为了在为库准备而订购单个组件时提供更大的灵活性,我们正在转向模块化配置。我们现有的TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kits (Cat。不。FC-121-3001、FC-121-3002和FC-121-3003将转化为TruSeq DNA PCR-Free (Cat。编号20015962的24个样品和Cat。96个样本编号20015963),以备图书馆之用。索引适配器将作为TruSeq DNA单一索引(Cat。编号20015960的集合A和猫。编号20015961的集合B)和TruSeq DNA CD(组合双)索引(Cat。96个指数编号20015949)。
TruseQ DNA PCR-Fail提供全基因组测序应用的简单,全包图书馆制剂。研究人员可以序列各种各样的生物,从小型基因组等细菌到人类全基因组。工作流程:
在我们的全基因组测序工作流程中,TruSeq DNA PCR-Free为传统上难以测序的区域提供了优越的覆盖范围,如富含gc的区域、启动子和重复内容。
工作流程可调到各种读取长度,并支持所有Illumina测序仪器。这使得研究人员可以根据实验的需要对每次运行进行调整。
无pcr意味着减少文库偏差和差距。结果是高数据质量和最佳的基因组变异检测。优良的基因组覆盖质量意味着你的结果几乎没有差距,而且对富含gc的区域有良好的覆盖。
去除PCR节省了时间,并消除了与PCR步骤相关的基因组覆盖偏差。基于珠子的尺寸选择缩短了工作流程。与Illumina测序系统合作,TruSeq DNA PCR-Free为广泛采用的文库制备工作流程提供了一系列改进。
仪器 | 建议样本数目 | 读长度 |
---|---|---|
nextseq 550系统 | 每次运行1个样本(基于30×人类基因组的覆盖范围) | 350bp插入:≤2 × 100bp 550 BP插入:≤2×150bp |
HiSeq 2500系统 | 每次运行2-10个样品(双流槽;基于30倍人类基因组的覆盖范围) | 350 BP插入:≤2×100bp(快速运行) 50bp插入:≤2 × 250bp(快速运行) 350bp插入:≤2 × 100bp(高输出) 550 BP插入:≤2×125bp(高输出) |
Novaseq 6000系统 | 每次试验样本(双流式细胞):S1: 8, S2: 16, S4: 48(基于30×人类基因组覆盖率) | 350bp插入:≤2 × 150bp 550 BP插入:≤2×150bp |
Truseq DNA不含PCR | Nextera DNA Flex Library Prep Kit | Truseq DNA纳米 | |
---|---|---|---|
试验时间 | 总检测时间为5小时 | 〜3-4小时(从DNA提取到标准化库) | 〜6小时总测定时间 |
自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
描述 | 对于全基因组测序研究的简单,全包PCR-PREP,其能够通过基因组的具有挑战性的区域进行序列。 | 一个快速、灵活的工作流程,适用于广泛的研究应用和样本类型,从人类到微生物全基因组测序等。 | 低投入的研究方法,提供高基因组覆盖质量和减少偏差。 |
动手 | 4个小时 | 1 - 1.5小时 | 〜4小时 |
输入数量 | 1 ug DNA | 小基因组(如微生物):1- 500ng DNA。大基因组(例如人类):100-500 ng DNA。(关于血液和唾液,请参阅参考指南)。 | 100 ng基因组DNA |
的作用机制 | 机械DNA碎片和适配器连接。工作流程是免费的,无凝胶。 | Bead-linked transposome | 机械DNA碎片和适配器连接。工作流程使用减少偏置PCR,并没有凝胶。 |
方法 | 基因分型结果进行排序那霰弹枪测序那全基因组测序 | 扩增子测序那从头测序那霰弹枪测序那全基因组测序 | 基因分型结果进行排序那霰弹枪测序那全基因组测序 |
多路复用 | 多达24个单、96个组合(CD)双、24个唯一双和96个唯一双(UD)组合(即将推出) | 多达384个唯一双(UD)组合和96个组合双(CD)组合 | 多达24个单、96个组合(CD)双、24个唯一双和96个唯一双(UD)组合(即将推出) |
专门的样本类型 | 不兼容FFPE | 血液,不兼容ffpe,唾液 | 低输入样本,不兼容ffpe |
物种分类 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他,植物,老鼠 | 任何物种,细菌,果蝇,人类,哺乳动物,老鼠,线虫,植物,老鼠,病毒,酵母,斑马鱼 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他,植物,老鼠 |
物种的细节 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 | 与任何物种兼容 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 |
插入目标大小 | 350 BP或550 BP | ~ 500个基点 | 350 BP或550 BP |
产品 | Truseq DNA不含PCR | Truseq DNA纳米 |
---|---|---|
产品版本 | 低吞吐量(LT)和高吞吐量(HT) | LT和HT |
描述 | 减少文库偏差和覆盖缺口的全面基因组覆盖(与基于pcr的选项相比) | 基于广泛采用的TruSeq库准备,降低了输入,提高了数据质量(与之前的TruSeq kit版本相比) |
自动化的选择 | LT套件:手动工作流程 HT工具包:Automation-friendly;手动协议也可用 |
LT套件:手动工作流程 HT工具包:Automation-friendly;手动协议也可用 |
输入数量 | 1 - 2μg | 100-200 ng. |
包括聚合酶链反应 | 不 | 是的 |
试验时间 | ~ 5小时 | 5.5小时 |
动手 | 〜4小时 | 4个小时 |
插入目标大小 | 350 BP或550 BP | 350 BP或550 BP |
Gel-free | 是的 | 是的 |
支持的样品数量 | 24 (LT)或96 (HT)样品 | 24 (LT)或96 (HT)样品 |
尺寸选择珠子 | 包括 | 包括 |
应用程序 | 全基因组测序应用,包括全基因组重测序,新创组装和宏基因组学研究 | |
样品多路复用 | 多达24个单、96个组合(CD)双、24个唯一双和96个唯一双(UD)组合 | |
兼容的Illumina公司测序 | MiniSeQ,Miseq,Nextseq,Hiseq,Novaseq,Hiseq X和Hiscansq系统 |