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微生物基因组学

芝加哥谢德水族馆研究微生物对海洋生物的影响

这是首个同类项目,旨在识别微生物群落,以改善水生动物的健康

芝加哥谢德水族馆研究微生物对海洋生物的影响
9月27日

任何生物都有DNA,无论它生活在陆地上、空气中还是水中。我们采访了Bill Van Bonn, DVM,动物健康部副总裁谢德水族馆来了解他们的微生物组项目。yobet亚洲在格兰杰基金会的支持下,与阿贡国家实验室、伊利诺伊大学、伊利诺伊理工学院和美国农业部合作,这个创新项目正在使用IlluminaMiSeq系统为了研究与水族馆动物共享环境的无数看不见的生物之间的独特关系。

微生物组项目的目标是什么?它是如何开始的?

我们的微生物组项目旨在了解我们如何操纵环境栖息地,以创造最适合动物健康的微生物群落。该项目诞生于多年的观察,这些观察强调需要更好的数据来了解管理环境对微生物群落的影响。特别是,我们对鲸鱼、海豚和鼠海豚等鲸类动物的研究让我们怀疑(就像人类健康一样),一个管理严密或消毒过的环境可能不如一个有利于微生物群更多样化的环境有益。

MiSeq系统对你的研究有何帮助?

谢德水族馆是一个公共展示设施,每年有超过200万游客。我们的实验室有大窗户,展示了MiSeq作为关键仪器,让游客看到空间并了解我们的研究。yobet亚洲游客们常常惊讶地得知这项工作是由水族馆完成的,并对我们将能够通过yobet亚洲下一代测序发现的潜力感到兴奋。

我们将我们的MiSeq命名为“霍顿”,以苏斯博士的角色命名,他可以“听到”数百万曾经看不见的微小但重要的生物。我们喜欢霍顿在实验室里,因为他是我们工作中令人兴奋的发现的象征。乐器的拟人化似乎引起了各个年龄段的游客的共鸣。

MiSeq使我们能够在一次运行中从水族馆周围的数百个样本中调查微生物群落。对于一个小团队和许多未解决的问题,易用性和从样本到发现的快速移动的能力至关重要。

能举一个你从研究中学到的例子吗?yobet亚洲

在谢德水族馆,我们是一个“人造环境”,为32,000只动物复制了自然栖息地。我们也是芝加哥最受欢迎的文化景点。这些特点使我们的设施成为一个独特的地方,可以观察人类和动物的微生物如何相互作用,并以在自然界中不可行的方式测试假设。

作为我们将游客与现实世界联系起来的使命的一部分,我们提供各种实践体验,例如我们的黄貂鱼触觉展览。作为季节性的户外栖息地,黄貂鱼之触在2015年夏天接待了超过43万名游客,给了我们一个独特的机会来观察人类和牛鼻鳐之间的相互作用。我们的研究发现,尽管随着季节的推移,鳐鱼栖息地的微生物多样性有所增加,但我们世界级的兽医团队无法发现这些动物的健康状况有任何不同。事实上,与隐藏在幕后的控制组射线相比,被访问的射线在检查期间心率更低。

你希望你的研究对海洋生物学和/或水族馆有什么影响?

通过谢德水族馆的A. Watson armor III动物健康与福利中心,我们致力于不断推进水生动物护理背后的科学。作为第一个描述我们环境微生物生态的水族馆,我们希望成为动物园和水族馆社区的资源。我们希望我们的发现能帮助我们更好地照顾水生生物,不仅在动物环境中,而且在河流、湖泊和海洋中。

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