Covidseq测试（Ruo版）

Illumina Covidseq测试（Ruo版），基于扩增子的NGS测定，包括2019-NCoV引物，旨在检测来自SARS-COV-2病毒的突变并表征RNA，以帮助临床研究实验室识别并跟踪新颖的出现和患病率SARS-COV-2的菌株。

快速、可扩展的SARS-CoV-2检测

Illumina Covidseq测试（Ruo版）可以缩放或向下缩放以适应不同数量的样本。1536至3072个结果可以在Novaseq 6000系统上使用两种SP或S4试剂盒的12小时在12小时内加工，使用NextSeq 2000 P2 V3试剂盒或NextSeq 500/550 / 550DX（在研究模式中）12小时内完成384个结果。成套工具。

工作流和组件

该工作流程包括病毒RNA提取、RNA到cdna转换、PCR、文库制备、测序、分析和报告生成等步骤。关键组件包括高吞吐量的NovaSeq 6000系统或NextSeq 2000系统或NextSeq 500/550/550Dx(研究模式)系统，再加上Illumina COVIDSeq测试(RUO版本)和DRAGEN COVIDSeq测试应用程序(RUO版本)在BaseSpace序列集线器快速分析。

设计及品质控制

Illumina COVIDSeq测试(RUO版本)采用了经过验证的公开可用的ARTIC多重PCR协议的改进版本，结合了经过验证的Illumina测序技术，有98个扩增子用于扩增SARS-CoV-2病毒特异性序列。当检测到+90个扩增子时，COVIDSeq提供一致的序列信息。PCR步骤的63℃退火温度改进了变异分析，提供了对样品中存在的SARS-CoV-2毒株的重要了解，并能够跟踪病毒毒株。

共识序列信息(FASTA文件)可以上传到开放的软件工具中，以分配谱系和注释突变。FASTA文件可以很容易地通过BaseSpace测序中心上传到NCBI和/或GISAID应用程序，以增加方便性。