什么是16S和ITS rRNA测序?
16S和内转录间隔(ITS)核糖体RNA (rRNA)测序是常用的扩增子测序方法，用于识别和比较给定样本中存在的细菌或真菌。基于下一代测序(NGS)的ITS和16S rRNA基因测序是比较复杂微生物群落或难以或不可能研究的环境中样品系统发育和分类的成熟方法。
原核16S rRNA基因长约1500 bp，其中9个可变区分布在保守区之间。16S rRNA基因的可变区经常被用于不同微生物群体中属或种的系统发育分类。1rRNA顺反子的ITS1区域是宏基因组样品中识别真菌物种的常用DNA标记。2
16S测序方法指南
基于扩增子的下一代16S基因测序比基于毛细管测序或pcr的方法有一些优势。yobet亚洲了解它如何与本指南16S测序方法工作。
基于ngs的ITS和16S rRNA分析的优点
16S和ITS核糖体RNA NGS方法的一个关键优点是，它们提供了一种具有成本效益的技术来识别传统方法无法发现的菌株。与毛细管测序或基于pcr的方法不同，下一代测序是一种无需培养的方法，可以分析样品中的整个微生物群落。
16S rRNA NGS允许微生物学家在细菌群体的宏基因组调查中达到属级的敏感性。ITS分析与NGS能够快速鉴定真菌，有助于促进我们对真菌群落的理解。此外，NGS提供了在测序运行中组合多个样本的能力。
ITS和16S rRNA测序工作流程
Illumina提供支持基于ngs的16S和ITS rRNA分析研究的产品，从库准备到数据分析和解释。我们用户友好的工作流程可以帮助您的实验排除猜测。
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Nextera XT v2索引套件
多路样品驱动更大的样品吞吐量。
iSeq 100系统
负担得起，快速，可访问的测序能力，目标或小基因组测序在任何实验室。
MiSeq系统
快速，准确和简单的深远应用在微生物学。
BaseSpace应用分类分类
16 s宏基因组使用illumina管理的GreenGenes分类数据库，对16S rRNA靶向扩增子reads进行分类。
DRAGEN宏基因组管道对阅读材料进行分类，并提供单一样本和汇总报告。
