为了提供更大的灵活性在订购图书馆准备的单个组件时,我们正在移动到模块化配置。我们现有的TRUSEQ纳米DNA库预备套件(猫。No.FC-121-4001,FC-121-4002和FC-121-4003)将转换为Truseq DNA纳米(猫。24个样品和猫的Cat。No.20015964。用于图书馆制备的96个样本的美国专利No.20015965。指数适配器将单独出售为Truseq DNA单索引(Cat。设置A和Cat的No.20015960。套装B的No.20015961)和Truseq DNA CD(组合DNA CD(Combinerial Dual)指标(Cat。No.20015949)。
TruSeq DNA Nano能够有效询问有限可用DNA的样本。基于机械碎片-连接化学,这种低输入方法为几乎所有测序应用提供了高覆盖质量和低偏差。
通过用基于珠子的选择取代基于凝胶的尺寸选择来简化Truseq DNA纳米,使研究人员能够在不到一天的时间内制定高质量的库。它针对各种读取长度进行了优化,从2×101bp到2×151bp。
TruSeq DNA Nano提供了极好的结果,只需100 ng的输入,消除了对微克DNA的典型要求。这使得研究人员能够研究具有有限可用DNA的样本(如肿瘤样本),并有助于保存样本以供将来或替代研究使用。除了加快工作流程,基于珠的尺寸选择还避免了与基于凝胶的选择相关的典型样品损失。
TruSeq DNA Nano减少了典型PCR诱导的覆盖率差距的数量和平均大小。增强的工作流程减少了库偏倚,提高了整个基因组的覆盖均匀性。这些试剂盒还提供了传统上具有挑战性的基因组内容的极好覆盖范围,包括富含GC的区域、启动子和重复区域。这使研究人员能够从每次测序中获得更多信息。Truseq DNA纳米产品经过验证,可用于几乎任何下一代测序应用的高质量基因组覆盖率。
仪器 | 推荐的样品数量 | 阅读长度 |
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nextseq 550系统 | 每次运行1个样品(基于人类基因组的30×覆盖) | 350 BP插入:≤2×100bp 550 bp插入:≤ 2×150bp |
HiSeq 2500系统 | 每次运行2-10个样本(双流动池;基于人类基因组的30×覆盖率) | 快速运行,350bp插入:≤2 × 100bp 快速运行,550 BP插入:≤2×250 bp 高输出,350 BP插入:≤2×100bp 高输出,550 bp插入:≤ 2×125 bp |
TruSeq-DNA纳米 | TruSeq-DNA无PCR | Illumina公司DNA预科 | |
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测定时间 | 〜6小时总测定时间 | 总检测时间为5小时 | 〜3-4小时(从DNA提取到标准化库) |
自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
描述 | 一种低输入研究方法,可提供高基因组覆盖质量和减少偏差。 | 对于全基因组测序研究的简单,全包PCR-PREP,其能够通过基因组的具有挑战性的区域进行序列。 | 一个快速、灵活的工作流程,适用于广泛的研究应用和样本类型,从人类到微生物全基因组测序等。 |
动手 | 〜4小时 | 4个小时 | 1-1.5小时 |
输入数量 | 100ng基因组DNA | 1 ug DNA | 小基因组(例如微生物):1-500ng DNA。大型基因组(例如人类):100-500ng DNA。(用于血液和唾液,请参阅参考指南)。 |
的作用机制 | 机械DNA碎片和适配器连接。工作流程使用减少偏置PCR,并没有凝胶。 | 机械DNA碎片和适配器连接。工作流程是免费的,无凝胶。 | 珠子连接的转座组 |
方法 | 通过测序进行基因分型,霰弹枪测序,全基因组测序 | 通过测序进行基因分型,霰弹枪测序,全基因组测序 | 扩增子测序,de novo测序,霰弹枪测序,全基因组测序 |
多路复用 | 最多24个单一,96个组合(CD)双,24个独特的双和96个独特的双(UD)组合(即将推出) | 最多24个单一,96个组合(CD)双,24个独特的双和96个独特的双(UD)组合(即将推出) | 高达384个独特的双(UD)组合和96个组合双(CD)组合 |
专门的样品类型 | 低输入样品,不是FFPE兼容 | 不兼容FFPE | 血液,不是FFPE验证,唾液 |
物种类别 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他,植物,老鼠 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他,植物,老鼠 | 任何物种,细菌,果蝇,人类,哺乳动物,老鼠,线虫,植物,老鼠,病毒,酵母,斑马鱼 |
物种细节 | 与大多数大的DNA基因组相容。 | 与大多数大的DNA基因组相容。 | 与任何物种兼容 |
插入目标大小 | 350个基点或550个基点 | 350个基点或550个基点 | 〜350bp. |
规格 | TruSeq-DNA纳米 | TruSeq-DNA无PCR |
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套件类型 | Truseq DNA nano lt&ht | Truseq DNA PCR-Free LT&HT |
描述 | 基于广泛采用的TruseQ库准备,输入较低,数据质量提高 | 优越的基因组覆盖率,无根化图书馆偏差和空隙 |
工作流 | LT工具包:手动工作流程 HT套件:自动化友好;手动协议也可用 |
LT工具包:手动工作流程 HT套件:自动化友好;手动协议也可用 |
投入量 | 100-200纳克 |
1-2μg. |
包括PCR. | 是的 | 不 |
试验时间 | 5.5小时 | 〜5小时 |
动手 | 4个小时 | 〜4小时 |
目标插入尺寸 | 350个基点或550个基点 | 350个基点或550个基点 |
无凝胶 | 是的 | 是的 |
支持的样本数 | 24(LT)或96(HT)样本 | 24(LT)或96(HT)样本 |
尺寸选择珠子 | 包括 | 包括 |
应用 | 全基因组测序应用,包括全基因组重新排序,德诺维组装和偏见研究 | |
样本复用 | 最多24个单一,96个组合(CD)双,24个独特的双和96个独特的双(UD)组合 | |
兼容的illumina序列夹 | MiniSeQ,Miseq,Nextseq,Hiseq,Novaseq,Hiseq X,Hiscansq和基因组分析系统 |
技术说明|PDF <1 MB
技术说明|PDF4 MB.
数据表|PDF11 MB.