2018年9月12日
大西洋宽吻海豚(语truncatus)已完成并由Illumina, Inc., Sea World, Plant with Purpose,yobet亚洲NRGene约翰霍普金斯大学和海洋发现研究所。诸如此类的高质量基因组对于解决育种、比较生物学、医学和保护规划方面的挑战至关重要。这基因组组装如夏威夷僧海豹和非洲野狗的研究,正在发表,以催化比较基因组学的研究,为生物多样性编目提供结构,并最终支持有关物种保护和管理的决策。
通过这个项目,科学家们使用了多种方法来改善大西洋宽吻海豚的组装结构。现在有两种基因组组合:
1)传统的“单倍体”组装(Tur_tru_Illumina_hap_v1) -两个亲本单倍型的典型嵌合体
这里有单倍体组件:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA476133
2)单倍型-阶段“二倍体”组装(Tur_tru_Illumina_dip_v1) -每个支架代表来自单个同源染色体的序列
分阶段重新组装是最高质量的,并为社区提供了新颖和准确的方法来探索海豚基因组的杂合性。这里有二倍体组装体:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA478376
宽吻海豚是研究最广泛的海洋哺乳动物之一。然而,分类法的语属仍未解决。为了将该物种带入基因组学时代,高质量的参考基因组至关重要,因为它提供了在全基因组水平上对物种内部和物种之间的多样性进行分类的结构。此外,海豚和其他哺乳动物之间的平行分子轨迹使宽吻海豚成为了解人类健康方面(如代谢过程/糖尿病、蛋白质组学和衰老)的有用模型。有关如何收集数据和高质量数据的详细信息,请阅读这篇论文.