AmpliSeq for Illumina TCR β - sr (Short Read) Panel是一种高度多路复用的靶向重测序面板,用于多种样本类型,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤样本。它通过测序T细胞受体(TCR) β链重排来测量T细胞多样性和克隆扩增。您可以使用单一的多重PCR引物池、文库试剂和样本条形码,从FFPE、全血、新鲜冷冻组织或荧光激活细胞分类(FACS)分类的细胞中提取DNA/RNA,生成文库。
主要特点包括:
AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR面板是集成工作流程的一部分,包括AmpliSeq for Illumina聚合酶链反应(PCR)文库制备,Illumina合成测序(SBS)化学和下一代测序(NGS)技术,以及自动化分析。
此即时使用面板可节省您识别目标,设计引物和优化面板的时间和精力。它能够表征TCRβ链的高变互补确定区域3(CDR3)。
yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于Illumina的AmpliSeq仪器 | 推荐样本数量 | 读取长度 |
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MiniSeQ系统 | 每次运行的样本将取决于样本类型。 | 2 × 151bp |
miseq系统 | 每次运行的样本将取决于样本类型。 | 2 × 151bp |
nextseq系统 | 每次运行的样本将取决于样本类型。 | 2 × 151bp |
Illumina TCR - sr面板的AmpliSeq | Illumina免疫Repertoire Plus的AmpliSeq, TCR beta Panel | |
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试验时间 | 5.5 - -7.5小时 | 5.5 - 7.5小时(仅限图书馆预备;不包括库量化,归一化或汇集时间) |
内容规范 | 序列TCR Beta链重排,具有高达80bp的读取长度扩增子,用于表征CDR3。 | TCRβ链重排的RNA评估,包括CDR1, CDR2和CDR3(高达400 bp的读长扩增子) |
实践时间 | <1.5小时 | <1.5小时 |
输入数量 | 1 ng. | 10-1,000个ng. |
方法 | 扩增子测序,有针对性的DNA测序,有针对性的RNA序列 | 扩增子测序,有针对性的RNA序列 |
核酸类型 | RNA、DNA | 核糖核酸 |
专门的样品类型 | 血液,FACS细胞,FFPE组织,新鲜/冷冻组织 | 血液,流式细胞仪细胞,新鲜/冷冻组织 |
物种分类 | 人类 | 人类 |
系统兼容性 | MiniSeq,NextSeq 550 | MiniSeq,MiSeq,NextSeq 550 |