TruSeq链总RNA是为人类、小鼠、大鼠和植物序列设计的,但可能适用于多种真核物种。下面的表格列出了经过实验室测试、Illumina完全支持、硅测试或客户报告工作的生物体。Illumina不能保证根据客户报告的结果去除rRNA。
独立Illumina公司核糖零加核糖核酸消耗试剂盒可用于人类、小鼠、大鼠和细菌样本的早期获取,并允许rRNA耗尽。
有机体 | 实验室测试 | 在网上测试 | 客户报告 | 评论 |
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蜜蜂(的蜜蜂) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
鸡(五倍子) | 去除5s,18s和28s rrnas。没有测试线粒体rrnas。 | |||
Ciona Intestinalis. | 删除18 s rRNA。其他RRNA没有测试。 | |||
Colletotrichum higginsianum. | 将删除28S和5.8S rRNA。不会移除5S rRNA。未评估18S rRNA。 | |||
桡脚类动物的物种 | 删除28S和18S rnas。其他rnas未被评估。 | |||
牛 | ||||
盘基网柄菌discoideum | 从高质量RNA中去除28S和18S rRNA。不会删除小的RRNA。 | |||
狗 | ||||
雪貂(艾鼬) | ||||
雀(Carpodacus mexicanus) | 去除5s和18s rRNA。不会删除18s rrna。没有测试线粒体rrnas。 | |||
面粉甲虫(赤拟谷盗) | ||||
青蛙(爪蟾) | ||||
果蝇(果蝇) | 不会移除5S rRNA或28S rRNA的“正确”片段。 | |||
真菌(黑曲霉) | 18S rRNA的300 nt区域不会从降解的样品中去除。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
真菌(底霉素) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
真菌(白色念珠菌) | ||||
真菌(新型隐球菌) | 不会移除5.8S或5S rrna。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
真菌(溶脂亚罗菌) | 不会移除5.8S或5S rrna。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
马(马) | ||||
人类 | 除血液外的所有组织;使用Truseq Stranded总RNA - 用于血液样品的Ribo-Zero珠蛋白。 | |||
虫子(Rhodnius prolixus) | 尽可能使用高质量的RNA。线粒体rRNA未移除。 | |||
七鳃鳗 | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
海绵海绵(Crambe Crambe.) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
猴子(猕猴;Cynomolgus macaques.) | ||||
猴子(非洲绿;Chlorocebus sabaeus) | ||||
猴子(恒河;解剖) | ||||
蚊子(anopheles gambiae.) | 删除18 s rRNA。不会去除5S, 5.8S和12S, 16S线粒体rRNA。28S rRNA未检测。 | |||
鼠标 | 除血液外的所有组织;使用Truseq Stranded总RNA - 用于血液样品的Ribo-Zero珠蛋白。 | |||
线虫(C. Elegans.) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
蝾螈(绿背虱) | 不能移除5.8S或5S rnas。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
恶性疟原虫 | 不会移除5.8S或5S rrna。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
poeciliid鱼类 | 移除28S和18S rRNA。可能不能删除所有5S rRNA。 | |||
老鼠 | 除血液外的所有组织;使用Truseq Stranded总RNA - 用于血液样品的Ribo-Zero珠蛋白。 | |||
大马哈鱼(大西洋鲑) | 删除18S、5.8S和5S rnas。不会移除28S rRNA。未检测线粒体rnas。 | |||
海葵(翻译起始因子) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
猪 | 删除28S、18S、5.8S和5S rnas。 | |||
刚地弓形虫 | 使用高质量的RNA。 | |||
锥虫属brucei | 将清除28S和18S rRNA。其他rRNA未被评估。 | |||
大葱(葱属植物fistulosum) | 删除18 s rRNA。其他RRNA没有测试。 | |||
斑马鱼(Danio Rerio.) |
有机体 | 实验室测试 | 在网上测试 | 客户报告 | 评论 |
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人类 | 血液样本;对于所有其他组织,使用TruSeq链总rna -含零核糖核酸的人/小鼠/大鼠或TruSeq链总rna -含零核糖核酸金 | |||
鼠标 | 血液样本;对于所有其他组织,使用TruSeq链总rna -含零核糖核酸的人/小鼠/大鼠或TruSeq链总rna -含零核糖核酸金 | |||
老鼠 | 血液样本;对于所有其他组织,使用TruSeq链总rna -含零核糖核酸的人/小鼠/大鼠或TruSeq链总rna -含零核糖核酸金 |
有机体 | 实验室测试 | 在网上测试 | 客户报告 | 评论 |
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拟南芥 | 与叶子,种子和根兼容。 | |||
鹰嘴豆(菊苣) | 去除4.5S、16S、23S叶绿体rRNA和18S细胞质rRNA。不会去除5S叶绿体和5S细胞质rRNA。其他RRNA没有测试。 | |||
玉米 | 与叶子,种子和根兼容。 | |||
棉 | ||||
真核绿藻(衣藻) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
小道消息 | ||||
日本忍冬(金银花) | ||||
玉米 | 与叶子,种子和根兼容。 | |||
镜子布什(Coprosma被) | ||||
苔藓(Physcomitrella) | ||||
Prorocentrum最低 | 去除18秒和28s rRNA。其他RRNA没有测试。 | |||
大米 | 与叶子,种子和根兼容。 | |||
大豆 | 与叶子,种子和根兼容。 | |||
番茄(茄属植物lycopersicum) | ||||
越南香菜(红脚鹬odorata) | ||||
水三叶草(Marsilea vistita) | ||||
大葱 | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
小麦 | 与叶子,种子和根兼容。 |
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