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Illumina Dragen Bio-IT平台

Illumina公司DRAGEN（动态读取分析基因组学）生物IT平台提供测序数据的准确，超快速的二次基因组分析。阅读更多...
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本地服务器

Illumina DRAGEN服务器v3

20040619

价格

DRAGEN服务器11级1年许可证

20060397

要求定价

DRAGEN服务器2级1年许可证

20060398

要求定价

Dragen Server LVL 3 1年许可证

20060399

要求定价

DRAGEN服务器拉特4 1年许可

20060400

要求定价

DRAGEN服务器Lvl 5 1年许可证

20060401.

要求定价
云:亚马逊Web服务

Dragen AWS LVL 1 1年许可证

20060402

要求定价

DRAGEN AWS Lvl 2 1年许可证

20060403

要求定价

DRAGEN AWS Lvl 3 1年许可证

20060404.

要求定价

DRAGEN AWS Lvl 4 1年许可证

20060405

要求定价

DRAGEN AWS拉特5 1年许可

20060406.

要求定价
云:微软Azure

龙腾Azure 11级1年许可证

20060407.

要求定价

DRAGEN天青拉特2 1年许可

20060408.

要求定价

Dragen Azure LVL 3 1年许可证

20060409.

要求定价

Dragen Azure LVL 4 1年许可证

20060410

要求定价

龙腾Azure 5级1年许可证

20060411.

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Illumina Dragen Bio-IT平台

Illumina Dragen Bio-IT平台

BioIT 2018

GeneDx

邢癌症治疗

产品亮点

Illumina公司DRAGEN生物IT平台提供：
  • 准确的数据：检测与高分析的灵敏度和特异性的小的变体1
  • 无损基因组压缩:使用DRAGEN ORA (Original Read Archive)无损压缩将FASTQ文件大小减少到5倍
  • 强大的速度:在大约25分钟内以30倍覆盖范围处理整个人类基因组2，3
  • 频繁发布：包括定期的增强和升级的版本
  • 各种应用：从全基因组，外显子组，和RNA分析下一代测序（NGS）数据

在BaseSpace序列枢纽Illumina的DRAGEN生物IT平台和数据提交的应用程序还支持SARS-COV-2数据工具包。亚博官网人口．

DRAGEN祭

拖动Illumina连接的分析

DRAGEN上BaseSpace序列集线器

DRAGEN预置型服务器



DRAGEN上NextSeq 1000/2000

DRAGEN多的云把自己的许可证

AWS Marketplace上的DRAGEN

主要特点

超高速二级基因组分析

所述DRAGEN平台可以在30×覆盖在约25分钟与前提> 15小时的一个传统的基于CPU的系统处理为整个人类基因组NGS数据。它集基因组数据分析两项世界速度纪录。2，3

高效的解决方案

在Illumina的BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上运行时，一个30倍的基因组分析大约是5美元/样本，一个100倍覆盖的外显子组大约是3美元/样本。

高度精确的结果

在2020年PrecisionFDA真理挑战V2，DRAGEN赢得难以映射区和Illumina测序数据的所有的基准区域。1

不同的应用

所述DRAGEN平台从各种实验类型，包括整个基因组，外显子组整体，种系和体细胞的数据集，和RNA测序实验的分析测序数据。

无损压缩基因组

同时保持数据的完整性DRAGEN ORA（原读取归档）压缩技术用于FASTQ文件高压缩比，以及快速压缩和解压缩优化，所有。

频繁的更新

频繁发布的版本不断扩展和完善DRAGEN平台，同时适应新的应用和不断发展的行业标准。DRAGEN更新是版本控制的，用户可以根据需要选择是否使用新的更新。

DRAGEN在精准fda真相挑战赛V2中赢得关键类别

Illumina DRAGEN团队激动地宣布在Illumina测序数据的难绘制区域和所有基准区域中获得最佳表现。这次胜利标志着主要新功能的开始，这些功能将得到改进，包括结构变体、拷贝数变体和重复扩展。我们的成功表明，我们现在可以更准确地调用变异，而不是在难以绘制的区域。

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驾驭DRAGEN平台的强大功能

DRAGEN平台使各种规模和学科的实验室能够对他们的基因组数据做更多的工作。DRAGEN平台使用高度可重构现场可编程门阵列技术(FPGA)，提供基因组分析算法的硬件加速实现，如BCL转换、映射、对齐、排序、重复标记和单倍型变体调用。DRAGEN ORA无损基因组压缩技术可以显著节省FASTQ文件的存储成本。DRAGEN平台的基本特性解决了基因组分析的共同挑战，如冗长的计算时间和大量的数据。

