2021年9月23日
癌症是一种毁灭性的疾病正迅速成为全球死亡的主要原因。在2020年,有近1000万例癌症死亡在全球范围内。但随着基因组学的出现和民主化专业数据访问、癌症研究人员已经能够迈出一大步,近年来,和提高了癌症病人的存活率由于从研究进展。
9月24日标志世界癌症研究的一天。该倡议旨在促进肿瘤领域的研究,呼吁机构、领导人和企业增加他们的努力和加速势头努力减少这种令人心碎的疾病的负担。
在纪念斯隆凯特林癌症中心(MSKCC)在纽约市,助理参加计算肿瘤学家埃利- Papaemmanuil博士和她的实验室利用Illumina公司技术分析multiomic数据(任意组合的DNA, RNA,表观遗传学和蛋白质)从成千上万的病人获得可行的见解癌症。“有这么多的信息嵌入到癌症基因组,病人的风险倾向、疾病状态,可能对治疗的反应,“Papaemmanuil说。“我们现在的技术允许我们访问这些信息。思考一个新问题时,阅读一篇文章,或工作在一个具有挑战性的病人,临床医生的思维过程现在立即开始思考如何使用最新的技术来解决问题。我发现这种转变非常鼓舞人心。这表明我们只是刚开始采用这些技术在更广泛的背景下来。”
丹尼·威尔斯博士是战略研究的高级副总裁&科学的创始人之一Immunai的力量,同样热衷于下一代测序获得关键的见解。“我是一个真正的信徒在genomics-I认为天空的极限。这项技术将会成为每一个重大疾病研究领域的核心。”
基于他的公司,也在纽约,是使用multiomics映射身体的免疫系统和人工智能,以发现新疗法。井的背景包括生物学和应用数学,但是今天他关注immuno-oncology研究。“对我来说,有两个真正深刻的差异处理基因数据相比,人类健康的上下文中计算工作我做了过去。第一件事是,我就是喜欢基因组数据。它是如此令人难以置信的,你可以把这些客观的方法。我不认为任何其他数据类型给你那么多信息。其次,它是有意义的工作在人类样本和知道发现你可以帮助确定新的治疗病人,让他们正确的治疗的新途径。”
井的一个例子是测序的发展吸引了一系列人才基因组学领域的研究。根据Papaemmanuil,全球研究社区不再仅仅是训练有素的科学家们主要研究基因组学和科学数据。“现在,个人可能有不同背景的细胞生物学和分子生物学通常合并技术,允许癌症基因组的解码,methylome,每天和转录组。很重要的一点是,这些技术不仅是生成数据,但也自然搭配一个关联的工作流数据生成后的质量控制和数据挖掘。输出的稳定性是有效地启用和民主化跨学科的采用这些技术。输出使非常可靠的高质量的新发现,为我们和其他许多人”。
但是还有很多工作要做,它始于研究员。“越全面查询基因组、转录组和methylome,越快我们可以开发和验证相关的生物标记物,”她说。“一旦我们已经用尽了我们的搜索空间,我们将能够链接multiomic数据病人反应状态和结果在我们所有的相关研究和临床试验。”
阅读Illumina公司的癌症研究方法指南,点击在这里。
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