TruSight癌症
这些专家定义的测序研究小组针对与各种癌症易感性相关的94个基因和284个SNPs。阅读更多…
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与癌症基因组学专家合作开发的这些预先设计好的、随时可用的寡聚体使研究人员能够对以前与癌症易感性有关的各种基因和单核苷酸多态性(SNPs)进行测序。
TruSight癌症包括与常见(如乳腺癌、结直肠癌)和罕见癌症相关的基因。此外，这一组包括284个通过全基因组关联研究(GWAS)发现与癌症相关的snp。内容选择以专家对科学文献等优质资源的整理为基础。
TruSight Cancer测序面板提供定制的oligos靶向感兴趣的识别区域。为四次浓缩反应提供足够的产物。Cancer巨蟹座Trusight快速捕获．
使用TruSight Cancer测序面板制备了6个人类参考样本。这些文库在MiniSeq系统上进行了测序，使用了高输出试剂盒，具有2 x 100 bp的读长配置和双索引。总收率为5.2 Gb，其中95.8%的碱基在Q30及以上。
*注意，访问该数据需要BaseSpace Sequence Hub登录。
该产品可用作Illumina Advantage (TG)产品．Illumina Advantage大规模测序产品的特点是批次特定的发货和测试，延长保质期，和先进的更改通知，以提高实验室效率。
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读长度 |
|---|---|---|
| MiniSeQ系统 | 每次运行的样本:中输出:12，高输出:24(基于每个目标> 20x覆盖率) | 可达2 × 150 bp |
| miseq系统 | 每次测试的样品(通过试剂试剂盒版本):v2: 12, v3: 24(基于每个目标的> 20x覆盖率) | 可达2 × 150 bp |
| NextSeq 550系统 | 每个运行样本：中间输出：96，高输出：96（基于>每目标覆盖范围） | 可达2 × 150 bp |
| TruSight癌症 | Illumina BRCA面板的扩增仪 | |
|---|---|---|
| 试验时间 | 1.5天 | 5小时（仅限图书馆准备;不包括库量化，归一化或汇集时间） |
| 癌症类型 | Pan-Cancer | 固体肿瘤 |
| 内容规范 | 固定的一组探针，其丰富的94个基因和与常见和罕见癌症相关的284个SNP。 | 偏振区域和侧翼内读序列乳腺癌易感基因1和BRCA2 |
| 描述 | 常见和稀有癌症的种系突变检测研究。 | 种系和体细胞分析研究乳腺癌易感基因1和BRCA2． |
| 实践时间 | 5个小时 | < 1.5小时 |
| 输入数量 | 50 ng DNA | 1-100 ng(建议每个池10 ng) |
| 方法 | 目标浓缩，靶心富集，有针对性的DNA测序 | 扩增子测序那有针对性的DNA测序 |
| 多路复用 | 96 -丛 | 96双指标组合 |
| 专门的样品类型 | 不兼容FFPE | 血液，FFPE组织 |
| 物种类别 | 人类 | 人类 |
| 变体类 | 生殖系变异 | 种系变体，插入 - 缺失（诱导），单核苷酸多态性（SNP），体细胞变异 |
MGZ医学遗传中心的研究人员正在使用Infinium cytosnp-850k珠芯片和Trusight Cancer Canor来分析染色体异常。
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关于生物标志物专利和产品特定用途的其他专利注意事项:
一些基因组变异，包括一些核酸序列，以及它们在特定应用中的使用可能受到专利保护。建议客户确定，为了在客户的特定应用中使用产品，是否需要从拥有或控制此类专利的一方获得许可。
