ精度を保ちながら,さらに短時間のシーケンスを実現します。
- 整列化フローセルテクノロジー:このオプションは,幅広いシーケンスアプリケーションのために卓越したレベルのスループットを実現します。
- 最高6テラベース(Tb): 6000年NovaSeqシステムが最長2日間で最高6 Tbの出力をどのように達成するかをご覧ください*。
イルミナシーケンサーの歴史
イルミナのSBSテクノロジーがどのように誕生し,時間をかけて進化してきたかをご覧ください。
次世代シーケンサーをラボに導入する
以下のリソースは,挥动システムの購入を検討している場合に役立つガイダンスとなります。
- 门店システム購入ガイド(PDF)を読んで,購入前に検討すべき事項をご確認ください。
- 门店プラットフォーム比較表はこちら
最適な挥动プラットフォームを見つける
イルミナのインタラクティブなプラットフォーム選択ツールを使ってお客様のニーズに合ったシーケンサーを見つけてください。
门店実験に関する検討事項
以下の情報を確認して,実験計画の作成に役立ててください。
論文集
科学研究の進歩に貢献するイルミナテクノロジーの主な応用例をご紹介
“上天でできること”を網羅した冊子,アプリケーションガイド
ライブラリー調製から解析用シーケンサーの選択まで,お客様に必要な情報がすべて入っています。お客様のラボに最適なツールを選択してください。
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参考
- RNA-Seq:转录组学的革命性工具。Nat牧师麝猫。2009; 10:57 - 63。
- Wilhelm BT, Landry JR. RNA- seq -通过大规模并行RNA测序定量测量表达。方法。2009; 48:249-57。
- Zhao S, feng - leung WP, Bittner A, and Ngo K, Liu X. .PLoS One。16; 2014; 9 (1): e78644。