2020年9月14日
根据一项开创性的举措，澳大利亚公共卫生实验室的目标是对澳大利亚所有COVID-19阳性检测的病毒基因组进行排序，并在全国各地(而不是逐个州)利用基因组追踪COVID-19。
自COVID-19大流行开始以来，Illumina的下一代基因组测序技术(NGS)一直被用于支持研究，包括治疗和疫苗开发、诊断、筛查和监测应用。现在，Illumina正与传染病基因组学网络(CDGN)合作，使用NGS跟踪澳大利亚的COVID-19，这能够实现实时数据共享和整合，以更好地了解病毒的传播和传播。
由于下一代测序技术的精确性，这项研究将为我们更好地了解COVID-19的行为、传播和进化提供帮助。
新南威尔士大学联合教授、高级医学病毒学家比尔·罗林森表示，该研究项目将解决澳大利亚国家实施COVID-19基因组学的迫切需求。
“由于下一代测序技术的精确性，这项研究将为我们更好地了解COVID-19的行为、传播和进化。该项目将使我们能够衡量使用该技术不仅对COVID-19大流行的影响，而且对未来的应对措施的影响，”罗林森教授说。
除了通过新南威尔士大学(新南威尔士大学悉尼分校)获得的330万澳元的医学研究未来基金(MRFF)拨款外，Illumina公司还将为该项目提供价值超过200万澳元的基因组测序系统和相关耗材。这些系统预计将于下周交付给Doherty研究所、威斯特米德医院、新南威尔士亲王医院的新南威尔士卫生法医和科学服务中心，从而扩大新南威尔士、维多利亚州和昆士兰州四个主要公共卫生实验室的病原体测序能力。包括COVID-19样本。
Illumina首席医疗官Phil Febbo博士说:“这是一个领先的全球范例，将证明基因组学监测在理解和帮助控制COVID-19大流行方面的独特价值。Illumina很高兴能成为这一努力的重要合作伙伴。”“该项目将允许在各州和地区使用生物信息学共享重要病原体数据，确保病毒和其他病原体的测序不局限于这场大流行，而是将继续在学术研究和公共卫生系统中扩展。”
该项目的其他好处包括能够识别澳大利亚人群中的COVID-19突变，从而为治疗方案和疫苗的设计提供信息，以及能够准确识别持续感染、再感染或非活性感染。这对医护人员具有特殊意义，有助于保护一线工作人员和弱势患者的能力。
“CDGN一直在努力建立一个全国性的病原体基因组计划，这将有助于该项目的快速实施，确保基因组分析在全国范围内的获取和一致性。”墨尔本大学教授Ben Howden说，他是CDGN的联合主席和多尔蒂研究所公共卫生实验室微生物诊断单元主任。亚博下载app“关于导致COVID-19的病毒在全国传播的信息，对于告知澳大利亚未来的公共卫生应对措施非常重要。”
在全球范围内，Illumina NGS技术一直处于大流行的第一线，用于高通量测序，有可能彻底改变COVID-19和未来病原体的公共卫生接触者追踪和大流行控制。位于英国剑桥的Illumina实验室与英国基因组学公司合作为了对多达3.5万名COVID-19患者的基因组进行测序，新德里的基因组与整合生物学研究所(Institute of Genomics & Integrative Biology)已经完成了这项工作验证了Illumina的COVIDSeq检测方法上海公共卫生临床中心和Illumina最近开设了sphc - illumina微生物测序研究与应用示范中心在上海,中国。为了帮助大规模检测，Illumina最近还加入了美国国立卫生研究院的快速诊断加速项目(RADxSM)，并将推出自己的项目亚博下载appCOVID测试服务．
费博博士说:“COVID-19疫情的爆发是一个重要提醒，国际社会必须加强国家和国际项目，及早发现并应对未来的疾病暴发。”
病原体基因组学可以揭示原本可能被忽略的信息，包括快速了解COVID-19的行为、传播和进化。澳大利亚国家COVID-19跟踪系统将立即应用于疫情调查，包括识别新出现的疫情和传播事件，作为减少社区传播努力的一部分。
