DRADEN V3.4发布2019年9月|新功能包括:
DRAGEN平台可以在25分钟内处理30倍覆盖范围的整个人类基因组的NGS数据,而传统的基于cpu的系统需要15小时。它创下了基因组数据分析的两项世界纪录。2,3
DRAGEN平台可以减少对服务器集群的投资和云计算资源的利用。
在2018年精准食品和药物管理局隐藏的宝藏-暖场挑战中,龙泉平台在全基因组变异呼叫的6个准确度测量中获得了5个最高的分数,在所有50个变异的平台中。1
DRAGEN平台分析来自全基因组、全外显子组、种系和体细胞数据集以及RNA测序实验的测序数据。
频繁的发布不断扩展和改进DRAGEN平台,同时适应新的应用程序和解决不断发展的行业标准。
Dragen平台使所有尺寸和学科的实验室能够使用其基因组数据进行更多。DRADREN平台使用高度可重构的现场可编程门阵列技术(FPGA)来提供基因组分析算法的硬件加速实现,例如BCL转换,映射,对齐,分类,重复标记和单倍型变体调用。DRADREN平台的基本特征解决了基因组分析中的共同挑战,例如冗长的计算时间和大规模的数据。
在不妥协的准确度的情况下,Dragen平台可迅速,灵活性和成本效率提供速度。Dragen Platform的重新编程性质使Illumina能够开发自定义算法,并允许改进以适应未来的应用程序。
拖动BaseSpace序列集线器耦合DADREN平台的速度和准确性与BaseSpace序列集线器的安全性,成本节约和直观接口。
Dragen On-Previse在与传统的基于CPU的系统相比的一小部分中进行二次分析,同时仍保持高精度。
的名字 |
描述 |
可用性 |
---|---|---|
Illumina DRAGEN种系管线 | DRAGEN种系管道提供端到端(BCL➝VCF)的NGS分析,包括高级错误模型校准,以提高准确性,并通过Illumina expansion Hunter重复扩增检测和基因分型。 | 内部 在Basespace序列中心 |
Illumina DRAGEN体细胞管道 | DRAGEN体细胞管道包括肿瘤和肿瘤正常模式,设计用于检测肿瘤样本中的体细胞变异 | 内部 在Basespace序列中心 |
拖动参考资料 | 此应用程序接受Fasta文件,并构建DRADREN应用程序使用的专有引用。 | 内部 在Basespace序列中心 |
Illumina DRAGEN RNA管道 | Dragen RNA管道从接头结发现和对准开始,然后快速取向和接头连接,定量和融合检测开始。 | 内部 即将推出Basespace序列中心 |
Illumina Dragen联合基因分型/人口管道 | DRAGEN联合基因分型/种群管道联合调用多个基因组的变异,并以加快的速度和毫不牺牲的准确性对大队列的样本进行扩展。 | 内部 在Basespace序列中心 |
Illumina Dragen CNV管道 | DRAGEN CNV管道对种系和体细胞外显子组和基因组进行拷贝数变异(CNV)分析。在发出最终调用之前,可以应用不同级别的过滤来减少误报。 | 内部 在Basespace序列中心 |
Illumina Dragen甲基化管道 | DRAGEN甲基化管道提供多种操作模式,包括仅参考对齐和辅助注释。 | 内部 在Basespace序列中心 |
Illumina DRAGEN地图+对齐管道 | Dragen Map +对准管道能够进行超快速映射和对准展开和基因组的DNA和RNA。 | 内部 在Basespace序列中心 |
来自Broad研究所的Anthony Philippakis和Illumina的Susan Tousi讨论了GATK与Illumina测序仪的集成以及DRAGEN平台的实现如何促进硬件加速和数据分析的标准化。
查看视频DRAGEN平台可用于生物科学的众多应用。
快速分析已测序的基因组;随着计算工具的不断改进,加速重新分析。
当快速结果成为关键因素时,减少基因组分析所需的时间。
准确,快速分析肿瘤和肿瘤/正常样本。
使用所提供的参考资料,分析不同基因组复杂性的动物和植物。
通过快速转机和高精度分析有针对性的Exome数据,以确保再现性和高质量的结果。
应用笔记|HTML.
BaseSpace Sequence Hub Quick Apps Handout
手册| PDF< 1 MB
手册| PDF< 1 MB
Basespace Sequencing Hub Apps快速指南
手册| PDF< 1 MB
基于BaseSpace Sequence Hub的DRAGEN Bio-IT平台
数据表| PDF1 MB
数据表|HTML.
数据表|HTML.