在准确性不打折扣的情况下，DRAGEN平台提供了快速、灵活和成本效益。DRAGEN平台的可编程特性使Illumina能够开发自定义算法，并允许改进以适应未来的应用。

关键DRAGEN应用

DRAGEN预置型服务器 BaseSpace Illumina公司联系分析 NextSeq 1000/2000 多的云带上自己的许可证
多路分解(BCL转换)
无损基因组压缩
地图与对齐
全基因组（种系和体细胞） 只有生殖系
外显子组富集（种系体细胞）
covidseq.
RNA病原体检测
RNA-Seq(基因融合与定量)
单细胞RNA
联合基因分型
甲基化
TSO 500液体
宏基因组
管道 描述 变体类型检测 指标提供
DRAGEN多路分解 NGS分析快速解复用 N / A. N / A.
DRAGEN压缩 DRAGEN ORA压缩是为FASTQ文件的高压缩比优化，以及快速压缩和解压，同时保持数据完整性。 N / A.
  • 压缩率
  • 运行时
DRAGEN地图+对齐 龙腾地图+对齐可以作为一个独立的或作为龙腾管道套件的一部分运行 N / A.
  • 映射指标
  • 持续时间度量
  • 覆盖率度量
DRAGEN生殖系 该种系DRAGEN管道提供端 - 端NGS分析，包括对提高精度先进的错误模型校准，并重复扩张检测和基因分型通过Illumina的扩展亨特。
  • SNV
  • CNV
  • SV.
  • 重复扩张
  • 映射指标
  • 持续时间度量
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN体细胞 所述DRAGEN体管道包括肿瘤只和肿瘤正常模式下，设计用于肿瘤样品中检测体细胞变体。这两种模式不作任何假设套数，使低频等位基因的检测。
  • SNV
  • CNV
  • SV.
  • 三甲
  • MSI
  • HLA.
  • 映射指标
  • 持续时间度量
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN富集 Dragen Enrichment Pipeline将Dragen的种系和躯体呼叫者结合到专门用于分析富集样品的管道中。包括一套完整的丰富度量和报告。
  • SNV
  • CNV
  • SV.
  • 映射指标
  • 持续时间度量
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN RNA DRAGEN RNA Pipeline执行转录组分析，从剪接连接发现和比对开始，然后是快速比对和剪接连接定位和定量。对于差分表达式，Illumina推荐使用BaseSpace Sequence Hub上的DRAGEN差分表达式应用程序。
  • 基因融合
  • 映射指标
  • 持续时间度量
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN单细胞RNA DRAGEN单细胞RNA管道执行解复用、细胞条形码和UMI错误校正、序列比对和基因表达量化。 N / A.
  • 映射指标
  • 持续时间度量
  • 覆盖率度量
  • Callability报告
  • 细胞指标
DRAGEN联合基因分型 DRAGEN联合基因分型/群体管道联合调用跨多个基因组的变异，并以快速的速度和不打折扣的准确性对大群样本进行分级。
  • SNV
  • CNV
  • SV.
  • 重复扩张
  • 映射指标
  • 持续时间度量
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN甲基化 所述DRAGEN甲基管道进行对准，甲基通话，并且计算对准和甲基化的指标。 N / A.
  • 映射指标
  • 持续时间度量
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN参考构建器 接受FASTA文件，并构建DRADREN应用程序使用的专有引用。 N / A. N / A.
DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA分析软件 对于Illumina公司的TruSight肿瘤500叶绿体DNA二级分析支持。唯一可用的本地DRAGEN服务器上（第3版）
  • SNV
  • CNV
  • DNA融合
  • MSI
  • 三甲
  • 映射指标
  • 持续时间度量
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告

将生物信息学携带内部降低成本和周转时间

Alexander Bisignano，磷的联合创始人和首席执行官，讨论了该公司如何使用DRAGEN生物it平台在现场执行基因组数据分析，并在一个可访问的价格点。

阅读面试
SARS-CoV-2 NGS数据工具包

Illumina通过一个免费的集成软件工具包，使研究人员更容易检测和识别SARS-CoV-2，并将他们的发现贡献给社区。

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SARS-CoV-2 NGS数据工具包

DRAGEN对Illumina的数据分析平台

在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上的DRAGEN将DRAGEN平台的速度和准确性与我们的软件平台的安全性、成本节约和直观的界面结合起来。

