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Illumina DRAGEN Bio-IT平台

Illumina DRAGEN (Dynamic Read Analysis for GENomics) Bio-IT平台提供精确、超快速的二级基因组测序数据分析。阅读更多…
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本地服务器

Illumina DRAGEN服务器v3

20040619

价格

DRAGEN Server Lvl 11许可1年

20060397

要求定价

DRAGEN Server Lvl 2许可1年

20060398

要求定价

DRAGEN Server Lvl 3许可1年

20060399

要求定价

DRAGEN Server Lvl 4许可1年

20060400

要求定价

DRAGEN Server Lvl 5许可1年

20060401

要求定价
云:亚马逊网络服务

DRAGEN AWS第11级许可证有效期1年

20060402

要求定价

DRAGEN AWS Lvl 2许可1年

20060403

要求定价

DRAGEN AWS Lvl 3许可证有效期1年

20060404

要求定价

DRAGEN AWS Lvl 4许可1年

20060405

要求定价

DRAGEN AWS Lvl 5许可证有效期1年

20060406

要求定价
云:微软Azure

DRAGEN Azure Lvl 11年许可证

20060407

要求定价

DRAGEN Azure Lvl 2 1年许可证

20060408

要求定价

DRAGEN Azure Lvl 3 1年许可证

20060409

要求定价

DRAGEN Azure Lvl 4 1年许可证

20060410

要求定价

DRAGEN Azure Lvl 5 1年许可证

20060411

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总:

Illumina DRAGEN Bio-IT平台

Illumina DRAGEN Bio-IT平台

BioIT 2018

GeneDx

兴癌症护理

产品亮点

Illumina DRAGEN生物it平台提供:
  • 准确的数据:检测具有高分析灵敏度和特异性的小变异1
  • 无损基因组压缩:使用DRAGEN ORA (Original Read Archive)无损压缩将FASTQ文件大小减少到5倍
  • 强劲的速度:在大约25分钟内以30倍的覆盖率处理整个人类基因组2、3
  • 频繁的发布:包括定期增强和升级的版本
  • 各种应用程序:分析全基因组、外显子组和RNA的下一代测序(NGS)数据

Illumina DRAGEN Bio-IT平台和BaseSpace Sequence Hub上的数据提交应用程序也支持SARS-CoV-2数据工具包。亚博官网人口．

DRAGEN祭

DRAGEN谈Illumina Connected Analytics

在BaseSpace序列集线器DRAGEN

DRAGEN On-Premise服务器



德拉根在NextSeq 1000/2000

DRAGEN多云自带许可证

DRAGEN在AWS市场

关键特性

超快速次级基因组分析

DRAGEN平台可以在25分钟内以30倍的覆盖率处理整个人类基因组的NGS数据，而传统的基于cpu的系统则需要15小时。它创造了两项基因组数据分析的世界速度记录。2、3

有成本效益的解决方案

当在Illumina的BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上运行时，分析一个30倍基因组的成本约为5美元/个样本，而100倍覆盖的外显子组的成本约为3美元/个样本。

高度准确的结果

在2020年PrecisionFDA Truth Challenge V2中，DRAGEN在Illumina测序数据上获得了难以绘制区域和所有基准区域的冠军。1

多样化的应用程序

DRAGEN平台分析来自各种实验类型的测序数据，包括全基因组，全外显子组，种系和体细胞数据集，以及RNA测序实验。

无损基因组压缩

DRAGEN ORA (Original Read Archive)压缩技术针对FASTQ文件的高压缩比进行了优化，以及快速压缩和解压缩，同时保持数据完整性。

频繁的更新

频繁的发布不断扩展和改进DRAGEN平台，同时适应新的应用程序和不断发展的行业标准。DRAGEN更新是版本控制的，允许用户根据需要选择加入或退出新的更新。

DRAGEN在PrecisionFDA Truth Challenge V2中赢得关键类别

Illumina的DRAGEN团队激动地宣布在Illumina测序数据的难以绘制区域和所有基准区域中获得最佳性能。这次胜利标志着主要新功能的开始，这些功能将得到改进，包括结构变体、副本数量变体和重复扩展。我们的成功表明，我们现在可以以比在难以绘制的区域中认为可能的更好的精度来调用变体。

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利用DRAGEN平台的力量

DRAGEN平台使各种规模和学科的实验室能够利用他们的基因组数据做更多的事情。DRAGEN平台使用高度可重构的现场可编程门阵列技术(FPGA)提供基因组分析算法的硬件加速实现，如BCL转换、映射、对齐、排序、重复标记和单倍型变体调用。DRAGEN ORA无损基因组压缩技术可大大节省FASTQ文件的存储成本。DRAGEN平台的基本功能解决了基因组分析中的常见挑战，例如长时间的计算时间和大量的数据。

