NextSeq 550系统排序性能参数
| NextSeq 550系统高输出装备* | * NextSeq 550系统Mid-Output工具包 | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 读取长度 | 总时间__ | 输出 | 读取长度 | 总时间__ | 输出 |
| 2×150个基点 | 29个小时 | 100 - 120 Gb | 2×150个基点 | 26小时 | 32.5 -39 Gb |
| 2×75个基点 | 18小时 | 50 - 60 Gb | 2×75个基点 | 15小时 | 16.25 - -19.5 Gb |
| 1×75个基点 | 11小时 | 25 - 30 Gb | |||
*安装规范基于Illumina公司PhiX控制库支持集群密度(129至165 k /毫米²集群通过过滤器)。基于样本实际性能参数可能不同类型、样品质量、和集群通过过滤器。所有NextSeq 550包paired-end有能力。
†总时间包括集群生成、测序和基地呼吁NextSeq 550系统启用双面扫描。
读通过过滤器
| NextSeq 550系统高输出设备 | NextSeq 550系统Mid-Output工具包 | |
|---|---|---|
| 单一的读取 | 4亿 | 1.3亿 |
| Paired-End读取 | 8亿 | 2.6亿 |
质量分数组合
| NextSeq 550系统高输出设备 | NextSeq 550系统Mid-Output工具包 |
|---|---|
| > 75%基地高于Q30 2×150个基点 | > 75%基地高于Q30 2×150个基点 |
| > 80%基地高于Q30 2×75个基点 | > 80%基地高于Q30 2×75个基点 |
| > 80%基地高于Q30 1×75个基点 |
质量分数(Q-score)是一个组合的预测错误的概率基本调用。基地的比例> Q30平均在整个运行。
估计样品关键应用程序吞吐量
| NextSeq 550系统高输出设备 | NextSeq 550系统Mid-Output工具包 |
|---|---|
| 1人类全基因组 | 3外显 |
| 12外显 | 12浓缩面板 |
| 16个转录组 | 96年扩增子面板 |
NextSeq 550系统阵列扫描参数
| 数组 | 每个阵列扫描时间 | 每个样本的扫描时间 |
|---|---|---|
| 英飞纳姆MethylationEPIC BeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
| 英飞纳姆cytosnp - 850 k BeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
| HumanCytoSNP-12 BeadChip | 40分钟 | 3.3分钟 |
| 英飞纳姆HumanKaryomap-12 BeadChip | 40分钟 | 3.3分钟 |
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