Truseq Stranded mRNA
使用MRNA准备测序文库，以通过股线特定信息获得编码转录组的清晰视图。阅读更多...
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现在，您可以在一天中准备mRNA库，只需25个NG输入。基于Truseq化学，我们的新品Illumina Stranded MRNA准备提供一个简单且可扩展的解决方案，用于针对编码转录组。使用代码RNA25.结账现在截至2020年底，您的第一笔订单25％折扣。*
*仅提供适用于图书馆预备套件。索引适配器和面板不包括在此促销中。
Truseq Stranded MRNA提供了一种用于编码转录组分析的简化，成本效益和可扩展的解决方案。它与各种样品兼容。
获得MRNA链取向的精确测量，用于检测反义转录，增强的转录作用作用以及增加的对准效率。高覆盖均匀性增强了诸如替代转录物，基因融合和等位基因特异性表达的特征的发现。
链信息可以确定给定的RNA转录本来自于两条DNA链中的哪一条。这些信息增加了转录本注释的可信度，特别是对于非人类样本。识别链起源增加了对齐的读取百分比，降低了每个样本的测序成本。
工作流程可实现对标准和低质量样本的强大询问，以及与各种研究设计兼容的工作流程。
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| nextseq 550系统 | RNA分析：每次运行13-40个样品（基于每种样本的1000万读数） 转录组分析：每次运行5-16个样品（基于每个样本的2500万读数） |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
| Hiseq 2500系统 | RNA分析：每次运行60-400个样本（双流量细胞;基于每种样本的1000万读数） 转录组分析：每次运行24-160个样品（双流量细胞;根据每个样本的2500万读数） |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000系统 | RNA分析（每个运行样品，双流量池）：S1：320，S2：384，S4：768。由索引组合（双重）有限。基于1000万读。 转录组分析（每次运行样本，双流量池）：S1：128，S2：256，S4：768.由指数组合（双重）有限。基于2500万读。 |
≤2×100bp ≤2×100bp |
| Truseq Stranded mRNA | Illumina Stranded MRNA准备 | Illumina RNA浓缩Prep | |
|---|---|---|---|
| 测定时间 | 〜10.5小时 | 6.5小时 | <9小时 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 内容规范 | 将编码转录组捕获与股线信息 | 将编码转录组捕获与股线信息 | 利用Illumina外显子组捕获编码转录组 |
| 描述 | 为研究人员提供了一种清晰，综合的编码转录组，具有精确的股线信息。 | 一个简单的，经济的解决方案，分析编码转录组与精确的链信息 | 这是一种可重复、经济的解决方案，能够从广泛的样本类型和输入(包括福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本)中进行靶向转录本检测和发现 |
| 动手 | 〜4.5小时 | <3小时 | < 2小时 |
| 输入数量 | 0.1 - 1 ug总RNA或10-100ng先前分离的mRNA（来自含有Polya Teats的物种） | 25-1000 NG标准质量总RNA | 10ng来自新鲜/冷冻样品的总RNA，或来自FFPE样品的20ng总RNA |
| 行动机制 | oligo-dt珠捕获Polya尾巴 | Polya捕获，基于连接的适配器和指标 | 珠子连接的转座组 |
| 方法 | mRNA测序 | mRNA测序 | mRNA测序，目标富集，靶心富集，有针对性的RNA测序 |
| 多路复用 | 1-96 | 最多384个独特的双索引（UDIS） | 最多384个独特的双索引（UDIS） |
| 专门的样品类型 | 不是FFPE-Compatible | 低输入样品，不是FFPE兼容 | 血液，FFPE组织，低输入样品 |
| 物种类别 | 牛，人类，哺乳动物，老鼠，大鼠 | 牛，人类，哺乳动物，老鼠，大鼠 | 人类,病毒 |
| Strand特异性 | 搁浅 | 搁浅 | Non-Stranded |
以前称为Truseq链载mRNA文库预备套件（CAT。No. RS-122-2101，RS-122-2102和RS-122-2103）的产物现在被称为Truseq Slarded mRNA。产品配置已更改。在新配置中，图书馆准备和索引适配器可以单独购买。可以在“选择产品”部分中找到可用于个人购买的组件列表。
图2来自Truseq Stranded mRNA和总RNA库预备套件数据表，2015年12月
FFPE组织的技术复制表现出高度一致，表明鲁棒库预备性能。轴是log2（fpkm）。R.2值显示。
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