  • 对于专业知识的不同层次按钮分析
  • 数据流直接从仪器快速分析
  • 没有硬件投资成本低
  • 利用Basespace序列集线器和亚马逊Web服务的安全性，合规性和存储功能（AWS）

yobet亚洲了解BaseSpace序列集线器

yobet亚洲了解Illumina Connected Analytics

DRAGEN上BaseSpace序列集线器

DRAGEN预置型服务器

与传统的基于cpu的系统相比，DRAGEN内部进行二次分析的时间更短，同时仍然保持较高的准确性。

  • 分析和本地存储数据
  • 支持不同级别的命令行接口
  • 最多可替换30个传统计算实例
  • 对于在30倍覆盖范围的整个人类基因组过程NGS数据<25分钟
  • 一个单位的支持满负荷运行的两个NovaSeq 6000系统

读取数据表

DRAGEN内部部署

DRAGEN机载NextSeq 1000/2000

板载DRAGEN生物的IT平台提供了二次分析，超快速，准确的解决方案。

  • 获取选择DRAGEN信息管道
  • 允许用户在短短两小时内生成结果
  • 为各种基因组分析解决方案提供优化的硬件加速算法，包括BCL转换、映射、比对、排序、重复标记和变体调用
  • 使用管道算法来减少对外部信息学专家的依赖

读取数据表

DRAGEN多的云把自己的许可证

AWS和Azure上的DRAGEN可以让你在首选云上的虚拟映像中访问DRAGEN软件。

  • 使用与DRAGEN本地服务器相同的软件和命令行选项(不包括TSO 500管道)
  • 适用于高级用户希望DRAGEN管道集成到他们现有的云环境
DRAGEN内部部署
查看视频
龙根- gatk最佳实践网络研讨会:深入探讨基因组分析管道的改进

在这个网络研讨会上，广泛研究所的埃里克银行描述了在调查Dragen和Gatk工具之间的差异时遇到的一些问题，突出了新的最佳实践管道中实施的方法的改进。

您还将了解团队如何评估管yobet亚洲道的开源版本和许可(硬件加速)版本之间的功能等效性，显示相同源输入上两种方法之间的结果。

查看网络研讨会录音

DRAGEN用例

GeneDx从外显子到基因组使用DRAGEN

利用DRAGEN，GeneDx现在能够同时保持低成本，周转时间短，精度高增长的业务。

阅读文章
雷迪儿童医院

吉尼斯世界纪录被设定为最快的遗传诊断在19.5小时。DRAGEN平台可显著提高测序后基因组数据的定位和比对速度。1

阅读文章
邢癌症治疗

看看Basespace Sequence Hub和DRAGEN是如何简化本实验室的NGS数据分析的。

看视频

阅读文章

DRAGEN应用程序

该DRAGEN平台可用于在生物科学众多应用。

人口测序

快速分析测序的基因组;加快再分析作为计算工具不断得到改善。

NICU和遗传疾病研究

减少基因组分析所需的时间，因为快速的结果可能是一个关键因素。

癌症研究

准确、快速分析肿瘤样本和肿瘤/正常样本。

Agrigenomics.

分析不同的基因组的复杂性，使用提供的参考的动物和植物。

临床和翻译研究

通过快速转机和高精度分析有针对性的Exome数据，以确保再现性和高质量的结果。

参考
  1. PrecisionFDA真理挑战v2：在难以绘制地区的短期和长读取的呼叫变体。precision.fda.gov /挑战/ 10．访问时间2020年11月3日。
  2. 生物IT世界。儿童医院费城，设置的Edico世界纪录二次分析速度。2017年10月23日。www.bio-itworld.com/2017/10/23/childrens-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed.aspx．已于2018年9月19日生效。
  3. 圣迭戈联合论坛报。拉迪儿童研究所设定的吉尼斯世界纪录。2018年2月12日。www.sandiegouniontribune.com/news/health/sd -不-拉迪-记录- 20180209 - story.html．已于2018年9月19日生效。

经常一起购买

支持数据及数字

灵活，可定制管道
DRAGEN种系管道步骤

DRAGEN提供了插入各种输入文件和生成一系列输出文档的灵活性。这种灵活性使用户能够定制他们的体验，使用和生成他们想要的文件格式。

该图示出了在DRAGEN种系管道步骤，例如，实际步骤改变每个管道。

产品文献

将Illumina DRAGEN生物it平台整合到您的基础设施中

技术说明| PDF< 1mb

用Illumina DNA制备与富集和DRADREN平台测序肿瘤exome测序

应用笔记| PDF1 MB

应用笔记| HTML |5版本

Basespace测序中心应用程序快速指南

宣传册|PDF <1 MB

DRAGEN生物IT平台上BaseSpace序列集线器

数据表|PDF1 MB

DRAGEN种系管道规格表

数据表|

复杂组织的高分辨率、高通量空间转录组学

应用笔记|PDF3 MB

数据表|PDF |5版本

手册和支持信息

所有DRAGEN生物IT平台支持

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