TruSight髓系测序面板

该测序研究面板靶向与骨髓恶性肿瘤相关的变体,如AML,MDS,MPN,CML,CMML和JMML。阅读更多...
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TruSight髓系测序面板(96个样本)

FC-130-1010

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产品亮点

Trusight Myeloid测序面板使用专家定义的内容,并经过验证的下一代测序(NGS)技术,以鉴定骨髓恶性肿瘤中的体细胞变异。

面板内容由血癌疾病的公认专家的联盟设计,靶基因经常变异:

  • 急性髓性白血病(AML)
  • 髓细胞增生综合征(MDS)
  • 骨髓增殖性肿瘤(或然数)
  • 慢性髓性白血病(CML)
  • 慢性骨髓细胞白血病(CMML)
  • 青少年骨髓细胞白血病(JMML)

Trusight Myeloid测序面板涵盖15个全基因(仅外外显子)和39个额外的基因,其中覆盖了致癌热点,对已知粘性粘液性恶性肿瘤的关键基因进行了全面评估。结果是一种准确,经济有效的解决方案,使研究人员能够概述液体肿瘤。

查看基因列表

Trusight Myeloid库非常适合在桌面定序器上运行,并使用MiSeq Reporter或本地运行Manager放大器工作流进行对齐和变体调用,其中包含躯体变体调用者。然后可以使用过滤和注释Basespace Variant Interpreter.

参见所有Illumina癌症研究小组

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规格

项目建议

仪器 推荐的样品数量 读长度
MiniSeQ系统 每次运行的样品:中输出:2-3个,高输出:8个(基于95%的扩增在> 500x覆盖) 2 × 150 bp(推荐最大)
MiSeq系统 每次运行8个样品,使用v3试剂(基于95%扩增在> 500x覆盖) 2 × 150 bp(推荐最大)
NextSeq 550系统 每次运行示例:中间输出:48,高输出:96(基于95%的扩增子> 500x覆盖范围) 2 × 150 bp(推荐最大)

产品对比

TruSight髓系测序面板 Amplumina myeloid面板 illumina癌症热点面板v2的扩增
试验时间 8小时 5.5 - 7.5小时(仅限图书馆预备;不包括库量化,归一化或汇集时间) 5小时(仅限图书馆预科;不包括库量化、规范化或池化时间)
癌症类型 血液 血液 Pan-Cancer,固体肿瘤
内容规范 靶向与髓系恶性肿瘤相关的54个基因。探针扩增了568个来自肿瘤抑制基因和突变热点的扩增子。 靶向69个基因的生物标志物(40个关键DNA靶基因,29个RNA融合驾驶员基因和5个基因表达水平) 50个基因的热点区域,具有已知癌症的关联
描述 用于髓系恶性肿瘤的体细胞突变检测研究。 有针对性的小组研究40个DNA基因,29个RNA融合驾驶基因和5种与骨髓癌相关的基因表达水平。 体细胞分析研究50个癌症相关基因的热点区域。
实践时间 3小时 < 1.5小时 < 1.5小时
输入数量 50 ng. 20 Ng高质量的DNA;10 NG高质量的RNA
(建议每池10ng)
1-100 ng(每池10 ng推荐)
方法 扩增子测序有针对性的DNA测序 扩增子测序有针对性的DNA测序有针对性的RNA测序 扩增子测序有针对性的DNA测序
多路复用 96 -丛 96 -丛 96双重指数组合
核酸类型 脱氧核糖核酸 DNA, RNA 脱氧核糖核酸
专门的样品类型 不兼容FFPE 血液,骨髓,不是FFPE兼容 FFPE组织
物种分类 人类 人类 人类

方法特定工作流示例

客户的故事

寻找血液中的癌症线索

下一代测序有可能打开用于检测血液癌的新门。

亚博官网人口
Trusight myeloid测序面板基因名单
ABL1 CEBPA HRAS. MYD88 SF3B1
ASXL1 CSF3R IDH1. NOTCH1 SMC1A
atrx. CUX1 IDH2. NPM1 SMC3
BCOR. dnmt3a. IKZF1 NRAS. SRSF2
Bcorl1. ETV6 /电话 jak2. PDGFRA STAG2.
BRAF Ezh2. jak3. PHF6 TET2
CALR FBXW7. KDM6A PTEN. TP53
CBL FLT3. 工具包 PTPN11 U2AF1
CBLB. gata1. 喀斯特 RAD21 WT1.
CBLC. gata2. MLL Runx1. ZRSR2.
CDKN2A 玲娜 MPL SETBP1

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