TruSeq DNA PCR-Free
简单,全包全基因组测序(WGS)图书馆准备提供准确和全面覆盖复杂的基因组。阅读更多…
图书馆准备
指数适配器
总:
提供更大的灵活性在订购单一组件库的准备,我们搬到一个模块化的配置。我们现有TruSeq DNA PCR-Free库准备工具包(猫。不。fc - 121 - 3001, fc - 121 - 3002, fc - 121 - 3003)将过渡到TruSeq DNA PCR-Free(猫。20015962 24号样品和猫。96年20015963号样品)图书馆准备。指数适配器将分别作为TruSeq DNA单一索引(猫。20015960号设置和猫。20015961号B)和TruSeq DNA CD(组合双)索引(猫。20015949 96索引)。
TruSeq DNA PCR-Free提供简单,全包库准备全基因组测序的应用程序。研究人员可以序列各种各样的生物,从人类全基因组小如细菌基因组。工作流提供:
在我们全基因组测序工作流程,TruSeq DNA PCR-Free提供优越的报道地区传统上难以序列,如GC-rich地区,推动者,重复的内容。
工作流是可调的各种阅读长度和支持在所有Illumina公司测序仪器。这允许研究人员调整每个运行实验的需要。
图书馆PCR-free意味着减少偏见和差异。结果是高数据质量和优化整个基因组变异检测。优秀的基因组覆盖率质量意味着你的结果有一些差距和好的GC-rich地区的报道。
去除PCR节省时间并移除基因组覆盖率偏见与PCR相关步骤。Bead-based大小选择缩短了工作流程。配合Illumina公司测序系统,TruSeq DNA PCR-Free提供了一系列增强广泛采用库工作流程做准备。
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 1样品/运行(基于30×人类基因组的报道) | 350个基点插入:≤2×100个基点 550个基点插入:≤2×150个基点 |
| HiSeq 2500系统 | 每运行样本2 - 10(双流细胞;基于30×人类基因组的报道) | 350个基点插入:≤2×100个基点(快速运行) 550个基点插入:≤2×250个基点(快速运行) 350个基点插入:≤2×100个基点(高输出) 550个基点插入:≤2×125个基点(高输出) |
| NovaSeq 6000系统 | 每运行样本(双重流细胞):S1: 8, S2: 16日,S4: 48(基于30×人类基因组的报道) | 350个基点插入:≤2×150个基点 550个基点插入:≤2×150个基点 |
| TruSeq DNA PCR-Free | Nextera DNA Flex图书馆准备装备 | TruSeq DNA纳米 | |
|---|---|---|---|
| 试验时间 | 5个小时总试验时间 | ~ 3 - 4个小时(从DNA提取标准化库) | ~ 6小时总试验时间 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 描述 | 一个简单的全套PCR-free准备全基因组测序研究的能力通过挑战性的区域的基因组序列。 | 一种快速、灵活的工作流为范围广泛的研究应用和样本类型,从人类微生物全基因组测序和更多。 | 一个低投入的研究方法是提供高质量的基因组覆盖率,减少偏见。 |
| 实践时间 | 4个小时 | 1 - 1.5小时 | ~ 4个小时 |
| 输入数量 | 1 ug DNA | 小基因组(如微生物):1 - 500 ng DNA。大型基因组(如人类):100 - 500 ng DNA。(血液和唾液,见参考指南)。 | 100 ng基因组DNA |
| 的作用机制 | 机械DNA碎片和适配器结扎。工作流是PCR-free gel-free。 | Bead-linked transposome | 机械DNA碎片和适配器结扎。工作流使用reduced-bias PCR和gel-free。 |
| 方法 | 基因分型结果进行排序,鸟枪测序,全基因组测序 | 扩增子测序,从头测序,鸟枪测序,全基因组测序 | 基因分型结果进行排序,鸟枪测序,全基因组测序 |
| 多路复用 | 24位单身96组合(CD)双24独特的双和96独特的双(UD)组合(很快) | 384独特的双(UD)组合和96组合双(CD)的组合 | 24位单身96组合(CD)双24独特的双和96独特的双(UD)组合(很快) |
| 专门的样本类型 | 不是FFPE-Compatible | 血,不是FFPE-Compatible,唾液 | 低投入的样品,而不是FFPE-Compatible |
| 物种分类 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他工厂,老鼠 | 任何物种,细菌、果蝇、人力,哺乳动物,老鼠,线虫,植物,老鼠,病毒,酵母,斑马鱼 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他工厂,老鼠 |
| 物种的细节 | 兼容大部分DNA基因组。 | 兼容任何物种 | 兼容大部分DNA基因组。 |
| 插入目标大小 | 350个基点和550个基点 | ~ 500个基点 | 350个基点和550个基点 |
| 产品 | TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA纳米 |
|---|---|---|
| 产品版本 | 低吞吐量(LT)和高通量(HT) | LT和HT |
| 描述 | 图书馆综合基因组覆盖率减少偏见和覆盖区域(相比,pcr选项) | 基于广泛采用TruSeq图书馆准备,较低的输入和数据质量改进(与之前相比TruSeq套件版本) |
| 自动化的选择 | LT工具包:人工工作流 HT工具包:Automation-friendly;手动协议也可 |
LT工具包:人工工作流 HT工具包:Automation-friendly;手动协议也可 |
| 输入数量 | 1 - 2μg | 100 - 200 ng |
| 包括聚合酶链反应 | 没有 | 是的 |
| 试验时间 | ~ 5小时 | 5.5小时 |
| 实践时间 | ~ 4个小时 | 4个小时 |
| 插入目标大小 | 350个基点和550个基点 | 350个基点和550个基点 |
| Gel-free | 是的 | 是的 |
| 支持的样本数量 | 24 (LT)或96 (HT)样本 | 24 (LT)或96 (HT)样本 |
| 尺寸选择珠子 | 包括 | 包括 |
| 应用程序 | 全基因组测序的应用程序,包括全基因组重测序,新创大会,和宏基因组研究 | |
| 样品多路复用 | 24位单身96组合(CD)双24独特的双和96独特的双(UD)的组合 | |
| 兼容的Illumina公司测序 | MiniSeq、MiSeq NextSeq、HiSeq NovaSeq HiSeq X, HiScanSQ系统 | |
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