罕见病基因组学和精准医学
了解罕见疾病的基因组学可以帮助医生找出未确诊疾病的病因，帮助家庭避免数年的医院就诊和不必要的检查。尽管全球对罕见病的定义各不相同，但每2000人中就有1人感染罕见病。1,2已知的罕见病有7000多种3.每年都会发现。总的来说，2-6％的人口（> 1.5亿人）受罕见疾病的影响。3,4,5.
平均而言，罕见的疾病诊断 - “诊断奥德赛” - 5至7年，68医生,7还有2到3个误诊。7鉴于80%的罕见疾病是遗传的或具有遗传成分，全面的基因组测序增加了发现患者潜在病因的潜力。8下一代测序(NGS)提供了诊断罕见疾病的最高可能性9、10也是结束诊断奥德赛的最快途径。9
基因组学在罕见病诊断中的价值
基因组学正在推动罕见病诊断的根本转变，从症状分析到分子病原学评估。了解疾病的生物学基础可以带来更好的护理和有针对性的治疗，具有可预测的、基于证据的结果。这类分子诊断在罕见病基因组学中是精准医学的基础。
罕见病的分子诊断是一个关键步骤，可以使患者、他们的家人、医生和其他护理提供者受益。根据美国遗传学和基因组学学院(ACMG)的说法，对个人疾病的遗传病因的识别对患者、他们的家庭和整个社会都有好处。11
罕见疾病基因组学的好处
定制的疾病管理
对罕见疾病机制的了解使医生能够将患者转介到适当的专家，选择量身定制的治疗方法，并提供针对特定疾病的随访。
减少费用
通过避免冗长的诊断过程，对罕见疾病的基因组诊断可以帮助防止昂贵的检测和程序，并限制不必要的转诊。
生殖咨询
确定一种罕见疾病的遗传模式可以告知患者及其直系和大家庭的复发风险，支持知情的计划生育。
社会心理的好处
除了避免与诊断疾病相关的应激外，在罕见的疾病支持群体群落中，接受分子诊断将受影响的家庭带来。
社会福利
了解稀有疾病的基因组学，可以帮助识别新的药物目标并提高护理效率。
罕见疾病诊断的基因组方法
稀有疾病的全基因组测序
全基因组测序是稀有疾病测试最全面的方法。它检查了整个基因组，并具有评估基因组的编码和非编码区域中的变体的能力。第12 -
罕见病全外显子组测序
全外显子测序评估与疾病相关的变异基因的外显子，即基因组的编码区域。9, 10年,20年
罕见疾病的靶向测序
靶向测序分析与罕见疾病或稀有疾病家族相关的特定基因。
染色体微阵列
染色体微阵列(CMA)技术识别大的染色体变异和特定的，在基因组中描述良好的变异。
比较罕见疾病诊断的基因组方法
诊断产量是比较罕见疾病基因组检测方法最常用的统计量。这指的是一项检测将提供建立分子诊断所需信息的可能性。根据被研究的患者群体和入选标准，诊断产量可能有显著差异。
全基因组测序
在大多数研究中，全基因组测序(WGS)显示出所有方法中最高的诊断产量。它广泛地覆盖了基因组(> 97%)，并能够检测多种变异类型(单核苷酸变异、吲哚、结构变异、拷贝数变异、重复扩增、线粒体变异和副对数)。第12 -
Whole-Exome测序
全外显子组测序(WES)具有第二高的诊断产量。与WGS相比，WES的基因组覆盖率更低(约占基因组的1.5%)，检测的变异类型更少。然而，WES比WGS更便宜，而且通常有更高的偿还率。9, 10年,20年
有针对性的测序
罕见病的靶向测序评估特定的基因。最大的面板覆盖不到0.5%的基因组。
染色体微阵列
染色体微阵列方法涵盖基因组的<0.01％。CMA专注于基因组的区域，具有特征良好的疾病的疾病变异。CMA往往比WES和WGS显着降低诊断产量。9
在线课程：稀有疾病中的临床测序
本课程概述了小儿罕见病、可用的检测方法和基因组测序的临床应用。这可能与实验室提供者、医疗保健提供者、医疗保健组织和其他对罕见疾病人群基因组学综述感兴趣的人有关。这门课程是通过Illumina的教育拨款才得以实现的。
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罕见疾病基因组学专题新闻
罕见病患者的进展
蓝十字蓝盾协会(Blue Cross Blue Shield Association)的技术审查组织Evidence Street®发布了一份支持全基因组测序的积极评论。
项目熊宝宝
这一试点项目通过迅速查明罕见疾病的病因，为重症监护的婴儿提供服务，为婴儿和家庭带来希望。
新生儿疑似罕见病的临床试验
NICUSeq是一项多中心研究，评估全基因组测序是否可以改变急性疾病新生儿的临床护理。
精密基因组学对稀有疾病的影响
逃离地狱边缘地带
在这一集播客中，来自澳大利亚无名称综合症(SWAN)的Heather Renton讨论了她女儿的罕见疾病，诊断的奥德赛，以及NGS的影响。
来自Illumina的希望信息
Covid-19为面临罕见疾病的家庭带来了额外的挑战。我们认识到珍稀疾病界的负担，并致力于结束诊断奥德赛。
一位母亲寻求诊断
舒宝小时候就患有高张力症。全基因组测序在他的两个副本中都发现了一个变体PDHX基因，导致量身定制的治疗。他几乎立刻就有了进步。
参考文献
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