实体瘤的分子分析
分子图谱的出现克服了传统实体肿瘤分类方法依赖肿瘤细胞和周围组织形态的局限性。1今天，根据美国病理学家学会(CAP)制定的指导方针，分子谱分析已成为实体瘤分类的标准技术。2以及国家综合癌症网络(NCCN)。3.
反过来，基因组技术已经发展到满足分子分析的需要。下一代测序(NGS)提供了一种全面的方法来评估与实体肿瘤相关的大多数基因，包括肺癌、结肠癌、乳腺癌、黑色素瘤、胃癌和卵巢癌。NGS在捕获肿瘤异质性方面也具有很高的敏感性，这是其他方法如Sanger测序经常遗漏的。4
NGS的好处
使用NGS进行肿瘤分析，根据已知的实体肿瘤参与程度，分析选定的一组基因、基因区域或扩增子。这种靶向方法提供了检测罕见突变和肿瘤亚克隆的高灵敏度，增加了对癌症重要驱动突变的可见性。
用一种方法回答多个问题
Ravindra Kolhe博士使用TruSight Tumor 170研究与许多不同实体肿瘤相关的大量变异。
快速NGS工作流程
使用NGS分析实体肿瘤遵循一个简单的工作流程，可以轻松扩展到数百个样本。临床研究实验室从DNA到报告大约需要40小时。该工作流程使用单一测序仪器，最大限度地减少实验室验证步骤，无缝集成到临床研究实验室设置。
精准肿瘤研究的多药物方法
Avera Health的临床研究人员使用DNA和RNA测序来分析实体肿瘤，并发现多种药物敏感的肿瘤通路。
我们的产品
Illumina的产品使临床癌症研究实验室能够使用最新的技术来找到准确的答案，同时无缝地将NGS集成到实验室程序中。文库制备试剂盒与归档实体肿瘤组织兼容，可以轻松缩放处理大样本量。
Illumina测序仪提供行业领先的测序，产生约90%的全球测序数据。*高效的报告功能使实验室能够以标准格式注释、分类和交流重要发现。
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TruSight肿瘤170
综合面板检测有助于实体瘤进展的单核苷酸变异(SNVs)、扩增和融合。
TruSight肿瘤学UMI试剂TruSight肿瘤学UMI试剂和UMI Error Correction App将样本的错误率降低到≤0.007%，能够检测出低频变异。
TruSight肿瘤15聚焦小组在一个简单的，从样本到数据的工作流程中评估相关实体肿瘤的体细胞变异。
TruSight RNA泛癌以1385个癌症相关基因为目标，在包括FFPE在内的大多数肿瘤样本类型中进行基因表达、变异和融合检测。
TruSight RNA融合一个基因融合检测面板，针对多种癌症类型的融合相关基因，具有检测已知和新的融合基因伙伴的能力。
TruSight肿瘤学500针对多种变异类型的检测，包括肿瘤突变负担(TMB)和微卫星不稳定性(MSI)，即使来自低质量的样本。
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2
目标研究小组调查了50个已知与癌症相关的基因的热点区域。
Ilumina焦点面板的AmpliSeq靶向DNA和RNA研究小组调查了52个已知与实体肿瘤相关的基因。
AmpliSeq for Illumina综合面板v3靶向DNA和RNA研究小组调查了与一系列癌症类型相关的161个基因的变异。
Illumina综合癌症小组的AmpliSeq目标研究小组调查409个已知与癌症相关的基因的外显子区域。
NGS目标富集基因组中与特定研究兴趣相关的目标区域。
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参考文献
- Cross D, Burmester JK。分子图谱在癌症鉴别和治疗方面的前景．临床医学保留区．2004; 2:147 - 150。
- Lindeman NI, Cagle PT, Beasley MB，等。肺癌患者选择EGFR和ALK酪氨酸激酶抑制剂的分子检测指南:来自美国病理学家学院、国际肺癌研究协会和分子病理学协会的指南．胸肿瘤杂志．2013; 8:823 - 859。
- NCCN肿瘤学临床实践指南
- Jamuar SS, Lam AT, Kircher M，等。大脑皮层畸形的体细胞突变。英国医学杂志2014;371:733-43。
*文件中的数据计算。yobet亚洲Illumina公司2015年。