Illumina链mRNA准备
一种简单、可扩展、经济、快速的单天解决方案，用于分析编码转录组，只需25 ng标准(未降解)RNA的输入。阅读更多…
Illumina Stranded MRNA Prep提供了一种简化的RNA-SEQ解决方案，用于在转录组上清晰综合分析。它为输入类型提供了非凡的灵活性，并支持低输入量，降至25 ng总RNA。Illumina Stranded MRNA PREP能够精确测量股线取向，均匀覆盖度和高度信心发现，例如新型同种型，基因融合和等位基因特异性表达。
Illumina链mRNA Prep经过优化，提供卓越的polyA捕获效率和覆盖均匀性。它最大限度地减少所需的测序深度，准确，无偏的检测编码转录组。Illumina Stranded mRNA Prep基于TruSeq结扎技术，自2011年以来，该技术已被9926篇论文引用。
Illumina搁浅总RNA Prep支持广泛的RNA输入，从25 ng到1000 ng.*
该信息能够检测反义转录，增强转录注释，并提高比对效率。
在7小时内准备文库进行测序。Illumina合格的自动化选项即将通过我们的自动化合作伙伴．
多路多达384个样品和序列在一次运行。(索引集A和B现已上市;C组和D组很快就会出现。)
RNA-Seq越来越成为思想领袖的首选平台，它提供了特定时间点转录组的详细快照。它比定量PCR有许多优点，包括:
*与FFPE样品不兼容
| 仪器 | 建议样本数目 | 阅读长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 中期输出:5 高输出:16 (基于每个样本25M读取) |
2×75 bp |
| nextseq 2000系统 | P2: 16 P3: 40 (基于每个样本25M读取) |
2×75 bp |
| NovaSeq 6000系统 | SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4:384 (基于每个样本25M读取) |
2×75 bp |
| Illumina链mRNA准备 | TruSeq链mRNA | TruSeq RNA库准备工具包v2 | Illumina RNA浓缩Prep | Illumina链总RNA Prep与核糖零度加 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 测定时间 | 6.5小时 | 〜10.5小时 | 〜10.5小时 | <9小时 | 约7小时 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 内容规格 | 将编码转录组捕获与股线信息 | 将编码转录组捕获与股线信息 | 捕获编码转录组（没有STRAND信息） | 与Illumina外显子组面板一起使用时捕获编码转录组 | 捕获编码RNA和多种形式的非编码RNA |
| 描述 | 利用精确的链信息分析编码转录组的一种简单、经济的解决方案 | 给研究人员一个清晰，全面的观点编码转录组与精确的链信息。 | 一种简单、经济高效的编码转录组分析研究解决方案。 | 这是一种可重复、经济的解决方案，能够从广泛的样本类型和输入(包括福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本)中进行靶向转录本检测和发现 | 用于多种样本类型的全转录组测序研究。包括核糖零正模块，用于单管消耗来自多个物种的丰富转录物 |
| 准时到达 | < 3小时 | ~ 4.5小时 | ~ 4.5小时 | < 2小时 | < 3小时 |
| 输入数量 | 25-1000 ng标准质量总RNA | 0.1 - 1 ug总RNA或10 - 100 ng以前分离的mRNA(从有polyA尾巴的物种) | 0.1 - 1 ug总RNA或10 - 400 ng以前分离的mRNA(从有polyA尾巴的物种) | 10ng来自新鲜/冷冻样品的总RNA，或来自FFPE样品的20ng总RNA | 标准质量RNA样品的总RNA为1-1000 ng。为获得最佳性能和FFPE样本，建议最低总RNA为10ng |
| 的作用机制 | PolyA捕获、基于连接的适配器和索引添加 | oligo-dt珠捕获Polya尾巴 | oligo-dt珠捕获Polya尾巴 | Bead-linked transposome | 酶促rRNA去除、基于连接的适配器和索引添加 |
| 多路复用 | 多达384个唯一双索引(UDIs) | 1 - 96 | 每条车道最多可达24座 | 多达384个唯一双索引(UDIs) | 多达384个唯一双索引(UDIs) |
| Strand特异性 | 搁浅 | 搁浅 | 非搁浅 | 非搁浅 | 搁浅 |
| 技术 | 排序 | 排序 | 排序 | 排序 | 排序 |
| 变量类 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 |
左- Illumina链mRNA Prep的性能指标。赖特- 将illumina绞合的mRNA制备与Truseq Slanded mRNA进行比较。Illumina Slanded mRNA Prep显示出优异的性能，特别是输入25 ng UHR RNA。图书馆对30M的读取和使用Basespace RNA-SEQ对齐App V2.0.1进行分析。报告在4M限位的对读数通过滤波器（PF）时报告了复制品。
与TruSeq strand mRNA相比，Illumina strand mRNA Prep能够在低RNA输入的情况下实现更高的基因检测。检测到的基因数量在30M下采样配对端读取PF。1倍覆盖时检测到的基因越多，如Illumina链mRNA Prep的情况，表明敏感性更高。
Illumina strand mRNA Prep与TruSeq strand mRNA在(A)等效输入100 ng UHR RNA和(B)减少输入25 ng vs 100 ng UHR RNA时产生高度一致的数据。
Illumina Slanded MRNA PREP在25ng和100ng UHR RNA之间的25ng UHR RNA和（b）之间的（a）技术重复之间的高数据程度图书馆在2×74bp下测序，将其读取到30米。使用Basespace RNA-SEQ对齐App v2.0.1执行数据分析。
Illumina Stranded MRNA PREP提供了快速的工作流程，减少了手续时间。时间可能有所不同，这取决于所使用的设备，处理的样本数，自动化程序或用户体验。
数据表|PDF |6个版本
技术说明| PDF< 1mb
应用笔记| PDF< 1mb
小册子| PDF1 MB
小册子| PDF2 MB
