诊断测试和监控至关重要,补充策略以对抗病原体暴发Illuma首席医学官Phil Bobbo讨论顺序监控在打击COVID-19中的重要作用

问题:是什么差分诊断测试与监控测试之间

A级诊断检测帮助临床医生管理病人并需要监控管理人群

• 诊断测试为个体病人提供重要的回答是/否,以便提供恰当的管理
• 监控帮助公共卫生官员跟踪疫情路径,理解传播路线,确定病毒进化速度,并理解病毒是否以影响治疗效果的方式变化

问题:我们如何使用测序监控打击SARS-COV-2

A:五大方法测序用于打击SARS-COV-2

1. SARS-Cov-2确定为病毒,引起武汉呼吸道疾病集群.深散弹测序没有偏向性,并可用鼻水板和其他样本检测非宿主基因组素材,然后可编集成潜在的诱因物序列快速识别病毒近似蝙蝠中流行的corona病毒,但也显示附着宿主细胞所涉蛋白质突变,帮助解释病毒感染人体细胞的能力^一号最近分析性质SARS-COV-2通过自然选择机制开发宿主物种,尽管从蝙蝠到人的确切路径仍然不确定²设计诊断测试PCR探针需要重要序列
2. 顺序分析对跟踪病毒全球传播路线十分必要2434+基因组提交共享全流数据全球倡议并识别集群和传输路线³帮助公共卫生实体决策如何控制并控制病毒举个例子特雷弗·贝德福德博士计算生物学家Fred Hutchinson癌症研究中心西雅图显示,39例中,35例来自中国单例介绍,其余4例来自欧洲和伊朗⁴西雅图区没有单一介绍,而是多点介绍,表示封存努力不能只侧重于跟踪最常态集群的接触情况,并需要采取更积极的措施来控制病毒传播。
3. 分层判定病毒传播速度SARS-COV-2显示它传播时每月实现两次变异信息允许公共卫生官员识别病毒有多么可能避免从已有PCR测试检测并成为抗治法者⁵
4. 顺序识别目标治疗.了解病毒基因组对理解从小分子治标病毒蛋白到防病毒抗原疫苗的治疗效果至关紧要举例说,SARS-COV-2序列显示,以前开发用于SARS感染的药物,以主病毒前科为对象,在SARS-COV-2中可能有效,因为前科中总体遗传特征达97%疫苗不太可能有效,因为高抗原表蛋白差异很大(76%完全相同)。^6,7
5. 分层监控需要理解并发作用CoVID-19从无机到致命不等呼吸病原体常通过降低宿主免疫力并发并发致更严重威胁生命的疾病而引起累进性疾病仍然很早时,我们听说普通犀牛病毒和较不常见但更危险的呼吸道同步病毒正在通过测序检测确定正例常见并发致大病时,理疗重点可能是并发,而不是SARS-COV-2⁸

这些能力使监控对跟踪疾病和确定控制流行病和管理人口的最佳方式至关紧要

深入深入追踪日光病毒变异传播本国家地理文章贝德福德和波波