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测定,群落,微生物基因组学,细胞和分子生物学

将新冠疫情监测能力扩展到大城市之外

随着COVIDSeq Assay的推出,小型实验室也参与了监测

将新冠疫情监测能力扩展到大城市之外
2021年7月27日

“上个月,我们出现了自大流行开始以来(新冠病毒阳性病例)的最大高峰,”该中心医学主任阿德里安·亚历杭德罗·塞巴洛斯·洛佩斯博士说梅里达生物群落. Biomédicos是墨西哥南部唯一一个采用测序技术进行临床应用的实验室,该地区的经济差异极大。但是直到新的Illumina柯维塞克™ 化验本月推出,它们尚未对SARS-COV-2病毒进行排序。Biomédicos是世界上第一个使用96样本测定的客户之一。在接受套件的几天内,它们在该区域中测序了21个样本,并发现了15个伽马和三个α变体。

在Yucatán州,有大量来自美国和加拿大的退休移民,以及访问Mérida和附近的Cancún的游客。Ceballos López想知道游客们是否会带来一些变体。“我觉得我们很有可能在该地区发现了阿尔法或德尔塔变种。目前,墨西哥没有强制性的COVID - 19检测。戴口罩仍然是强制性的。”既然他能对SARS-CoV-2进行测序,他就能确定源头了。

“我们的老年人口已经收到了完整的疫苗接种,但40至60岁的人只接受了第一剂。我们需要测序,因为我们观察了病毒和年轻患者的易于蔓延,患有更严重的疾病。“

Biomédicos急于启动测序以检测其所在区域的SARS-CoV-2。该实验室服务于墨西哥东南端,包括尤卡坦、恰帕斯、塔巴斯科、坎佩切、金塔纳罗。该实验室还向邻国伯利兹提供服务。

购买了Illumina米塞克™对于2020年末的血液肿瘤学,Ceballos López很高兴使用新的柯维塞克™ 化验该项目允许小型实验室参与监控。COVIDSeq Assay试剂盒提供试剂,可在MiSeq™、MiniSeq™和iSeq™100系统上准备多达96个样品进行测序,是NovaSeq™6000上的3,072个样品或NextSeq™上的384个样品的更易于管理的替代方案500/550/550Dx / 2000.

“我们将能够识别临床意义的变种,也许是一个新的变体,”CeballosLópez说。

今天,有更多1.91亿Covid-19案件全世界报道。许多国家正在排序其积极案例和报告变体,以支持公共卫生管理。但大多数现有的基因组数据来自大型基因组中心,实验室具有高通量样本处理的能力,并且资源资源资源有限的国家,对CoVID监视网络的提交较低。

Covidseq测定提供低通量的实验室以更小的规模进入中集中监测,序列和识别可以帮助公共卫生机构管理Covid-19大流行的病毒变体。增加出现和普遍的变体检测的监测对于全球控制病毒的努力至关重要。

有关我们新的96-Sample Covidseq测定的信息,用于MiseQ,MiniSeQ和ISEQ 100系统,请单击在这里.

要了解yobet亚洲亚博官网人口有关Novaseq 6000和Nextseq 500/550 / 550DX / 2000的Covidseq更多信息,请单击在这里.

要阅读有关识别和跟踪传染病威胁的信息,请单击在这里.

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