为了为库准备提供更大的灵活性,我们正在转向模块化配置。我们现有的TruSeq Nano DNA文库准备试剂盒(Cat。不。FC-121-4001, FC-121-4002和FC-121-4003)将过渡到TruSeq DNA Nano (Cat。20015964号样品24个,Cat。96个样品,编号20015965)用于文库制备。索引适配器将单独出售作为TruSeq DNA单索引(Cat。A组和猫的20015960号。No. 20015961用于Set B)和TruSeq DNA CD(组合双)索引(Cat。不,20015949)。
TruSeq DNA Nano能够有效地检测有限的DNA样本。基于机械破碎-连接化学,这种低投入的方法提供了高覆盖质量和减少偏差,几乎适用于任何测序应用。
TruSeq DNA Nano已经简化,用珠基选择取代了凝胶基的大小选择,使研究人员能够在不到一天的时间内制备高质量的文库。它优化了多种读取长度,从2 × 101 bp到2 × 151 bp。
TruSeq DNA Nano提供了极好的结果,只需100 ng的输入,消除了典型的对微克DNA的要求。这使研究人员能够研究可用DNA有限的样本(如肿瘤样本),并帮助保存样本以供将来或替代研究使用。除了加快工作流程外,基于珠的尺寸选择避免了与凝胶选择相关的典型样品损失。
TruSeq DNA Nano减少了典型pcr诱导的覆盖缺口的数量和平均大小。增强的工作流程减少了库的偏差,提高了基因组的覆盖均匀性。这些试剂盒还提供了优良的覆盖传统挑战性基因组内容,包括gc丰富区域,启动子和重复区域。这使得研究人员能够从每次测序中获得更多的信息。Truseq DNA纳米产品被验证为几乎任何下一代测序应用的高质量基因组覆盖。
仪器 | 建议样本数量 | 读取长度 |
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NextSeq 550系统 | 每次运行1个样本(基于30×人类基因组覆盖率) | 350bp插入:≤2 × 100bp 550bp插入:≤2 × 150bp |
HiSeq 2500系统 | 每次2-10个样品(双流式细胞;基于30×人类基因组的覆盖率) | 快速运行,350bp插入:≤2 × 100bp 快速运行,550bp插入:≤2 × 250bp 输出高,插入量350bp:≤2 × 100bp 高输出,550 bp插入:≤2 × 125 bp |
TruSeq DNA Nano | TruSeq DNA PCR-Free | Nextera DNA Flex库准备试剂盒 | |
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试验时间 | ~6小时的总检测时间 | 总检测时间为5小时 | ~3-4小时(从DNA提取到标准化文库) |
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
描述 | 一种低投入的研究方法,提供高基因组覆盖质量和减少偏见。 | 为全基因组测序研究提供了一种简单、全包的无pcr准备,能够通过基因组的挑战性区域进行测序。 | 快速、灵活的工作流程,适用于广泛的研究应用和样本类型,从人类到微生物全基因组测序等。 |
实践时间 | ~ 4个小时 | 4个小时 | 1 - 1.5小时 |
输入数量 | 100 ng基因组DNA | 1微克DNA | 小基因组(如微生物):1- 500ng DNA。大基因组(如人类):100- 500ng DNA。(血液和唾液,参见参考指南)。 |
作用机制 | 机械DNA断裂和接合器连接。工作流使用低偏差PCR和无凝胶。 | 机械DNA断裂和接合器连接。工作流是无pcr和无凝胶。 | Bead-linked transposome |
方法 | 测序分型,鸟枪测序,全基因组测序 | 测序分型,鸟枪测序,全基因组测序 | 扩增子测序,从头测序,鸟枪测序,全基因组测序 |
多路复用 | 多达24种单一组合,96种组合(CD)对偶,24种唯一对偶和96种唯一对偶(UD)组合(即将上市) | 多达24种单一组合,96种组合(CD)对偶,24种唯一对偶和96种唯一对偶(UD)组合(即将上市) | 多达384个唯一对偶(UD)组合和96个组合对偶(CD)组合 |
专门的样本类型 | 低输入样本,不兼容ffpe | 不是FFPE-Compatible | 血液,不兼容ffpe,唾液 |
物种分类 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他,植物,大鼠 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他,植物,大鼠 | 任何物种,细菌,果蝇,人类,哺乳动物,老鼠,线虫,植物,大鼠,病毒,酵母,斑马鱼 |
物种的细节 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 | 与任何物种兼容 |
目标插入大小 | 350 bp或550 bp | 350 bp或550 bp | ~ 500个基点 |
规范 | TruSeq DNA Nano | TruSeq DNA PCR-Free |
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设备类型 | TruSeq DNA Nano LT & HT | TruSeq DNA PCR-Free LT & HT |
描述 | 基于广泛采用的TruSeq库预处理,具有较低的输入和提高的数据质量 | 优越的基因组覆盖率,从根本上减少了文库偏差和空白 |
工作流 | LT套件:手动工作流程 HT套件:自动化友好型;也可以使用手动协议 |
LT套件:手动工作流程 HT套件:自动化友好型;也可以使用手动协议 |
输入数量 | 100 - 200 ng |
1 - 2μg |
包括聚合酶链反应 | 是的 | 没有 |
试验时间 | 5.5小时 | ~ 5小时 |
实践时间 | 4个小时 | ~ 4个小时 |
目标插入大小 | 350 bp或550 bp | 350 bp或550 bp |
Gel-free | 是的 | 是的 |
支持的样本数量 | 24 (LT)或96 (HT)样品 | 24 (LT)或96 (HT)样品 |
尺寸选择珠子 | 包括 | 包括 |
应用程序 | 全基因组测序应用,包括全基因组重测序,新创组装和宏基因组学研究 | |
样品多路复用 | 多达24个单一,96个组合(CD)对偶,24个唯一对偶和96个唯一对偶(UD)组合 | |
兼容的Illumina测序仪 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq, HiSeq, NovaSeq, HiSeq X, HiScanSQ和基因组分析系统 |
技术说明| PDF< 1 MB
技术说明| PDF4 MB
数据表| PDF11 MB