在不影响精度的情况下，DRAGEN平台提供了快速、灵活性和成本效益。DRAGEN平台的可重新编程特性使Illumina能够开发自定义算法，并允许改进以适应未来的应用。

关键DRAGEN应用

DRAGEN On-Premise服务器 BaseSpace Illumina Connected Analytics NextSeq 1000/2000 多云自带许可证
多路解复用(BCL转换)
DRAGEN ORA无损基因组压缩
地图和对齐
全基因组(生殖系和体细胞) 生殖系只
外显子组富集(生殖系和体细胞)
COVIDSeq
RNA病原体检测
RNA-Seq(基因融合与定量)
单细胞RNA
联合基因分型
甲基化
tso500液体
宏基因组
管道 描述 检测到的变体类型 度量提供了
DRAGEN多路分解 NGS分析的快速解复用 N/A N/A
DRAGEN压缩 DRAGEN ORA压缩优化了FASTQ文件的高压缩比，以及快速压缩和解压缩，同时保持数据完整性。 N/A
  • 压缩比
  • 运行时
DRAGEN地图+对齐 DRAGEN Map + Align可以单独运行，也可以作为DRAGEN管道套件的一部分运行 N/A
  • 映射指标
  • 时间指标
  • 覆盖率度量
DRAGEN生殖系 DRAGEN Germline Pipeline提供端到端NGS分析，包括先进的误差模型校准，以提高精度，并通过Illumina expansion Hunter重复扩展检测和基因分型。
  • SNV
  • CNV
  • SV
  • 重复扩张
  • 映射指标
  • 时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN体细胞 DRAGEN体细胞管道包括仅肿瘤和肿瘤正常模式，设计用于检测肿瘤样本中的体细胞变异。两种模式都没有倍性假设，可以检测低频等位基因。
  • SNV
  • CNV
  • SV
  • 三甲
  • MSI
  • HLA
  • 映射指标
  • 时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN浓缩 DRAGEN富集管道将DRAGEN的种系和体细胞调用程序结合到专门用于分析富集样品的管道中。包括一套完整的丰富指标和报告。
  • SNV
  • CNV
  • SV
  • 映射指标
  • 时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN RNA DRAGEN RNA Pipeline从剪接结发现和比对开始进行转录组分析，随后进行快速比对和剪接结映射和定量。对于差分表达式，Illumina推荐BaseSpace Sequence Hub上的DRAGEN差分表达式应用程序。
  • 基因融合
  • 映射指标
  • 时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN单细胞RNA DRAGEN单细胞RNA管道执行多路解复用、细胞条形码和UMI错误校正、序列比对和基因表达量化。 N/A
  • 映射指标
  • 时间指标
  • 覆盖率度量
  • Callability报告
  • 细胞指标
DRAGEN联合基因分型 DRAGEN联合基因分型/种群管道在多个基因组中联合调用变体，并以快速的速度和不影响的准确性扩展到大样本队列。
  • SNV
  • CNV
  • SV
  • 重复扩张
  • 映射指标
  • 时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN甲基化 DRAGEN甲基化管道执行对齐、甲基调用，并计算对齐和甲基化指标。 N/A
  • 映射指标
  • 时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告
DRAGEN参考构建器 接受FASTA文件，并构建DRAGEN应用程序使用的专有引用。 N/A N/A
DRAGEN TruSight肿瘤500 ctDNA分析软件 对Illumina TruSight Oncology 500 ctDNA的二次分析支持。仅在本地DRAGEN服务器上可用(版本3)
  • SNV
  • CNV
  • DNA融合
  • MSI
  • 三甲
  • 映射指标
  • 时间指标
  • 覆盖率度量
  • 变异指标
  • Callability报告

将生物信息学引入内部可以减少成本和周转时间

磷公司联合创始人兼首席执行官Alexander Bisignano介绍了该公司如何使用DRAGEN Bio-IT平台在现场以合理的价格进行基因组数据分析。

阅读面试
SARS-CoV-2 NGS数据工具包

Illumina正通过一个集成的软件工具包，使研究人员更容易检测和识别SARS-CoV-2，并将他们的发现免费贡献给社区。

亚博官网人口
SARS-CoV-2 NGS数据工具包

DRAGEN在Illumina的数据分析平台

DRAGEN on BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics将DRAGEN平台的速度和准确性与我们软件平台的安全性、成本节约和直观界面结合起来。

  • 针对不同专业水平的按钮分析
  • 流数据直接从仪器进行快速分析
  • 低成本，无需硬件投资
  • 利用BaseSpace Sequence Hub和Amazon Web Services (AWS)的安全性、遵从性和存储特性

yobet亚洲了解BaseSpace序列集线器

yobet亚洲了解Illumina Connected Analytics

在BaseSpace序列集线器DRAGEN

DRAGEN On-Premise服务器

与传统的基于cpu的系统相比，DRAGEN可在短时间内进行二次分析，同时仍保持较高的精度。

  • 本地分析和存储数据
  • 支持不同级别的命令行界面
  • 最多可更换30个传统计算实例
  • 在< 25分钟内以30倍覆盖率处理整个人类基因组的NGS数据
  • 一台设备可支持2台NovaSeq 6000系统满负荷运行

