Illumina Stranded MRNA准备
一种简单，可扩展，经济效益，快速的单日解决方案，用于分析编码转录组，可利用标准（非降解）RNA的25 ng输入。阅读更多...
图书馆准备
索引适配器
总:
*仅提供适用于图书馆预备套件。索引适配器和面板不包括在此促销中。
Illumina strand mRNA Prep提供了一种精简的RNA-Seq解决方案，用于跨转录组的清晰和全面的分析。它为输入类型提供了非凡的灵活性，并支持低输入量，低至25ng总RNA。Illumina链mRNA Prep能够精确测量链方向、均匀覆盖和高可信度发现特征，如新亚型、基因融合和等位基因特异性表达。
Illumina Slanded MRNA准备经过优化，以提供出色的Polya捕获效率和覆盖均匀性。它最大限度地减少了所需的测序深度，用于准确，无偏见检测的编码转录组。Illumina Stranded MRNA准备基于Truseq结扎技术，自2011年以来已被引用超过9,926个出版物。
Illumina Slanded总RNA制备支持广泛的RNA输入，从25 ng到1000 ng。*
这些信息能够检测反义转录，增强转录本注释，并提高对齐效率。
在少于7小时内准备测序库。illumina认证的自动化选项即将通过我们自动化伙伴。
在单个运行中多路复用最多384个样本和序列。（目前索引组A和B可用;设置C和D即将推出。）
RNA-SEQ越来越多地是思想领导者的选择平台，在给定的时间点提供转录组的详细快照。它提供了众多优化的定量PCR，包括：
*与FFPE样品不兼容
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 中产阶级：5 高产：16 (基于每个样本25M读取) |
2×75 bp |
| nextseq 2000系统 | P2：16 P3：40 (基于每个样本25M读取) |
2×75 bp |
| Novaseq 6000系统 | SP: 32 S1：64. S2: 164 S4：384 (基于每个样本25M读取) |
2×75 bp |
| Illumina Stranded MRNA准备 | TruSeq滞留mRNA | TruSeq RNA文库准备试剂盒v2 | Illumina RNA准备富集 | Illumina将总RNA准备绞合，用Ribo-Zero Plus | |
|---|---|---|---|---|---|
| 试验时间 | 6.5小时 | ~ 10.5小时 | ~ 10.5小时 | < 9小时 | 〜7小时 |
| 自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 内容规范 | 将编码转录组捕获与股线信息 | 将编码转录组捕获与股线信息 | 捕获编码转录组（没有STRAND信息） | 与Illumina Exome面板一起使用时捕获编码转录组 | 捕获编码RNA和多种形式的非编码RNA |
| 描述 | 一种简单，经济高效的解决方案，用于分析编码转录组，具有精确的股线信息 | 给研究人员一个清晰，全面的观点编码转录组与精确的链信息。 | 一个简单的，成本效益的研究解决方案，分析编码转录组。 | 一种可重复的，经济的解决方案，使目标转录物检测和发现从广泛的样品类型和输入中发现，包括福尔马林固定的石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样品 | 用于多种样品类型的全转录组测序研究。包括来自多种物种的单管耗尽的Ribo-Zero Plus模块 |
| 实践时间 | <3小时 | ~ 4.5小时 | ~ 4.5小时 | <2小时 | <3小时 |
| 输入数量 | 25- 1000ng标准质量总RNA | 0.1 - 1 ug总RNA或10-100ng先前分离的mRNA（来自含有Polya Teats的物种） | 0.1 - 1 ug总RNA或10 - 400 ng以前分离的mRNA(从有polyA尾巴的物种) | 10ng来自新鲜/冷冻样品的总RNA，或来自FFPE样品的20ng总RNA | 1-1000 ng标准质量RNA样品的总RNA。10ng总RNA最小，适用于最佳性能和FFPE样品 |
| 行动机制 | PolyA捕获、基于连接的适配器和索引添加 | oligo-dt珠捕获Polya尾巴 | oligo-dt珠捕获Polya尾巴 | Bead-linked transposome | 酶rRNA耗尽，连接的适配器和指标的连接 |
| 多路复用 | 多达384个唯一双索引(UDIs) | 1 - 96 | 每个车道最多24-plex | 多达384个唯一双索引(UDIs) | 多达384个唯一双索引(UDIs) |
| Strand特异性 | 搁浅 | 搁浅 | 非滞留 | 非滞留 | 搁浅 |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 | 测序 | 测序 |
| 变体类 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 |
左- Illumina Stranded MRNA准备的性能指标。正确的- Illumina strand mRNA Prep与TruSeq strand mRNA比较。Illumina strand mRNA Prep表现出优越的性能，特别是在输入25ng UHR RNA时。将库下采样到30M读取，并使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1进行分析。重复报告在4M下采样对端读取通过滤波器(PF)。
与Truseq链状mRNA相比，Illumina Slanded MRNA PREP使得具有低RNA输入的基因检测。检测到检测到的基因数量在30M限位的配对端读数PF中报告。在1X覆盖下检测到更多基因，与Illumina链掺量mRNA制备的情况一样，是更大敏感性的指标。
Illumina Slanded mRNA制备用Truseq股线mRNA产生高度交响的数据（a）等效输入的100ng UHR RNA和（b），减少了25ng Vs 100ng UHR RNA的输入。
Illumina Slanded MRNA PREP在25ng和100ng UHR RNA之间的25ng UHR RNA和（b）之间的（a）技术重复之间的高数据程度图书馆在2×74bp下测序，将其读取到30米。使用Basespace RNA-SEQ对齐App v2.0.1执行数据分析。
Illumina Stranded MRNA PREP提供了快速的工作流程，减少了手续时间。时间可能有所不同，这取决于所使用的设备，处理的样本数，自动化程序或用户体验。
数据表|PDF <1 MB
