调查整个微生物群落的基因组

使用NGS分析微生物组在人类健康和疾病中的作用

人类微生物组分析与NGS

人体微生物组分析是研究在人体内和体表发现的微生物群落。人类微生物组分析研究的目标是了解微生物在健康和疾病中的作用。下一代测序(NGS)推动了能够调查整个微生物群落基因组的研究,包括那些不可培养的生物体。


以前,研究人类微生物组样本依赖于时间和劳动密集型的微生物学技术,即培养和分离个体生物体,然后进行表型或基因型分析。用这些旧的方法对单个样品进行微生物群落分析是不可能的。

微生物转录组学,或亚转录组学,提供了对复杂样品中一组生物体编码的表达rna的关键见解。高质量的亚转录组学数据使研究人员能够量化基因表达变化,预测对特定治疗的耐药性或易感性,了解宿主-病原体免疫相互作用,并跟踪疾病进展。

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新一代测序技术的出现使几个备受瞩目的合作项目成为可能人类微生物组计划该公司已经发布了大量关于人类微生物组的数据,使用NGS作为基础工具。

NGS方法允许科学家对复杂的微生物群落进行无培养鉴定和分类。这些方法还可以加速在微生物组样本中发现新物种,并促进检测毒力和抗微生物药物耐药性基因。

用于分析人类微生物组的实验NGS方法包括:
霰弹枪宏基因组测序
  • 一种能够在给定的复杂微生物样品中对所有生物体的所有基因进行全面采样的DNA测序方法。
16S rRNA测序
  • 一种16S核糖体RNA基因测序方法,用于鉴定和比较给定样品中存在的细菌。
微生物metatranscriptomics
  • 对复杂样品中一组微生物编码的所有rna进行分析。
微生物组研究的基因水平宏基因组学
宏基因组学数据集

yobet亚洲了解从宏基因组测序数据集识别疾病相关微生物物种和菌株的基因水平生物信息学方法。塞缪尔·迈诺特博士还演示了一个交互式微生物群发现门户。

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微生物组测序在高宿主和
Low-biomass样品
微生物基因组测序

本次网络研讨会讨论了新兴的NGS方法,重点讨论了它们与微生物群落分析的相关性。斯蒂芬·j·格林博士解决了高宿主和低微生物生物量问题的实用方法。

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用超转录组学进行无偏倚微生物分析
亚转录组学概况汤娅·沃德和艾米丽·霍利斯特

看看dr。Diversigen和DNA Genotek的Tonya Ward, Emily Hollister和Le franois开发了亚转录组学研究的工作流程,并阅读了他们对该研究领域潜在影响的未来的看法。

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超转录组学:挑战与机遇

在本次网络研讨会中,您将听到三位该领域的领先专家分享他们对样品收集和处理,rRNA消耗和生物信息学分析的见解和关键考虑因素。

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科学家讨论基于ngs的微生物组研究

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