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微生物基因组学

显示屏上的DNA测序

现场博物馆使用DNA探索地球上的生物多样性

显示屏上的DNA测序
2016年8月29日

普利兹克分子系统学和进化实验室(Pritzker Laboratory for Molecular Systematics and Evolution) A. Watson Armour III经理凯文·费尔德海姆(Kevin Feldheim)说,“许多参观博物馆的人没有意识到,博物馆可以像小型大学一样,参与动手操作、研究项目,并与世界各地的科学家合作。野外博物馆在芝加哥。我们找到了凯文,了解了菲尔德博物馆是如何使用yobet亚洲miseq系统提高对DNA科学的公众意识并创造新的发现。

告诉我你的实验室?

菲尔德博物馆的Pritzker实验室是一个跨部门、多用户的核心设施,致力于基因分析和保护世界生物多样性。它由菲尔德博物馆的策展人、工作人员、学生和外部合作者共享。

您的DNA研究计划是如何开始的,并激励您购买Missq的原因是什么?

我们研究所有不同的物种,从细菌和真菌到植物和动物。当下一代测序作为科学探究的工具开始变得越来越流行时,我们开始思考这项技术将如何造福于我们的研究。大约三年前,一位热心的捐赠者为我们提供了购买MiSeq所需的资源。我们知道,有能力分析数千个基因,甚至测序小基因组,将在许多学科有用。

如何使用仪器?

我们的工作人员与当地大学和机构的科学家合作,如莫顿植物园,芝加哥植物园,以及世界各地的研究人员。除了我们自己的项目来更好地了解我们收集的物种、它们的生物学以及它们与各自栖息地中的其他物种的相互作用外,MiSeq还被研究生和博士后同事与我们的策展人一起用于各种各样的项目。

您使用Miseq的项目的一些例子是什么?

任何特定时间都有许多不同的项目。以下是过去几年使用Miseq的一些例子:

  • 蚂蚁肠道中发现的细菌的表征
  • 古柯基因组的组装,植物用于生产可卡因
  • 对马达加斯加鸟类演变的考察
  • 西部大西洋柠檬鲨遗传学的遗传研究

你喜欢MiSeq什么?

它是多功能的,易于使用,并为我们提供广泛的数据,我们可以使用。我们的实验室是独一无二的,我们提出了这种广泛的研究问题,我们有科学家,具有不同水平的实验室经验。Miseq很棒,因为它能够执行这样的各种排序应用程序。易用性也是至关重要的,因为除了我们的内部研究人员外,它还由来自世界各地和高中生的经验丰富的访问科学家使用。

实验室有窗户,以便博物馆的参观者可以看到里面。这些访客在参观实验室时的反应如何?

我们每天上午11点与科学家交谈,直到中午,博物馆访问者可以与科学家讨论我们的实验室。我们总是被问到我们正在努力的内容,游客都很着迷,了解我们在博物馆中的能力。yobet亚洲他们总是感到惊讶地听到我们能够收集多少遗传信息,以及数据如何转化为在进化生物学,生态和生物多样性中的更大问题。

除了“与科学家交谈”,你们还有什么其他的教育项目?

我们有各种各样的暑期实习学生来DNA实验室做研究项目,包括DNA居住实习每年夏天为高中学生和教师设立的项目。这个六周的项目包括一个星期的培训和五个星期的在我们的实验室里动手工作,与我们的科学家合作进行他们的研究。今年,参与该项目的学生还带领一组八年级学生参与了从草莓中提取DNA的项目。参与我们项目的老师也帮助我们发展了教育家指南到Daniel F.和Ada L. Liqu Dna Discovery Center和一系列课程计划系统生物学

摄影由John Weinstein,©The Field Museum

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