Trusight肿瘤学Umi试剂
对下一代测序库的唯一分子标识符（UMIS）进行纠错。阅读更多…
Trusight肿瘤学UMI试剂减少了测序数据中的背景噪声，从而能够检测低频变体，例如在无细胞DNA（CFDNA）中发现的那些。
循环肿瘤DNA (ctDNA)可能代表cfDNA的很小一部分，接近下一代测序(NGS)检测的极限。TruSight肿瘤UMI试剂通过UMIs和错误校正软件解决了这一挑战，将错误率降低到< 0.007%，并能够检测低频变异。较低的错误率增加了分析的特异性，从而提高了NGS数据的置信度。
Trusight肿瘤学UMI试剂包括UMI适配器和指数，以及Trusight肿瘤学DNA文库准备和富集试剂。这些试剂也可以与Trusight肿瘤170 DNA寡核苷酸配对。UMI的集成不会在库准备工作流程中创建任何额外的步骤。
UMI错误修正应用程序对读取数据进行对齐，然后使用ui来排除误报，减少变体调用错误。UMI Error Correction App可在基于云的BaseSpace Sequence Hub中获取，也可在本地安装。
为了能够准确检测罕见变异，UMIs与纠错软件集成，使真正的突变能够从背景噪声中区分出来。下面的面板说明了如何通过去除导致假阳性的固有错误，降低错误率使真实突变(红点)与背景噪声(灰点)更好地区分开来。
| 排序运行 | 平均错误率(未折叠读取) | 意味着错误率（折叠读数） |
|---|---|---|
| 1 | 0.038％ | 0.0023% |
| 2 | 0.043% | 0.0024% |
| 3. | 0.035% | 0.0024% |
| 4 | 0.084% | 0.0019% |
使用TruSight Oncology UMI reagent与TruSight Tumor 170 DNA含量配对进行文库制备，31个样本在HiSeq 4000系统上进行4次独立测序。使用UMI错误纠正应用程序显示有和没有折叠读取时的平均错误率。
技术说明| PDF< 1mb
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使用Trusight肿瘤的umi试剂具有Trusight肿瘤170 DNA含量，用于检测无细胞DNA中的低频变体
应用笔记|PDF2 MB.
使用Trusight肿瘤的umi试剂具有Trusight肿瘤170 DNA含量，用于检测无细胞DNA中的低频变体
应用笔记|PDF2 MB.
数据表|PDF <1 MB
*对NovaSeq 6000系统的性能进行了演示，但没有进行广泛测试。
