Illumina COVIDSeq Test (RUO版本)是一种基于扩增子的NGS检测方法，包括2019-nCoV引物，旨在检测SARS-CoV-2病毒的突变和描述RNA，以帮助临床研究实验室识别和跟踪新型SARS-CoV-2毒株的出现和流行。
Illumina COVIDSeq测试(RUO版本)可以放大或缩小，以适应不同数量的样本。在NovaSeq 6000系统上使用两个SP或S4试剂包可以在12小时内处理1536至3072个结果，或者使用NextSeq 2000 P2 v3试剂包或NextSeq 500/550/550Dx(在研究模式下)HO试剂包在12小时内处理384个结果。
该工作流程包括病毒RNA提取、RNA到cdna转换、PCR、文库制备、测序、分析和报告生成等步骤。关键组件包括高吞吐量的NovaSeq 6000系统或NextSeq 2000系统或NextSeq 500/550/550Dx(研究模式)系统，再加上Illumina COVIDSeq测试(RUO版本)和DRAGEN COVIDSeq测试应用程序(RUO版本)在BaseSpace序列集线器快速分析。
Illumina COVIDSeq测试(RUO版本)采用了经过验证的公开可用的ARTIC多重PCR协议的改进版本，结合了经过验证的Illumina测序技术，有98个扩增子用于扩增SARS-CoV-2病毒特异性序列。当检测到+90个扩增子时，COVIDSeq提供一致的序列信息。PCR步骤的63℃退火温度改进了变异分析，提供了对样品中存在的SARS-CoV-2毒株的重要了解，并能够跟踪病毒毒株。
共识序列信息(FASTA文件)可以上传到开放的软件工具中，以分配谱系和注释突变。FASTA文件可以很容易地通过BaseSpace测序中心上传到NCBI和/或GISAID应用程序，以增加方便性。
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Illumina Covidseq测试（Ruo版）试剂的等分试剂
技术说明| PDF< 1mb
对于使用Illumina COIVDSeq测试COVID-19监视测序准则（RUO版）
技术说明|PDF1 MB.
