Enancio

Enancio是Illumina最近收购的一家公司，拥有专门为基因组数据设计的专有无损数据压缩技术。

压缩技术将分阶段集成到Illumina的产品组合中，用户可以选择制作比FASTQ .gz1小5倍的FASTQ压缩文件。压缩在NextSeq 1000/2000上已经可用。从v3.8版开始，DRAGEN服务器上也将提供压缩，并将压缩FASTQ文件导入DRAGEN映射器。

在NGS工作流中，你可以选择启用压缩来生成压缩的fastq。ora文件。随着DRAGEN v3.8的发布，fastq。ora文件可以直接通过DRAGEN映射器进行无缝集成。fastq。Ora文件也可以动态解压缩，以用于其他映射和下游分析。DRAGEN BCL转换中的压缩集成简化了工作流程，如下图所示:

ORA压缩技术在DRAGEN内使用

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在收购Enancio之前:压缩作为一个独立的软件。压缩是一个额外的步骤。

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压缩技术的输出是一种新的压缩FASTQ二进制文件格式:FASTQ .ora。这种文件格式可以存储和共享，以显著节省存储成本和减少文件传输时间。所有压缩文件都可以用免费提供的解压软件．

Fastq。ora文件可以动态解压缩，用于映射和下游分析，并将很快被DRAGEN直接摄取。

一个235gb的FASTQ原始文件可以通过gzip压缩到55gb。使用DRAGEN ORA压缩技术，数据占用进一步减少到11 GB²．

Fastq文件和BAM或CRAM文件的存储通常是出于不同的目的。然而,fastq。ora文件使您能够存储原始数据的压缩副本与保存的MD5和更小的占用比相应的CRAM文件。

DRAGEN现在可以启用两种不同格式的压缩:FASTQs和BAMs到fastq。ora和CRAM。

压缩的利用是完全可选的。DRAGEN用户仍然可以自由地采用他们想要的存储策略:激活转换为Illumina FASTQ压缩文件格式并存储这些文件，禁用转换为DRAGEN ORA压缩文件格式FASTQ。或存储BAM或CRAM文件。

是的。随着DRAGEN 3.8发布，压缩是完全无缝和压缩fastq。ora文件被直接导入DRAGEN映射器。

此外,一旦免费的压缩软件，可以使用一个简单的命令直接将解压缩的输出动态管道输送到广泛的流行映射工具，如BWA^3.,明星⁴,领结⁵．

DRAGEN ORA FASTQ支持共享FASTQ压缩文件。的解压缩软件是免费的。一旦安装了免费的解压缩软件，就可以使用一个简单的命令直接将解压缩的输出传送到各种流行的映射工具，如BWA^3.,明星⁴,领结⁵．