Illumina RNA准备富集
实现快速，有针对性地询问扩张数量的靶基因，具有特殊的捕获效率和覆盖均匀性。阅读更多…
图书馆准备
指数适配器
控制板
全部的：
*只适用于图书馆备考资料册。此升级不包括索引适配器和面板。
Illumina RNA Prep with Enrichment使用On-Bead标记技术，然后进行简化，单杂交，为基于RNA的文库制备和富集提供异常快速的工作流程。
在不到9个小时的总时间在不到9小时的时间内准备和丰富图书馆。与Truseq RNA Exome相比，此工作流程将节省50％+时间。Illumina-合格的自动化选项即将推出我们的自动化伙伴。
从新鲜或冷冻样品的10 ng总RNA或从降解样品（例如FFPE）的全部RNA的总RNA高度敏感性。
分离目标转录组编码区域可以在很小的测序深度上最大限度地提高发现能力。Illumina RNA富集Prep旨在提供卓越的捕获效率和覆盖均匀性，最大限度地减少所需的测序深度，以准确无误的检测。每次富集反应只需要2.5µL探针。
从各种预先构建，验证的探测池中选择或自定义自己的探针以获得最大的灵活性。用新的独特双索引集C和D在单个运行中复用至384个样本。模块化设计支持跨感兴趣区域的广泛的RNA-SEQ应用，从而能够检测和发现研究，例如等位基因特异性表达，融合检测，生物标志物筛选等。
实现快速，有针对性的靶向靶基因的询问，包括RNA外壳。Illumina RNA制备富含富集可以与Illumina Exome面板一起使用，它具有高度优化的探针组，可提供编码RNA序列的全面覆盖。Illumina Exome面板包括> 425,000个探针，每个探针均由NCBI37 / HG19参考基因组构建，覆盖> 98％的Refseq Exome。探头集捕获> 214,000个目标，跨越21,415个感兴趣的基因。
呼吸道病毒寡核苷酸面板提供高度敏感的呼吸病毒的检测和表征，包括冠状病毒菌株。即使在高度诱变的区域内，用于杂交捕获的靶富集的寡核苷酸探针仍然有效，允许靶向快速发展的RNA病毒。使用浓缩的患有Illumina RNA准备的呼吸道病毒寡核苷酸。
亚博官网人口| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读长度 |
|---|---|---|
| nextseq 550系统 | Illumina RNA扩增试剂盒+外显子组 中产阶级：5 高输出:16 (基于每个样本25M读取) |
2×100 bp |
| NextSeq 2000系统 | Illumina RNA扩增试剂盒+外显子组 P2: 16 P3: 40 (基于每个样本25M读取) |
2×100 bp |
| Novaseq 6000系统 | Illumina RNA扩增试剂盒+外显子组 SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4：384 (基于每个样本25M读取) |
2×100 bp |
| ISEQ 100系统 | Illumina RNA制备浓缩+呼吸道病毒板 8（根据每个样本的500k读数） |
2×75 bp |
| MiSeq系统,MiSeq | Illumina RNA制备浓缩+呼吸道病毒板 1-50（根据每个样本的500k读数） |
2×75 bp |
| MiniSeq系统 | Illumina RNA制备浓缩+呼吸道病毒板 8-50(基于500K读取每个样本) |
2×75 bp |
| nextseq 550系统 | Illumina RNA制备浓缩+呼吸道病毒板 260-384（基于每个样本的500k读数） |
2×75 bp |
| Illumina RNA准备富集 | Truseq RNA Exome. | Illumina链mRNA准备 | |
|---|---|---|---|
| 测定时间 | <9小时 | 〜2天 | 6.5小时 |
| 自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 内容规范 | 与Illumina Exome面板一起使用时捕获编码转录组 | 捕获编码转录组/ RNA Exome | 捕获带有链信息的编码转录组 |
| 描述 | 一种可重复的，经济的解决方案，使目标转录物检测和发现从广泛的样品类型和输入中发现，包括福尔马林固定的石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样品 | 为研究人员提供了一种清晰，全面的编码转录组，具有精确的股线信息和降低的样本输入要求。 | 一种简单，经济高效的解决方案，用于分析编码转录组，具有精确的股线信息 |
| 动手 | <2小时 | 〜11小时 | <3小时 |
| 输入数量 | 新鲜/冷冻样本总RNA含量为10ng, FFPE样本总RNA含量为20ng | 来自新鲜/冷冻样品的10 ng总RNA，或来自FFPE样品的20ng总RNA | 25-1000 NG标准质量总RNA |
| 的作用机制 | 珠子连接的转座组 | 靶向RNA的生物素化捕获探针。不需要带有聚尾巴的RNA。 | Polya捕获，基于连接的适配器和指标 |
| 方法 | mRNA测序那目标浓缩，靶心富集，有针对性的RNA序列 | exome测序那mRNA测序 | mRNA测序 |
| 多路复用 | 多达384个唯一双索引(UDIs) | 多达24单，96组合(CD)双 | 多达384个唯一双索引(UDIs) |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
| 变体类 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 新型转录物，单核苷酸多态性（SNP），转录物变体 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 |
与TruSeq RNA外显子组相比，On-Bead标记和一个单一的、90分钟的杂交步骤结合起来，提供了更快的工作流程和更少的步骤。
Illumina RNA Prep与富集实现了从通用人类参考(UHR)总RNA输入量10 ng和100 ng之间的高数据一致性。UHR RNA库在NovaSeq 6000系统上测序，每个库下采样至25M簇。数据使用BaseSpace RNA-Seq Alignment v 1.1.1 app进行分析。
使用Illumina RNA Prep与富集的K-562细胞系10ng RNA制备的文库，并导致Illumina Exome面板成功地检测BCR-ABL1基因融合。顶部对齐轨迹显示所有读数，底部轨道仅显示支持BCR-ABL1融合基因的读取。
| 融合(源) | 凛 | RNA的输入 | 检测 |
|---|---|---|---|
| bcr - abl 1（k-562） | 7.4 | 10 NG. | 6/6(100%)的复制 |
| TPM3-NTRK1（结直肠癌） | 2.5 | 20 NG. | 6/6(100%)的复制 |
使用Illumina RNA Prep with Enrichment和Illumina Exome Panel从10 ng UHR RNA和20 ng FFPE RNA制备的文库显示，85%以上的数据与转录本(编码和utr)一致。来自TruSeq RNA外显子文库的数据用于比较。
