通过甲基化型珠芯卷盒,研究人员可以在单核苷酸分辨率下定量地在基因组上定量地询问超过850,000个甲基化位点。可以并联分析多个样本,包括FFPE,以提供高通量功率,同时最小化每个样品的成本。
Infinium HD阵列技术使内容选择独立于通常与甲基化DNA捕获方法相关的偏差相关限制。结果是一个甲基组的泛增强子和编码区视图,可以用于各种人类组织的表观基因组全关联研究。
该试剂盒包括甲基化专家要求的内容类别,如:
MethylationEPIC数据分析由GenomeStudio Methylation Module支持。GenomeStudio软件使研究人员能够轻松地对小规模研究进行差异甲基化分析。它具有先进的可视化工具,使研究人员能够在单个图形中查看大量数据,如热图、散点图和线图。
这些工具和GenomeStudio基因组浏览器显示有价值的信息,例如染色体坐标,百分比GC,CpG岛的位置,以及甲基化β值。
对于大规模研究,有许多免费的分析包在软件框架R中工作,用于甲基化数据的标准化和差异分析。教学视频解释这些数据分析包的使用。
Infinium甲基化盒 | TruSeq甲基捕获EPIC库准备工具包 | |
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内容规范 | 目标850,000 Cpgs。定量地询问各基因组的所选甲基化位点。 | 超过330万CPG的目标。询问生物学上重要的甲基目标。 |
描述 | 在全基因组中的选择甲基化位点的定量询问,以每种样品的最小成本提供高通量研究能力。 | 重点询问一组甲基靶标,以获得一个平衡的、经济高效的选项,该选项可支持筛选研究和生物标记物发现研究目标。 |
输入数量 | 250 ng DNA | 500 ng人类基因组DNA |
方法 | 甲基化阵列 | 甲基化测序那靶向DNA测序 |
数量的样品 | 每阵列8个样本 | 最多12-plex |
专门的样品类型 | FFPE组织,低输入样品 | 不兼容FFPE |
物种分类 | 人类 | 人类 |
技术 | 微阵列 | 测序 |
技术说明|PDF1 MB.
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应用笔记|PDF <1 MB
使用安捷伦Bravo液体处理平台实现Illumina TruSeq外显子组富集的自动化
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数据表|HTML.
Infinium MethylationEPIC Kit是HumanMethylation450 BeadChip Kit的推荐替代产品,已停产。Illumina始终致力于为您提供高品质的支持和服务。