如果我们想控制美国的COVID-19大流行，我们必须广泛提供SARS-CoV-2检测。如果不进行检测，公司、学校和公共卫生官员就会盲目行动，社区传播可能会继续有增无减，直到开发出有效的疫苗和/或人群免疫力限制病毒传播为止。

为了帮助大规模测试，Illumina最近加入了美国国立卫生研究院的快速加速诊断项目(亚博下载appRADxSM)的倡议，并将推出我们自己的COVID检测服务。我们相信这些努力将有助于缩小检测差距，并提供可操作的测序信息，为病毒控制提供信息。

扩大COVID检测一直是一个巨大的挑战。今年早些时候，哈佛大学萨弗拉伦理中心建议我们这样做6月份每天需要500万次测试在美国，到秋季，每天将增加到2,000万。洛克菲勒基金会提议增加到到秋季，每周3000万美元．其他人则建议采取更温和的措施每天50万但仍预计会有更大的需求。

但是仅仅进行测试是不够的。这些预测的变化是基于对病毒基本繁殖价值的假设，以及社交距离和接触者追踪计划的有效性。这些努力必须同样有力。

截至8月25日，美国报告了7960万例检测9%的测试呈阳性．在过去的两个月里，测试介于479,000和927,000．虽然目前的测试能力满足较低的范围，但我们仍然比较高的测试建议低10到20倍。

这是持续的紧急情况成功控制COVID-19的国家很早就开始接受检测，并经历了这一过程低检测阳性率(即阳性检测除以所有检测* 100):新西兰0.4%，台湾0.6%，澳大利亚0.6%，韩国1.5%。

的世界卫生组织(世卫组织)建议，阳性率应保持在3%至12%之间，并必须与积极的接触者追踪和隔离相匹配。美国的阳性率为9%，符合世卫组织的标准，但只提供了所需检测的10%，与其他成功遏制COVID-19的国家相匹配。

Illumina一直专注于帮助我们的客户利用下一代测序(NGS)来满足不断增长的检测需求;但是，我们预计检测将持续短缺，并将通过我们的COVID检测服务直接做出贡献。对于消费者来说，可以通过雇主和卫生机构使用Illumina的COVID检测服务进行检测，价格与大多数基于pcr的检测大致相同。

使用FDA根据紧急使用授权授权的检测和诊断COVID-19的COVIDSeq测试，我们将在美国发展每天48,000次测试的能力。对于大多数阳性样本，还将开发SARS-CoV-2全长序列用于研究目的。除了帮助提高美国的诊断能力外，这项服务还将生成数以千计的病毒序列。随着病毒的不断进化和疫苗的临床应用，这一点将变得越来越重要。此外，由于FDA已授权在NovaSeq 6000测序系统以及NextSeq 500、NextSeq 550和NextSeq 550Dx(在RUO模式下)系统上使用COVIDSeq，许多经CLIA认证可进行高复杂性测试的实验室也可以提供诊断结果和SARS-CoV-2序列。大容量测序有可能彻底改变公共卫生接触者追踪和COVID-19和未来病原体的大流行控制。

这些国家最成功的为了控制大流行，早期检测、隔离、追踪接触者，并制定了全国性的社交距离措施。除非接触追踪可以在确定感染者后的两到三天内有效执行在美国，这些努力可以减缓，但不会阻止病毒的传播。实时NGS可在历史上首次实现有效的接触者追踪和疫情管理，并突出可能影响诊断和疫苗有效性的病毒变化。

在美国，接触者追踪基本上失败了由于公共卫生基础设施不足，获得诊断检测的机会有限或延迟，以及无症状感染者的比例相对较高。

随着我们的COVID检测服务的增加，我们将开始每周生成数千个COVID-19序列。在RADx的部分支持下，这项工作可以整合到公共卫生工作中，使大规模主动基因组监测成为现实。

这些数据可以帮助学校和企业安全开学，并有助于预防未来的疫情爆发。如果将COVID - 19检测服务纳入公共卫生工作，可以帮助实现国家科学，工程和医学科学院实现国家大流行应对战略现代化的愿景。

我为我们所取得的成就感到自豪。我们的许多进步使测序变得负担得起、可扩展和准确，从而实现了基于ngs的诊断检测，特别是COVIDSeq。随着我们推出高通量Illumina COVID检测服务，以及clia认证的实验室采用COVIDSeq，美国将更好地展示这种能力如何控制当前和未来的大流行。