多重耐药性菌蔓延在我们的医院

在第一幕诡异的HBO节目最后的我们教授在1960年代警告说,如果全球气温继续上升,某些种类的真菌致病的植物可以进化复制在人体温度的能力。接下来的僵尸爆发是由一个虚构的现实生活中的寄生真菌的变化冬虫夏草但教授名字也检查的其他威胁之一假丝酵母。

大部分的200种假丝酵母是无害的。酵母无处不在我们的皮肤和肠道菌群。通常我们的免疫系统使他们从失控,但是当他们这么做在大多数阴道酵母菌感染,引起的白色念珠菌- - - - - -我们有有效的抗真菌药物,通常由一组称为“唑类。”

白念珠菌感染人类自古以来一直在。然而,假丝酵母耳在2009年被首次发现。这三个物种的四种已知演化支对唑类,没有专门的实验室设备,医生很容易识别错了并不能准确地报告其传播。免疫系统健康的人可以避免生病,但他们仍然可以携带孢子的皮肤,特别是医院和疗养院。

与COVID-19一样,人老了,免疫力低下,或另一个严重的疾病危险特别大c .奥瑞丝侵入血液循环系统,神经系统,和多个器官。一个病人有念珠菌病的时候,他们的死亡率从30%到60%不等。c .奥瑞丝已经扩散到每一个有人居住的大陆;疾病控制和预防中心(CDC)警告说,它提出了一个严重的全球卫生威胁。和科学尚未发明人类抗真菌感染的疫苗。

关闭会话小组在今年的公共卫生实验室传染病协会会议关注新发传染病。面板,内华达国家卫生实验室分子主管安德鲁•Gorzalski博士报道最大的爆发c .奥瑞丝在美国历史上,2021年开始在内华达州南部。

“我的实验室主任,他说,每个人都开始非常严重看起来脸上的担忧,”他回忆说。“我五天后,CDC升级c .奥瑞丝类别的迫切威胁。”

通常,当细菌培养使其耐药突变,其生长和繁殖的能力是有限的,因为蛋白为靶标抗生素对细胞结构和维护至关重要。“可怕的部分c .奥瑞丝是这些突变似乎并不影响其健康,”Gorzalski解释道。”似乎天生就有这些抗性一流的抗真菌药物,也不影响它能够感染人,或者住在表面。内华达州南部通过Illumina公司测序,我们看到它开始进化出抗药性实时第二课堂。”

知识就是力量
所以我们能做些什么,在战斗中一个大流行,为了防止另一个?我们迄今为止的最佳工具是监测:我们需要知道哪些演化支c .奥瑞丝感染人,,缓慢的扩散。

在大流行之前,c .奥瑞丝在14个州了。两年后,它已蔓延到26日,而这仅仅是一个病例被报告给疾控中心的全国法定传染病监测系统。尽管它仍然危险,28个国家- - -包括内华达州-仍然不需要医院报告c .奥瑞丝感染。和那些做的,确实需要确认病人的样本包含c .奥瑞丝而不是其他假丝酵母物种。

这就是基因测序证明必不可少的。“我们买了很多测序来处理大流行,“Gorzalski说,“突然间,序列c .奥瑞丝经常,很高兴有一个NovaSeq。“Illumina公司NovaSeq内华达州州卫生实验室目前有6000,两个MiniSeq系统,两个iSeq 100系统,和MiSeq系统。”,我们计划在1000年把NextSeq真的提高周转时间。”

不言而喻的快速反应是多么重要战斗爆发。“我们得到测序结果的速度比我们从我们的地区获得敏感性结果返回实验室,这使我们能够确定那些遗传型的感染耐药,然后将信息传给流行病学家。”

与测序数据,研究人员可以识别基因带来未知的药物抵抗和机制反过来,创建屏幕这些基因的测试,不仅检测是否c .奥瑞丝是出现在一个人的皮肤,但是否耐药特定进化枝。

得到这个词
内华达州面临国家卫生实验室c .奥瑞丝正面:1100例c .奥瑞丝在内华达州南部,1000年实验室测序。“我们基本上是建立首开先河的数据库,“Gorzalski说。“一切我们序列是把国家生物技术信息中心。我们还开发了开源免费使用的科学工作流,任何人。”

他解释说,目前最重要的州没有感染所能做的就是建立筛查:简单的聚合酶链反应试验诊断,拭子从病人的腋窝和腹股沟可以识别早期真菌。很多州已经实现废水监测跟踪COVID-19的存在由一个特定地区市政水地区,或“sewershed”——同样的监测也可以发现少量的c .奥瑞丝DNA。“这酵母可以很容易地在皮肤上,”他说,“所以这将使其进入废水从洗澡的人。一个病人来自内华达州南部到另一个州,并立即检测c .奥瑞丝在废水。“科学家们可以跟踪的遗传学微量sewershed回到医院。

健康预警系统越多,它们可以做了更好的准备。“我们正在做更多的沟通,Gorzalski说,“这样其他实验室更准备当这开始发生在他们所在的州。我们只是试图获取信息,因为很多其他国家很快就会处理这个。”