Illumina DRAGEN生物it平台

Illumina DRAGEN(基因组学动态阅读分析)Bio-IT平台为测序数据提供精确、超快速的二次分析。阅读更多…
Illumina DRAGEN Bio-IT平台提供
  • 准确的数据:检测小变异具有高的分析灵敏度和特异性1
  • 强劲的速度:在大约25分钟内处理30倍覆盖范围的整个人类基因组2,3
  • 经常发布:包括定期增强和升级的版本
  • 各种应用程序:分析来自全基因组、外显子组和RNA的下一代测序(NGS)数据
拖动选项
BaseSpace序列集线器上的DRAGEN
BaseSpace序列集线器上的DRAGEN
超快速分析

DRAGEN平台可以在25分钟内处理30倍覆盖范围的整个人类基因组的NGS数据,而传统的基于cpu的系统需要15小时。它创下了基因组数据分析的两项世界纪录。2,3

经济高效的解决方案

DRAGEN平台可以减少对服务器集群的投资和云计算资源的利用。

高度准确的结果

在2018年精准食品和药物管理局隐藏的宝藏-暖场挑战中,龙泉平台在全基因组变异呼叫的6个准确度测量中获得了5个最高的分数,在所有50个变异的平台中。1

多样化的应用程序

DRAGEN平台分析来自全基因组、全外显子组、种系和体细胞数据集以及RNA测序实验的测序数据。

频繁更新

频繁的发布不断扩展和改进DRAGEN平台,同时适应新的应用程序和解决不断发展的行业标准。

将生物信息学携带内部降低成本和周转时间

亚历山大Bisignano,Cofound和磷的首席执行官讨论了公司如何使用Dragen Bio-IT平台在现场和可接近的价格点执行基因组学数据分析。

读采访
磷数据分析

Dragen平台使所有尺寸和学科的实验室能够使用其基因组数据进行更多。DRADREN平台使用高度可重构的现场可编程门阵列技术(FPGA)来提供基因组分析算法的硬件加速实现,例如BCL转换,映射,对齐,分类,重复标记和单倍型变体调用。DRADREN平台的基本特征解决了基因组分析中的共同挑战,例如冗长的计算时间和大规模的数据。

在不妥协的准确度的情况下,Dragen平台可迅速,灵活性和成本效率提供速度。Dragen Platform的重新编程性质使Illumina能够开发自定义算法,并允许改进以适应未来的应用程序。

拖动BaseSpace序列集线器耦合DADREN平台的速度和准确性与BaseSpace序列集线器的安全性,成本节约和直观接口。

  • 针对不同专业水平的按钮分析
  • 流数据直接从仪器快速分析
  • 低成本,无硬件投资
  • 利用Basespace序列集线器和亚马逊Web服务的安全性,合规性和存储功能(AWS)

读取数据表

yobet亚洲亚博官网人口了解BaseSpace应用程序的更多信息

BaseSpace序列集线器上的DRAGEN

Dragen On-Previse在与传统的基于CPU的系统相比的一小部分中进行二次分析,同时仍保持高精度。

  • 在本地分析和存储数据
  • 支持不同级别的命令行接口
  • 替换多达30个传统计算实例
  • 在25分钟内处理30倍覆盖范围的整个人类基因组的NGS数据
  • 一个单元支持两个NovaSeq系统满负荷运行

读取数据表

拖着上提

数据分析选项

的名字

描述

可用性

Illumina DRAGEN种系管线 DRAGEN种系管道提供端到端(BCL➝VCF)的NGS分析,包括高级错误模型校准,以提高准确性,并通过Illumina expansion Hunter重复扩增检测和基因分型。

内部

在Basespace序列中心

Illumina DRAGEN体细胞管道 DRAGEN体细胞管道包括肿瘤和肿瘤正常模式,设计用于检测肿瘤样本中的体细胞变异

内部

在Basespace序列中心

拖动参考资料 此应用程序接受Fasta文件,并构建DRADREN应用程序使用的专有引用。

内部

在Basespace序列中心

Illumina DRAGEN RNA管道 Dragen RNA管道从接头结发现和对准开始,然后快速取向和接头连接,定量和融合检测开始。

内部

即将推出Basespace序列中心

Illumina Dragen联合基因分型/人口管道 DRAGEN联合基因分型/种群管道联合调用多个基因组的变异,并以加快的速度和毫不牺牲的准确性对大队列的样本进行扩展。

内部

在Basespace序列中心

Illumina Dragen CNV管道 DRAGEN CNV管道对种系和体细胞外显子组和基因组进行拷贝数变异(CNV)分析。在发出最终调用之前,可以应用不同级别的过滤来减少误报。

内部

在Basespace序列中心

Illumina Dragen甲基化管道 DRAGEN甲基化管道提供多种操作模式,包括仅参考对齐和辅助注释。

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Illumina DRAGEN地图+对齐管道 Dragen Map +对准管道能够进行超快速映射和对准展开和基因组的DNA和RNA。

内部

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广泛的研究所

来自Broad研究所的Anthony Philippakis和Illumina的Susan Tousi讨论了GATK与Illumina测序仪的集成以及DRAGEN平台的实现如何促进硬件加速和数据分析的标准化。

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人口测序

快速分析已测序的基因组;随着计算工具的不断改进,加速重新分析。

NICU和遗传疾病

当快速结果成为关键因素时,减少基因组分析所需的时间。

癌症研究

准确,快速分析肿瘤和肿瘤/正常样本。

Agrigenomics.

使用所提供的参考资料,分析不同基因组复杂性的动物和植物。

临床和翻译研究

通过快速转机和高精度分析有针对性的Exome数据,以确保再现性和高质量的结果。

参考
  1. 精密食品和药物管理局的隐藏宝藏预热。precision.fda.gov / 1 /视图/结果/挑战.2018年9月14日通过。
  2. 生物世界。费城儿童医院,埃迪科创下二级分析速度世界纪录。2017年10月23日。www.bio-itworld.com/2017/10/23/childrens-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed.aspx.2018年9月19日通过。
  3. 圣地亚哥联合论坛报。雷迪儿童研究所创下吉尼斯世界纪录。2018年2月12日。www.sandiegouniontribune.com/news/health/sd -不-拉迪-记录- 20180209 - story.html.2018年9月19日通过。

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