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Agrigenomics

测序的海域

教授Michael Bunce让我们在一个环境DNA游览

测序的海域
2019年12月13日

环境DNA(埃德娜)测序是一个正在迅速崛起的研究生物多样性和生态环境变化监测的方法。作为生物DNA到周围的环境中,埃德娜分析拿起这些遗传“面包屑”和所有的物种提供了线索出现在一个示例——从微生物(细菌)巨型动物(如鲨鱼)。

Bunce教授研究领域的古代DNA在几所大学——最近和环境科廷大学(西澳大利亚珀斯)共同跟踪和环境DNA (趋势)实验室。他的主要研究领域包括生态系统生物多样性的研究使用下一代测序(门店),他看着骨化石了解灭绝*和埃德娜海水鱼类在海洋公园* *调查。“事实上,我们可以检测到超过80种鱼类从他们留下的DNA在几升的海水从珊瑚礁仍是一个发现,我觉得神奇,“Bunce教授说。

Bunce探索教授埃德娜在海里的许多方面。包括metabarcoding所带来的好处,让窗口在于我们的海洋最深处。他解释了如何基于生态系统的管理是一个途径来帮助理解一切都是相互关联的。此外,社会科学项目“海洋测序”(SoS)允许学生获得第一手的经验和帮助人们连接到当地的海滩。

“我相信埃德娜将成为一个关键的数据保护,使我们能够做出明智的决策,让我们面对现实吧,鉴于我们所面临的挑战在我们的海洋、河流和土地,真正重要的是时候做出正确的决定,”Bunce教授说。

“人们发现鱼、珊瑚或鲨鱼生活在生态系统生态系统通过埃德娜让他们探险家,但有一个附加的好处,”Michael Bunce教授说。“这引起人们的意识的遗传学和基因组学的时候人们将被要求做出重要的决定对于他们的基因组,血统,微生物,和基因改造。我也许有点偏见,但是我抓住任何机会教育DNA是什么,它的功能,我们如何捕捉它去探索周围的世界。”

利用创新的方法埃德娜迅速扩张,包括:端口监控、生物多样性调查、压载水检测、土壤检测、水产养殖、传粉者识别和修复等。

*生存实践,过去生物多样性,和人为影响揭示了新的Zealand-wide古DNA的调查
并籍阵线Seersholm, TL科尔,NJ Rawlence, K格雷格,米克纳普,M统计,…
美国国家科学院学报》上115 (30),7771 - 7776

* *生态系统生物监测与埃德娜:metabarcoding在生命之树在热带海洋环境
M统计,乔丹Huggett, R; 8:32, JD DiBattista, TE浆果,SJ纽曼,……
科学报告7 (1),12240

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