阅读数据表

DRAGEN内部

DRAGEN机载NextSeq 1000/2000

机载DRAGEN Bio-IT平台为二次分析提供了超快速、准确的解决方案。

  • 访问选择DRAGEN信息管道
  • 使用户能够在短短两小时内生成结果
  • 为各种基因组分析解决方案提供优化的硬件加速算法，包括BCL转换、映射、对齐、排序、重复标记和变体调用
  • 使用流水线算法减少对外部信息学专家的依赖

阅读数据表

DRAGEN多云自带许可证

AWS和Azure上的DRAGEN让您可以在首选云上的虚拟映像中访问DRAGEN软件。

  • 使用与DRAGEN On-Premise Server相同的软件和命令行选项(不包括TSO 500管道)
  • 适合希望将DRAGEN管道集成到现有云环境中的高级用户
DRAGEN内部
查看视频
DRAGEN-GATK最佳实践网络研讨会:深入研究基因组分析管道的改进

在本次网络研讨会上，Broad研究所的Eric Banks描述了在调查DRAGEN和GATK工具之间的差异时遇到的一些问题，重点介绍了在新的最佳实践管道中实现的方法的改进。

您还将了解该团队如何评估yobet亚洲管道的开源版本和授权版本(硬件加速)之间的功能等效性，并展示在相同源输入上的两种方法之间的结果。

查看会议记录

DRAGEN用例

GeneDx使用DRAGEN从外显子体到基因组

借助DRAGEN, GeneDx现在能够在保持低成本、短周转时间和高准确性的同时扩大其业务。

读文章
雷迪儿童医院

一项吉尼斯世界纪录诞生于最快的基因诊断19.5小时。DRAGEN平台被用于显著提高测序后绘制和校准基因组数据的速度。1

读文章
兴癌症护理

了解Basespace Sequence Hub和DRAGEN如何简化本实验室的NGS数据分析。

观看视频

读文章

DRAGEN应用程序

DRAGEN平台可用于生物科学的众多应用。

人口测序

快速分析测序基因组;随着计算工具的不断改进，加速再分析。

NICU和遗传疾病研究

减少基因组分析所需的时间，当快速结果可能是一个关键因素时。

癌症研究

准确、快速地分析肿瘤样本和肿瘤/正常样本。

Agrigenomics

分析动物和植物的不同基因组复杂性，使用提供的参考。

临床和转化研究

分析目标外显子组数据，快速周转和高精度，以确保重现性和高质量的结果。

参考文献
  1. fda真相挑战V2:在难以绘制的区域调用短读和长读的变体。precision.fda.gov /挑战/ 10．2020年11月3日访问。
  2. 生物IT世界。费城儿童医院埃迪科创造了二次分析速度的世界纪录。2017年10月23日。www.bio-itworld.com/2017/10/23/childrens-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed．2018年9月19日访问。
  3. 圣地亚哥联合论坛报。雷迪儿童学院创下吉尼斯世界纪录。2018年2月12日。www.sandiegouniontribune.com/news/health/sd -不-拉迪-记录- 20180209 - story.html．2018年9月19日访问。

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支持数据和数字

灵活且可定制的管道
DRAGEN生殖系管道步骤

DRAGEN提供了插入各种输入文件和生成一系列输出文档的灵活性。这种灵活性使用户能够自定义他们的体验，使用和生成他们想要的文件格式。

这张图以DRAGEN生殖系管道为例展示了步骤。每个管道的实际步骤各不相同。

产品文献

将Illumina DRAGEN Bio-IT平台集成到您的基础设施中

技术说明| PDF< 1mb

肿瘤外显子组测序与Illumina DNA Prep与富集和DRAGEN平台

应用说明| PDF1 MB

应用说明| HTML |5版本

Basespace测序中心应用程序快速指南

小册子| PDF< 1mb

基于BaseSpace Sequence Hub的DRAGEN Bio-IT平台

数据表| PDF1 MB

DRAGEN Germline管道规格表

数据表| HTML

复杂组织的高分辨率、高通量空间转录组学

应用说明| pdf3mb

数据表| PDF |5版本

手册和支持信息

所有德拉根生物it平台支持

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数据管理和简化生物信息学，用于实验室起步和快速扩展下一代测序(NGS)操作。


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Illumina Connected Analytics

一个模块化、安全的数据平台，用于可扩展的多组学数据管理、分析和探索，以发现解锁基因组力量的见解。


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BaseSpace Correlation Engine挖掘了超过23,000项(并且还在不断增长)科学研究，为您的研究获得基因、实验、药物和表型的数据驱动答案。


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